MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE11 chromosome

Total Repeats: 11029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011415	T	8	8	239036	239043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011415	TTC	2	6	239062	239067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_011415	AT	3	6	239161	239166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011415	TA	4	8	239209	239216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011415	TGTT	2	8	239227	239234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011415	TA	3	6	239250	239255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011415	GCC	2	6	240112	240117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_011415	GGC	2	6	240128	240133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_011415	AAT	2	6	240134	240139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011415	TGTT	2	8	240215	240222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011415	ATT	2	6	240235	240240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011415	CTG	2	6	240244	240249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_011415	AT	3	6	240267	240272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011415	ATT	2	6	240275	240280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011415	TAT	2	6	240328	240333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011415	T	7	7	240469	240475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011415	TAT	2	6	240491	240496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011415	GTAA	2	8	240498	240505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011415	TAT	2	6	240596	240601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011415	A	6	6	240626	240631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011415	AAG	2	6	240634	240639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011415	ATA	2	6	240658	240663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011415	A	6	6	240671	240676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011415	GAAA	2	8	240681	240688	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011415	TTTAA	2	10	240693	240702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011415	TC	3	6	241644	241649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_011415	TAT	2	6	241663	241668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011415	TTA	2	6	241670	241675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011415	GTG	2	6	261248	261253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011415	ATCG	2	8	261917	261924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_011415	TG	3	6	261958	261963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011415	TAT	2	6	261988	261993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011415	AAT	2	6	261997	262002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011415	AAT	2	6	262041	262046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011415	TGA	2	6	262068	262073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011415	TA	3	6	262083	262088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011415	TTTGT	2	10	262089	262098	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011415	GATT	2	8	262099	262106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011415	TGTA	2	8	262333	262340	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011415	A	6	6	262340	262345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011415	ATG	2	6	262355	262360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011415	AGT	2	6	262417	262422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011415	AAAG	2	8	263028	263035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011415	CGG	2	6	263086	263091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_011415	ACTGT	2	10	263117	263126	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
546	NC_011415	CTGT	2	8	263148	263155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_011415	A	6	6	265331	265336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011415	AAC	2	6	270101	270106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011415	ATAC	2	8	270129	270136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_011415	GGGCA	2	10	270161	270170	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
551	NC_011415	A	6	6	270265	270270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011415	A	6	6	271050	271055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011415	ATA	2	6	271270	271275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011415	AGA	2	6	271286	271291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011415	TTA	2	6	271303	271308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011415	AGAA	2	8	271343	271350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011415	ATC	2	6	271374	271379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011415	AAT	2	6	271401	271406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011415	T	6	6	271455	271460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011415	ATAA	2	8	271491	271498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011415	A	6	6	271517	271522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011415	TAT	2	6	271540	271545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011415	TAA	2	6	273603	273608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011415	TGA	2	6	276610	276615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011415	ACA	2	6	276667	276672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_011415	TTG	2	6	276682	276687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011415	CGC	2	6	277417	277422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_011415	GATGC	2	10	277448	277457	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
569	NC_011415	AAT	2	6	277505	277510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011415	CGC	2	6	277518	277523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_011415	AATC	2	8	277544	277551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_011415	TGT	2	6	277577	277582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011415	AC	3	6	279099	279104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_011415	TATT	2	8	279791	279798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011415	TAA	2	6	279849	279854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011415	AT	3	6	279882	279887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011415	TTA	2	6	279888	279893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011415	TAA	2	6	279900	279905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011415	TTA	2	6	279910	279915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011415	ATT	2	6	279969	279974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011415	TGC	2	6	281488	281493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_011415	AGG	2	6	285627	285632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011415	T	7	7	285690	285696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011415	T	6	6	285727	285732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011415	AAT	2	6	285746	285751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011415	GCA	2	6	287598	287603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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588	NC_011415	GTT	2	6	289818	289823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011415	AGTA	2	8	289857	289864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011415	CG	3	6	292702	292707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_011415	AT	3	6	292768	292773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011415	TAA	2	6	292781	292786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011415	TTA	2	6	292807	292812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011415	TAA	2	6	292819	292824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011415	AAC	2	6	292832	292837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011415	CAA	2	6	292863	292868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011415	CGA	2	6	292902	292907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_011415	CGTT	2	8	292922	292929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_011415	AGC	2	6	295472	295477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011415	TAT	2	6	295512	295517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011415	TATCT	2	10	295590	295599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
