MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli IAI1 chromosome

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011741	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011741	TTTCAC	2	12	19598	19609	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011741	AAGGGA	2	12	84738	84749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011741	TCTCCC	2	12	164787	164798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011741	TCACCC	2	12	164838	164849	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011741	GTAGTG	2	12	199787	199798	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011741	GTAAAA	2	12	270114	270125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011741	GTGCAG	2	12	300819	300830	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011741	TAAGGG	2	12	315167	315178	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011741	TGTGGA	2	12	316314	316325	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011741	TTTTCT	2	12	326016	326027	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011741	CTATTT	2	12	327052	327063	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011741	TTTATT	2	12	358709	358720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011741	TATTGA	2	12	397610	397621	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011741	AACAAT	2	12	419917	419928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011741	TATTGA	2	12	422817	422828	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011741	TTTTCA	2	12	487236	487247	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011741	CAGGCG	2	12	506078	506089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011741	TGCAAA	2	12	615486	615497	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011741	ATTTTT	2	12	711535	711546	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011741	TTTACC	2	12	722446	722457	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011741	TTTTCT	2	12	794844	794855	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011741	TCTGCT	2	12	813104	813115	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011741	GCTATT	2	12	815759	815770	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011741	TATTGC	2	12	815786	815797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011741	CAGGAG	2	12	824694	824705	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011741	TGTAAC	2	12	854325	854336	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011741	CAGAAA	2	12	883875	883886	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011741	TAACCG	2	12	974937	974948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011741	AAATAA	2	12	1006877	1006888	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011741	AAAGAT	2	12	1039407	1039418	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011741	TGTCCA	2	12	1060206	1060217	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011741	ATAATG	2	12	1083899	1083910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011741	AATGAT	2	12	1115872	1115883	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011741	GATGGC	2	12	1116259	1116270	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011741	CAAAAA	2	12	1163042	1163053	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_011741	TCTTTA	2	12	1238527	1238538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011741	TTTTGT	2	12	1246192	1246203	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011741	ACGCTT	2	12	1266830	1266841	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011741	ACTCGA	2	12	1266850	1266861	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011741	CAGGCT	2	12	1266982	1266993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011741	CTTATT	2	12	1317603	1317614	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011741	CAAAAG	2	12	1323499	1323510	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011741	CTGATC	2	12	1333977	1333988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011741	CTATAA	2	12	1378206	1378217	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011741	ATTAAT	2	12	1517705	1517716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011741	GTAAAA	2	12	1527343	1527354	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011741	AAAAAC	2	12	1555960	1555971	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011741	ACCGTT	2	12	1577593	1577604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011741	TGGTTA	2	12	1586423	1586434	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011741	TTTCTG	2	12	1626940	1626951	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011741	CAAAAA	2	12	1646105	1646116	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011741	TTAAAT	2	12	1647904	1647915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011741	TTTTTC	2	12	1649626	1649637	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011741	CAGGTG	2	12	1660611	1660622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011741	AAAAAC	2	12	1683047	1683058	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_011741	GATAAA	2	12	1686216	1686227	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011741	ATACTT	2	12	1785171	1785182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011741	AAAATA	2	12	1798828	1798839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011741	TGTTTT	2	12	1799461	1799472	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011741	AAGACT	2	12	1799721	1799732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011741	GAACAG	2	12	1847502	1847513	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011741	TATTAC	2	12	1915725	1915736	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011741	TTTCTT	2	12	1935713	1935724	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011741	ATAACC	2	12	1939657	1939668	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011741	ACTGTC	2	12	1983268	1983279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011741	CATTAA	2	12	1994995	1995006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011741	TTAATG	2	12	2042651	2042662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011741	AATTCA	2	12	2049776	2049787	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011741	TCTTAT	2	12	2063589	2063600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_011741	ATATTT	2	12	2095565	2095576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011741	TTTTGT	2	12	2184083	2184094	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011741	TCCCCC	2	12	2213675	2213686	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
