MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	TACT	2	8	1285	1292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011603	CTTC	2	8	1377	1384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011603	TCAC	2	8	1504	1511	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011603	GCAC	2	8	2245	2252	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011603	CAAA	2	8	14011	14018	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011603	ATTG	2	8	14711	14718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011603	CAGA	2	8	14756	14763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011603	AGAC	2	8	14883	14890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011603	GCAG	2	8	14944	14951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011603	CTGA	2	8	16664	16671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011603	AAAC	2	8	17151	17158	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011603	ATAC	2	8	18457	18464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011603	GCCA	2	8	19087	19094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011603	GCCA	2	8	19178	19185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011603	TTCT	2	8	19198	19205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011603	ACTG	2	8	19710	19717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011603	AAAG	2	8	20340	20347	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011603	ATTT	2	8	20798	20805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011603	GATC	2	8	21521	21528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011603	GGCT	2	8	21641	21648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011603	CTGG	2	8	22842	22849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011603	GAAG	2	8	23364	23371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011603	ACAT	2	8	23401	23408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011603	GTGC	2	8	23805	23812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011603	ATCA	2	8	23985	23992	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011603	GCAC	2	8	24222	24229	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011603	TAGT	2	8	25708	25715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011603	AAAG	2	8	26247	26254	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011603	CTCA	2	8	26418	26425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011603	GATG	2	8	26816	26823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011603	GTCT	2	8	27072	27079	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011603	TTTG	2	8	27207	27214	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011603	GGCT	2	8	27269	27276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011603	CCAG	2	8	27356	27363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011603	CTGA	2	8	27570	27577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011603	GCCA	2	8	27617	27624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011603	TCGC	2	8	28386	28393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011603	GCTG	2	8	28922	28929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011603	TTAT	2	8	29594	29601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011603	TGAT	2	8	30346	30353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011603	CCAG	2	8	30522	30529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011603	TCTG	2	8	30748	30755	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011603	AATG	2	8	30790	30797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011603	AGAA	2	8	32004	32011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011603	GCCA	2	8	32196	32203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011603	CGGG	2	8	32717	32724	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011603	CCCG	2	8	32798	32805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_011603	TGTC	2	8	33023	33030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011603	TCCT	2	8	33067	33074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011603	ATTT	2	8	45175	45182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011603	ATTT	2	8	45206	45213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011603	TTTC	2	8	45216	45223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011603	GTCA	2	8	45252	45259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011603	GATA	2	8	66655	66662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011603	TAAT	2	8	67777	67784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011603	AAAT	2	8	68500	68507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011603	TCAG	2	8	70594	70601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011603	GCCC	2	8	71131	71138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_011603	AGGA	2	8	73019	73026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011603	GACA	2	8	73063	73070	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011603	ACTG	2	8	73515	73522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011603	TGAC	2	8	75387	75394	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011603	AAAT	2	8	75400	75407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011603	AAAT	2	8	75426	75433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011603	CCGT	2	8	76850	76857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011603	AGGT	2	8	77823	77830	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011603	AGAA	2	8	77886	77893	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011603	ATGT	2	8	78010	78017	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011603	GCCC	2	8	78215	78222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_011603	CAGC	2	8	78466	78473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011603	TCTG	2	8	80973	80980	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011603	GCAG	2	8	82128	82135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011603	GAAA	2	8	82431	82438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011603	ATTA	2	8	82744	82751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011603	TTTG	2	8	82796	82803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011603	AAAT	2	8	82845	82852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011603	AATG	2	8	83386	83393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011603	TTCT	2	8	86973	86980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011603	TTCT	2	8	87062	87069	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011603	GCTG	2	8	87980	87987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011603	TTAT	2	8	92307	92314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011603	AAAC	2	8	92363	92370	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011603	TGAC	2	8	92597	92604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011603	AGAA	2	8	95624	95631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011603	GACT	2	8	96356	96363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011603	CAGC	2	8	96450	96457	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011603	GAAG	2	8	97788	97795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011603	CATT	2	8	97878	97885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.