MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia fergusonii ATCC 35469 chromosome

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011740	ATTTTA	2	12	10483	10494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011740	TTGTTT	2	12	58841	58852	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011740	GTTGCC	2	12	94041	94052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011740	ACCTAA	2	12	94127	94138	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011740	TTTATT	2	12	156092	156103	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011740	ATTGTT	2	12	169582	169593	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011740	GATCTC	2	12	280313	280324	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011740	TAAAAG	2	12	280379	280390	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011740	TTAATT	2	12	293676	293687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011740	ATCATT	2	12	310960	310971	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011740	CTTTTA	2	12	312604	312615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011740	TGTAAA	2	12	312653	312664	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011740	ATATCA	2	12	392232	392243	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011740	AGATTG	2	12	436633	436644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011740	ACGCAG	2	12	471213	471224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011740	CGCTGG	2	12	496997	497008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011740	AAACTG	2	12	507409	507420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011740	TGTCCA	2	12	522011	522022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011740	GCCTGC	2	12	584082	584093	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011740	GCCTGC	2	12	584106	584117	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011740	CTGGGG	2	12	604722	604733	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011740	ATATCA	2	12	628732	628743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011740	AATCAA	2	12	782186	782197	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011740	CATAAA	2	12	813091	813102	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011740	TTTTCT	2	12	867166	867177	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011740	ACTGCA	2	12	963165	963176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011740	TTTAAA	2	12	984794	984805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011740	TATGTT	2	12	999598	999609	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011740	CAGTCG	2	12	1167342	1167353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011740	AATTTA	2	12	1195999	1196010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011740	GATTAA	2	12	1196158	1196169	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011740	AAAGAA	2	12	1310698	1310709	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011740	CATTTT	2	12	1396237	1396248	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011740	AGTCTT	2	12	1413809	1413820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011740	ATTATG	2	12	1480834	1480845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011740	ACAAAA	2	12	1533626	1533637	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_011740	TACCTT	2	12	1534965	1534976	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011740	ATGCAA	2	12	1574808	1574819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011740	GTCTTA	2	12	1600772	1600783	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011740	TAAATG	2	12	1601582	1601593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011740	GTTCAA	2	12	1601773	1601784	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011740	AAATCA	2	12	1810565	1810576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011740	CAAAAA	2	12	1838593	1838604	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011740	TAATCT	2	12	1951409	1951420	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011740	TATCCA	2	12	2005365	2005376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011740	AAATAA	2	12	2007108	2007119	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011740	AGGTTT	4	24	2008388	2008411	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011740	GCACAT	2	12	2028536	2028547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011740	TTTTGT	2	12	2164135	2164146	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011740	AAAATA	2	12	2236679	2236690	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011740	CCTTAC	2	12	2258197	2258208	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011740	CCTTAC	2	12	2258805	2258816	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011740	ACGCAG	2	12	2286776	2286787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011740	TTGATT	2	12	2339290	2339301	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011740	TTTCTG	2	12	2369207	2369218	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011740	AATTGA	2	12	2416433	2416444	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011740	TATTTT	2	12	2495242	2495253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011740	CGGCTC	2	12	2522208	2522219	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011740	CGATAA	2	12	2566952	2566963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011740	ATTTGC	2	12	2576573	2576584	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011740	TCACCA	2	12	2591885	2591896	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011740	CAATGA	2	12	2607537	2607548	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011740	CGCCTG	2	12	2613319	2613330	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011740	TAAGAT	2	12	2705922	2705933	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011740	ATAAAA	2	12	2727240	2727251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011740	CTCCTG	2	12	2779977	2779988	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011740	TAGCAA	2	12	2789543	2789554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011740	AATAGC	2	12	2789572	2789583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011740	ACTGCG	2	12	2805613	2805624	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011740	GTAAGG	2	12	2915618	2915629	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011740	CTTTTT	2	12	2949503	2949514	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011740	AAAATA	2	12	3048158	3048169	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011740	CAGATG	2	12	3053248	3053259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011740	ATCTAC	2	12	3091272	3091283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011740	AATGAT	2	12	3092755	3092766	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011740	ACGCAG	2	12	3104478	3104489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011740	ATATTT	2	12	3134963	3134974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011740	TTTGCC	2	12	3204772	3204783	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011740	GCGTAC	2	12	3386836	3386847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011740	AATTTA	2	12	3441597	3441608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011740	AGAAAT	2	12	3516978	3516989	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011740	GCCAGC	2	12	3623227	3623238	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011740	ACTCTT	2	12	3641773	3641784	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011740	ATATTA	2	12	3699415	3699426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011740	ATTTCC	2	12	3701924	3701935	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011740	ATAAAT	2	12	3797551	3797562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011740	GAATAT	2	12	3951102	3951113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011740	CAGAAT	2	12	3983268	3983279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_011740	ACTCCC	2	12	3984251	3984262	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_011740	ACAGTT	2	12	3990536	3990547	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011740	GACAAC	2	12	4063903	4063914	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011740	CTTAAT	2	12	4148017	4148028	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011740	ATCCAT	2	12	4160135	4160146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011740	TCATTT	2	12	4175376	4175387	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_011740	GTGAAG	2	12	4209412	4209423	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011740	TAACCA	2	12	4216760	4216771	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011740	CGGCAG	2	12	4250141	4250152	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011740	GTCTTT	2	12	4267938	4267949	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011740	ATTTTA	2	12	4268039	4268050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011740	ACTCTT	2	12	4268077	4268088	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011740	ATATTT	2	12	4289411	4289422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011740	CAGGCT	2	12	4326083	4326094	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011740	TTTTTA	2	12	4326229	4326240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011740	TTTAAT	2	12	4358354	4358365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011740	TGTTTC	2	12	4370690	4370701	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011740	TCGCTT	2	12	4465460	4465471	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011740	ATAAAA	2	12	4470859	4470870	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011740	AATGCA	2	12	4472755	4472766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_011740	TAATTA	2	12	4474694	4474705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011740	AATGAT	2	12	4508177	4508188	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011740	TTATCA	2	12	4508270	4508281	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011740	TTCCTT	2	12	4528222	4528233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011740	CTGTCA	2	12	4531448	4531459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011740	AGTAAA	2	12	4577688	4577699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.