MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli IAI1 chromosome

Total Repeats: 12012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011741	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011741	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011741	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011741	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011741	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011741	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011741	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011741	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011741	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011741	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011741	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011741	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011741	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011741	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011741	A	7	7	6495	6501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011741	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011741	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011741	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011741	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011741	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011741	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011741	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011741	C	6	6	9899	9904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_011741	G	6	6	9909	9914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011741	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011741	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011741	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011741	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011741	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011741	CTG	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011741	AGA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011741	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011741	TTA	2	6	11877	11882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011741	T	6	6	11886	11891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011741	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011741	A	6	6	11991	11996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011741	TGA	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011741	TAG	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011741	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011741	A	7	7	12068	12074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011741	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011741	AT	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011741	A	6	6	14160	14165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011741	CCG	2	6	15389	15394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011741	CGC	2	6	15703	15708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011741	TAT	2	6	15709	15714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011741	CT	3	6	15719	15724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011741	T	6	6	15785	15790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011741	ATT	2	6	15800	15805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011741	ATT	2	6	15832	15837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011741	GAC	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011741	ATT	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011741	ATTA	2	8	15898	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011741	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011741	A	6	6	16040	16045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011741	GAT	2	6	16079	16084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011741	GA	3	6	17358	17363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011741	C	6	6	18280	18285	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_011741	TTTCAC	2	12	19598	19609	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011741	TAT	2	6	19650	19655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011741	AAC	2	6	19665	19670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011741	TGTT	2	8	19682	19689	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011741	ACC	2	6	19782	19787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011741	ACT	2	6	19806	19811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011741	CCA	2	6	19819	19824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011741	TAT	2	6	19863	19868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011741	ATT	2	6	19914	19919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011741	TTG	3	9	19920	19928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011741	AT	3	6	19938	19943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011741	TTG	2	6	19993	19998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011741	ATC	2	6	20067	20072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011741	C	6	6	20072	20077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_011741	CTC	2	6	20112	20117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011741	TAT	2	6	20123	20128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011741	TCA	2	6	20131	20136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011741	TGGC	2	8	20143	20150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011741	TAT	2	6	20459	20464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011741	ATT	2	6	20502	20507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011741	TAC	2	6	20513	20518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011741	GTT	2	6	20628	20633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011741	ATT	2	6	20634	20639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011741	T	6	6	20656	20661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011741	TGA	2	6	20680	20685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011741	ATT	2	6	20702	20707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011741	CTT	2	6	20710	20715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011741	AAG	2	6	20719	20724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011741	ATT	2	6	20736	20741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011741	GA	3	6	20747	20752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011741	ATT	2	6	20779	20784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011741	T	6	6	20783	20788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011741	TAA	2	6	20806	20811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011741	TCA	2	6	20812	20817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011741	CTT	2	6	20841	20846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011741	T	6	6	20845	20850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011741	TGA	2	6	22297	22302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011741	TTAAT	2	10	22310	22319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011741	ACT	2	6	22335	22340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011741	TTG	2	6	22402	22407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011741	ATT	2	6	22411	22416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011741	TAA	2	6	22426	22431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011741	GT	3	6	22677	22682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011741	TC	3	6	22683	22688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011741	CAT	2	6	22692	22697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011741	AGC	2	6	22701	22706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011741	A	7	7	22713	22719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011741	CTT	2	6	23091	23096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011741	TGC	2	6	27679	27684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011741	AGC	2	6	29146	29151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011741	T	6	6	29188	29193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011741	TCAT	2	8	30145	30152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011741	TCCC	2	8	30175	30182	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_011741	TGGC	2	8	30216	30223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011741	ATTTA	2	10	31142	31151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011741	TGT	2	6	31252	31257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011741	TCT	2	6	31317	31322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011741	TGC	2	6	31323	31328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011741	CATG	2	8	31385	31392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011741	ATA	2	6	31402	31407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011741	A	6	6	31409	31414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011741	GCC	2	6	31457	31462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011741	TCG	2	6	31476	31481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011741	TCA	2	6	31507	31512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011741	AGTG	2	8	31535	31542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011741	TGT	2	6	36649	36654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011741	GAC	2	6	38102	38107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011741	A	6	6	38119	38124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011741	ATT	2	6	38146	38151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011741	CTG	2	6	38170	38175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011741	GGGC	2	8	39769	39776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011741	GCG	2	6	41069	41074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011741	ATTT	2	8	43869	43876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011741	GTTT	2	8	43886	43893	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011741	ATT	3	9	43917	43925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011741	ATT	2	6	44042	44047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011741	TGT	2	6	44061	44066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011741	A	7	7	44076	44082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011741	T	6	6	44134	44139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011741	ACC	2	6	44271	44276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011741	ACG	2	6	44284	44289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011741	CGC	2	6	47682	47687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_011741	A	6	6	47703	47708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011741	TC	3	6	49065	49070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011741	ATT	2	6	49085	49090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011741	AT	3	6	49108	49113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011741	TGTT	2	8	51580	51587	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011741	GCG	2	6	51604	51609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011741	GA	3	6	51618	51623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011741	CAG	2	6	51636	51641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_011741	CGA	2	6	51679	51684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_011741	GTG	2	6	59132	59137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_011741	TTG	2	6	141563	141568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_011741	TCCTC	2	10	144675	144684	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
288	NC_011741	GAG	2	6	144698	144703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_011741	AGG	2	6	144760	144765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011741	GTT	2	6	145250	145255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011741	T	6	6	145269	145274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011741	TGA	2	6	146972	146977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_011741	ACA	2	6	147142	147147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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313	NC_011741	AAAT	2	8	157331	157338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_011741	GTT	2	6	167593	167598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_011741	GAC	2	6	222822	222827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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418	NC_011741	CGGTT	2	10	222884	222893	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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420	NC_011741	GGC	2	6	223167	223172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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428	NC_011741	GGA	2	6	223575	223580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
429	NC_011741	AGA	2	6	223622	223627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_011741	GGA	2	6	223839	223844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_011741	GGT	2	6	224789	224794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
451	NC_011741	AGG	2	6	224899	224904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
452	NC_011741	CCA	2	6	224929	224934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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455	NC_011741	AAC	2	6	225040	225045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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460	NC_011741	GCG	2	6	225362	225367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_011741	G	6	6	225523	225528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
464	NC_011741	TCC	2	6	225533	225538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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470	NC_011741	AAC	2	6	226097	226102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_011741	AGC	2	6	226187	226192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
472	NC_011741	CAT	2	6	226193	226198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_011741	CCTG	2	8	228314	228321	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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