74	NC_011741	CCTTAC	2	12	2264008	2264019	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011741	CCTTAC	2	12	2264616	2264627	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011741	ACGCAG	2	12	2294495	2294506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011741	TCTTCC	2	12	2324161	2324172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011741	CCACTA	2	12	2400629	2400640	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011741	TAAATG	2	12	2449422	2449433	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011741	TGTCAC	2	12	2463055	2463066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011741	AGAAAA	2	12	2473347	2473358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011741	GTTAAC	2	12	2513059	2513070	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011741	GTTAAC	2	12	2513123	2513134	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011741	CTGATG	2	12	2531910	2531921	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011741	GTTATG	2	12	2549752	2549763	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011741	CAAGTG	2	12	2562871	2562882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011741	GCCATT	2	12	2638775	2638786	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011741	TCCTTC	2	12	2663474	2663485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011741	TGCCGC	2	12	2696655	2696666	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011741	GCTACC	2	12	2696676	2696687	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011741	ATTATG	2	12	2724927	2724938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011741	CAGTTT	2	12	2769922	2769933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011741	ATTTTT	2	12	2831180	2831191	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011741	AGGGAG	2	12	2839034	2839045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011741	ACAAGA	2	12	2973659	2973670	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011741	TTTGTT	2	12	2998595	2998606	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011741	AATTTT	2	12	3046379	3046390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011741	ATCGCG	2	12	3099229	3099240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011741	GTAAGG	2	12	3114922	3114933	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011741	GTAAGG	2	12	3115314	3115325	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011741	ACTGAG	2	12	3143439	3143450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011741	TTTTCG	2	12	3205963	3205974	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_011741	ATTTAA	2	12	3219164	3219175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011741	TTATAT	2	12	3268216	3268227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011741	CACCCC	2	12	3284710	3284721	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
106	NC_011741	AGTTGT	2	12	3292498	3292509	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011741	CTTTTT	2	12	3297174	3297185	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011741	AATGAT	2	12	3298009	3298020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011741	TCTCCC	2	12	3320619	3320630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_011741	GTAACC	2	12	3352523	3352534	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011741	AGACAA	2	12	3354143	3354154	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011741	TGCATT	2	12	3363175	3363186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_011741	TTTTAT	2	12	3365072	3365083	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011741	ATATAA	2	12	3375839	3375850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011741	AGCGTT	2	12	3499578	3499589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_011741	AATTTA	2	12	3613020	3613031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011741	AGATGC	2	12	3718523	3718534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_011741	TGAAAA	2	12	3733395	3733406	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011741	AGGGAG	2	12	3740138	3740149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011741	ACTTCA	2	12	3781634	3781645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011741	ACTCTT	2	12	3791470	3791481	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011741	CCGTTA	2	12	3832791	3832802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011741	CATCAC	2	12	3832878	3832889	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011741	ATGACC	2	12	3833375	3833386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011741	TACAGC	2	12	3834348	3834359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011741	TTTATC	2	12	3844424	3844435	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011741	CTTTTT	2	12	4017757	4017768	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011741	AGGGAG	2	12	4035842	4035853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011741	GCGTAA	2	12	4140159	4140170	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_011741	GGGAGT	2	12	4167198	4167209	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011741	GGGTGA	2	12	4175753	4175764	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011741	ATAAAA	2	12	4182650	4182661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011741	CCGTTA	2	12	4209560	4209571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011741	CATCAC	2	12	4209647	4209658	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011741	ATGACC	2	12	4210144	4210155	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011741	TACAGC	2	12	4211117	4211128	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011741	ATGATA	2	12	4212378	4212389	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011741	TTTTCT	2	12	4218935	4218946	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_011741	ATTTTT	2	12	4244794	4244805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011741	TTCTTT	2	12	4310294	4310305	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_011741	TCATTT	2	12	4311864	4311875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_011741	CTTTTA	2	12	4326943	4326954	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_011741	GTCTTT	2	12	4369075	4369086	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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145	NC_011741	TCTCCC	2	12	4407156	4407167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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149	NC_011741	TTTAAT	2	12	4508929	4508940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011741	AATATT	2	12	4512005	4512016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_011741	TAAAAT	2	12	4561145	4561156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011741	AATAAA	2	12	4563854	4563865	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011741	AATTTA	2	12	4577235	4577246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011741	AACGGA	2	12	4580502	4580513	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_011741	ATAAAT	2	12	4586163	4586174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011741	GCTCTT	2	12	4590857	4590868	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_011741	TACAGC	2	12	4596535	4596546	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_011741	AACAGG	2	12	4604931	4604942	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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161	NC_011741	AGTAAA	2	12	4688302	4688313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.