MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 chromosome

Total Repeats: 2018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011601	CTGC	2	8	12	19	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011601	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011601	GGCG	2	8	7983	7990	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011601	CTGT	2	8	9136	9143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011601	TGTC	2	8	9847	9854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011601	TCCT	2	8	9891	9898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011601	GAAT	2	8	11970	11977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011601	ATTC	2	8	13361	13368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011601	AGTG	2	8	13503	13510	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011601	GACA	2	8	17134	17141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011601	ATTT	2	8	17251	17258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011601	ATTA	2	8	17328	17335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011601	AATG	2	8	17598	17605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011601	TCCC	2	8	31175	31182	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_011601	TGGC	2	8	31216	31223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011601	CATG	2	8	32385	32392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011601	AGTG	2	8	32535	32542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011601	CCAG	2	8	37683	37690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011601	GGGC	2	8	40801	40808	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011601	TGAC	2	8	40824	40831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011601	ATTT	2	8	44890	44897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011601	GTTT	2	8	44907	44914	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011601	TGTT	2	8	52542	52549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011601	TCCA	2	8	71934	71941	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011601	AAGA	2	8	73111	73118	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011601	TTAT	2	8	73150	73157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011601	TAAT	2	8	73170	73177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011601	ATTA	2	8	73201	73208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011601	TGTT	2	8	73244	73251	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011601	ATTA	2	8	90194	90201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011601	ATTA	2	8	91528	91535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011601	AGGC	2	8	91738	91745	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011601	CCCG	2	8	95271	95278	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_011601	TTAA	2	8	95279	95286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011601	AACA	2	8	95375	95382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011601	TTGG	2	8	123565	123572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011601	CCGC	2	8	123717	123724	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_011601	TCAA	2	8	127982	127989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011601	GATA	2	8	128997	129004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011601	CGGC	2	8	133605	133612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011601	GCGA	2	8	142841	142848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011601	AATT	2	8	146990	146997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011601	GAAT	2	8	147055	147062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011601	GGTA	2	8	155518	155525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011601	ATTT	2	8	156211	156218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011601	AAAG	2	8	156492	156499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011601	GTTA	2	8	157452	157459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011601	GTAT	2	8	158200	158207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011601	CCTT	2	8	158248	158255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011601	TGAT	2	8	158333	158340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011601	AATT	2	8	162036	162043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011601	CATT	2	8	162841	162848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011601	TTAC	2	8	166594	166601	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011601	TATT	2	8	173050	173057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011601	TTAT	2	8	173919	173926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011601	GTTT	2	8	173943	173950	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011601	TATC	2	8	174017	174024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011601	GTAA	2	8	174099	174106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011601	GGAT	2	8	194977	194984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011601	GAGC	2	8	200699	200706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011601	GAAA	2	8	201852	201859	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011601	ATAA	2	8	202599	202606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011601	AGTT	2	8	207906	207913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011601	AAGG	2	8	219654	219661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011601	CGAG	2	8	221839	221846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011601	GGCT	2	8	226124	226131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011601	ATCA	2	8	232701	232708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011601	CCGG	2	8	234861	234868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011601	GTAG	2	8	235160	235167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011601	TAAA	2	8	235544	235551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011601	CTGA	2	8	236149	236156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011601	GTAC	2	8	236233	236240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011601	CGTC	2	8	236673	236680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011601	AAAG	2	8	236796	236803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011601	GCTG	2	8	237474	237481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011601	CCTG	2	8	238915	238922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011601	CCGT	2	8	238950	238957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011601	ATTT	2	8	240877	240884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011601	CCTG	2	8	247139	247146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011601	CCGT	2	8	247174	247181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011601	AATC	2	8	252144	252151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011601	ATTT	2	8	253859	253866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011601	TTCA	2	8	253959	253966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011601	CCAC	2	8	255296	255303	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_011601	TCAA	2	8	255518	255525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011601	CGAA	2	8	255847	255854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011601	TCAG	2	8	255982	255989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011601	CTGG	2	8	256368	256375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011601	CGCC	2	8	259589	259596	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_011601	AGTA	2	8	263807	263814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011601	CGTT	2	8	266872	266879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011601	CCAG	2	8	269682	269689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011601	TGCC	2	8	269733	269740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011601	TCTG	2	8	271173	271180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011601	TGCT	2	8	272726	272733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011601	CCTT	2	8	272839	272846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011601	CGTG	2	8	272902	272909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011601	CGCA	2	8	273067	273074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011601	GATG	2	8	273092	273099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011601	AACT	2	8	281166	281173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011601	TGAT	2	8	283379	283386	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011601	TGAT	2	8	283464	283471	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011601	TTAC	2	8	283511	283518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011601	AAAT	2	8	283593	283600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011601	ATAC	2	8	284013	284020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011601	TGAA	2	8	289583	289590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011601	ATTA	2	8	290699	290706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011601	ATAA	2	8	290820	290827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011601	TACC	2	8	295336	295343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011601	ATTA	2	8	299978	299985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011601	TAAA	2	8	301020	301027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011601	TAAA	2	8	301051	301058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011601	GAAA	2	8	301238	301245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011601	TATT	2	8	304619	304626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011601	TGCC	2	8	304760	304767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011601	TTCA	2	8	304999	305006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011601	ATTG	2	8	309023	309030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011601	ATTG	2	8	311461	311468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011601	CTAT	2	8	311508	311515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011601	GAGC	2	8	311862	311869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011601	TTCA	2	8	322307	322314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011601	TGGT	2	8	323229	323236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011601	GTTA	2	8	323625	323632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011601	CTGA	2	8	325111	325118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011601	GTGG	2	8	325144	325151	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011601	TTTA	2	8	327274	327281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011601	GTTG	2	8	328285	328292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011601	TCAT	2	8	333157	333164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011601	ATTG	2	8	336587	336594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011601	TGAG	2	8	341065	341072	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011601	TGCA	2	8	345409	345416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011601	TGTT	2	8	345545	345552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011601	TTTA	2	8	350295	350302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011601	TTTC	2	8	350475	350482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011601	CTAC	2	8	350911	350918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011601	CGAT	2	8	351082	351089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011601	GGTT	2	8	351381	351388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011601	TGAT	2	8	351914	351921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011601	ACTG	2	8	352047	352054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011601	ATGA	2	8	352948	352955	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011601	TGAA	2	8	355453	355460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011601	GCTG	2	8	357733	357740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011601	CAAA	2	8	360424	360431	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011601	AAGT	2	8	366511	366518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011601	CAGC	2	8	367272	367279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011601	TATT	2	8	376162	376169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011601	AGCC	2	8	378256	378263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011601	TGGT	2	8	378315	378322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011601	TGGT	2	8	378378	378385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011601	ACTG	2	8	378476	378483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011601	TCAC	2	8	384002	384009	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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