MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli S88 chromosome

Total Repeats: 514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011742	GAATT	2	10	15980	15989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011742	AATGT	2	10	18509	18518	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011742	GATGC	2	10	27241	27250	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011742	GATGC	2	10	37332	37341	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011742	TAGTG	2	10	79280	79289	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011742	CGCCA	2	10	81224	81233	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_011742	GTGTT	2	10	123884	123893	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011742	AATTG	2	10	128041	128050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011742	GTAAG	2	10	148790	148799	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011742	TCCTC	2	10	150510	150519	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_011742	AATTT	2	10	163113	163122	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011742	TATAT	2	10	163199	163208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011742	TACGT	2	10	188237	188246	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011742	TGGCC	2	10	189923	189932	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011742	GTCTG	2	10	197633	197642	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011742	TGCGC	2	10	220815	220824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011742	CGGTT	2	10	228275	228284	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011742	GGTGA	2	10	230581	230590	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011742	TTTTA	2	10	301168	301177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011742	ACCAT	2	10	301212	301221	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011742	ACATT	2	10	302780	302789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011742	GCAAT	2	10	303796	303805	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011742	TGTGT	2	10	311637	311646	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011742	TGTTA	2	10	312745	312754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011742	TTGAT	2	10	313635	313644	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011742	AGGGT	2	10	324888	324897	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011742	CAAAA	2	10	329462	329471	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011742	GGTTT	2	10	338983	338992	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011742	AGCGA	2	10	340478	340487	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011742	TTATT	2	10	389679	389688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011742	CTTCT	2	10	402960	402969	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011742	TGCAG	2	10	410915	410924	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011742	GTTTC	2	10	435738	435747	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011742	CTTTT	2	10	439213	439222	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011742	GAGTA	2	10	441786	441795	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011742	ATAAA	2	10	455341	455350	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011742	GAAGA	2	10	464943	464952	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011742	TGAGT	2	10	478715	478724	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011742	TTTTC	2	10	500544	500553	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011742	TCAGG	2	10	508304	508313	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011742	TATTT	2	10	537692	537701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011742	TGCAC	2	10	561108	561117	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011742	CAGTA	2	10	572926	572935	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011742	AAAGA	2	10	576864	576873	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011742	TAACT	2	10	580445	580454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011742	GTTCT	2	10	581278	581287	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011742	TTATT	2	10	582485	582494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011742	TTGAT	2	10	605862	605871	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011742	GATTT	2	10	609574	609583	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011742	AAAGG	2	10	612667	612676	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011742	GTCAG	2	10	633514	633523	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011742	GTTAA	2	10	653731	653740	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011742	TTTGT	2	10	657837	657846	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011742	TTGCG	2	10	658221	658230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011742	ATAGC	2	10	661625	661634	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011742	ATTTG	2	10	680434	680443	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011742	TCAAT	2	10	682741	682750	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011742	CGTAA	2	10	684537	684546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011742	GCATA	2	10	696732	696741	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011742	AGCAA	2	10	696839	696848	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011742	GTGTT	2	10	701787	701796	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011742	GTTGC	2	10	701941	701950	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011742	GTGTT	2	10	714029	714038	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011742	CAGGG	2	10	717474	717483	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011742	AAGCA	2	10	720946	720955	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011742	GGCGT	2	10	723822	723831	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011742	TCGCG	2	10	731836	731845	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011742	AGGCG	2	10	760439	760448	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011742	GTCGT	2	10	784185	784194	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011742	GATGC	2	10	809030	809039	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011742	ACATA	2	10	839003	839012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011742	AGCGC	2	10	842031	842040	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_011742	GATGC	2	10	844442	844451	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011742	ACAAA	2	10	851040	851049	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011742	AAAAC	2	10	851733	851742	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011742	TATAT	2	10	855775	855784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011742	CAGGG	2	10	879313	879322	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011742	AGTAA	2	10	891155	891164	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011742	TGTAA	2	10	935841	935850	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011742	GCAAC	2	10	964692	964701	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011742	TTCAC	2	10	978661	978670	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_011742	TTGTT	2	10	1004579	1004588	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011742	AGCGA	2	10	1005919	1005928	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011742	ATGAC	2	10	1007659	1007668	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011742	TTTTC	2	10	1015551	1015560	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011742	TTATT	2	10	1016361	1016370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011742	TTCTT	2	10	1018294	1018303	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011742	GTACA	2	10	1020831	1020840	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011742	TTTTA	2	10	1020986	1020995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011742	CTTAT	2	10	1031491	1031500	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011742	TAAAA	2	10	1042088	1042097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011742	GGAGG	2	10	1054928	1054937	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011742	AAGGA	2	10	1055014	1055023	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011742	AGCGT	2	10	1079099	1079108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011742	GTCAT	2	10	1106631	1106640	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011742	TAAAA	2	10	1107137	1107146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011742	TGCAG	2	10	1115334	1115343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011742	GTCGC	2	10	1130395	1130404	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_011742	GGGGA	2	10	1176484	1176493	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011742	CAGTG	2	10	1188144	1188153	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011742	TTGCA	2	10	1189339	1189348	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011742	CTTGG	2	10	1191185	1191194	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011742	CGATG	2	10	1200994	1201003	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011742	ATTAA	2	10	1231437	1231446	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011742	GCGAG	2	10	1232739	1232748	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011742	CGAAA	2	10	1235290	1235299	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_011742	AAGGA	2	10	1235848	1235857	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011742	ATTTT	2	10	1238754	1238763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011742	CTGGT	2	10	1238958	1238967	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_011742	GGGGT	2	10	1239284	1239293	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011742	TATAA	2	10	1242979	1242988	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011742	CCTTA	2	10	1249498	1249507	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011742	ATAAA	2	10	1266209	1266218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011742	GAAAA	2	10	1271601	1271610	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011742	CTTCA	2	10	1286822	1286831	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011742	TTATC	2	10	1294140	1294149	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011742	ACCGT	2	10	1305592	1305601	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_011742	TGGGG	2	10	1336209	1336218	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011742	GTTTT	2	10	1342361	1342370	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011742	CAGTA	2	10	1345097	1345106	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011742	TTATT	2	10	1352762	1352771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011742	CGTTG	2	10	1379003	1379012	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011742	GCCAG	2	10	1389662	1389671	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_011742	TTTGC	2	10	1398641	1398650	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011742	TTTAT	2	10	1431485	1431494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011742	CAGGA	2	10	1434531	1434540	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011742	TGAAG	2	10	1436363	1436372	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011742	TGGCC	2	10	1445313	1445322	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_011742	AGTAC	2	10	1452125	1452134	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011742	TTAAT	2	10	1454840	1454849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011742	AATAA	2	10	1471648	1471657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011742	ATCTA	2	10	1471783	1471792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011742	GTAAT	2	10	1473028	1473037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011742	TTATT	2	10	1475168	1475177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011742	ATTTT	2	10	1475402	1475411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011742	CATTG	2	10	1475421	1475430	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011742	CAGGG	2	10	1493360	1493369	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011742	ACGTA	2	10	1507722	1507731	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011742	TGCAT	2	10	1522711	1522720	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011742	TTTAA	2	10	1524505	1524514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011742	ACGGC	2	10	1524699	1524708	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011742	GTGAT	2	10	1526886	1526895	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011742	AAGCG	2	10	1545664	1545673	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011742	GTCCA	2	10	1564844	1564853	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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