602	NC_011415	GTT	2	6	296883	296888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011415	T	7	7	296926	296932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011415	TAC	2	6	296996	297001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_011415	C	6	6	297011	297016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
606	NC_011415	TCA	2	6	297052	297057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_011415	CTC	2	6	297143	297148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_011415	TACT	2	8	297204	297211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_011415	TG	3	6	297262	297267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011415	ACC	2	6	297274	297279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_011415	TTG	2	6	297297	297302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011415	CGC	2	6	298771	298776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_011415	AAT	2	6	298837	298842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011415	TGT	2	6	298896	298901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011415	TAA	2	6	298932	298937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011415	GAA	2	6	298963	298968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011415	TA	3	6	298996	299001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011415	TAC	2	6	301217	301222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_011415	A	6	6	301264	301269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011415	GAC	2	6	301284	301289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_011415	GTT	2	6	301307	301312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011415	A	6	6	301357	301362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011415	TGAA	2	8	301567	301574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011415	TA	3	6	301606	301611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011415	GA	3	6	301766	301771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011415	GCCT	2	8	301777	301784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_011415	ATG	2	6	302058	302063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_011415	CAA	2	6	302972	302977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011415	GAA	2	6	303807	303812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011415	ATC	2	6	303821	303826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011415	AC	3	6	303844	303849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_011415	GAT	2	6	303922	303927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011415	GTTGA	2	10	303954	303963	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011415	ATT	2	6	304047	304052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011415	CTT	2	6	304057	304062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_011415	ATCA	2	8	304118	304125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
638	NC_011415	GGC	2	6	305409	305414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_011415	GCGA	2	8	305425	305432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
640	NC_011415	T	6	6	305471	305476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_011415	A	8	8	310204	310211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_011415	A	8	8	310213	310220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_011415	TTTA	2	8	310342	310349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_011415	TAAC	2	8	310374	310381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
645	NC_011415	T	6	6	310439	310444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_011415	AACTA	2	10	310499	310508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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649	NC_011415	CCT	2	6	310969	310974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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651	NC_011415	TTA	2	6	312278	312283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
652	NC_011415	GCA	2	6	312881	312886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_011415	GTCA	2	8	314235	314242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
654	NC_011415	ATTGT	2	10	314288	314297	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
655	NC_011415	A	8	8	314301	314308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
656	NC_011415	AG	3	6	314493	314498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
657	NC_011415	TGC	2	6	314540	314545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_011415	GCC	2	6	314559	314564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
659	NC_011415	GCT	2	6	314572	314577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_011415	TAACG	2	10	314643	314652	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
662	NC_011415	TTCC	2	8	314683	314690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
663	NC_011415	TCC	2	6	314703	314708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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665	NC_011415	GTT	2	6	314779	314784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
666	NC_011415	TTTA	2	8	314790	314797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
667	NC_011415	AAT	2	6	314798	314803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
668	NC_011415	AAT	2	6	314812	314817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
669	NC_011415	ATA	2	6	314828	314833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
670	NC_011415	AGT	2	6	314852	314857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_011415	G	6	6	314945	314950	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
673	NC_011415	ACC	2	6	314967	314972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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675	NC_011415	T	7	7	315068	315074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
676	NC_011415	CTG	2	6	315078	315083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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678	NC_011415	A	6	6	315159	315164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_011415	CAGG	2	8	316999	317006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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684	NC_011415	AGT	2	6	317207	317212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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724	NC_011415	TCA	2	6	328276	328281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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739	NC_011415	CAT	2	6	335373	335378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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752	NC_011415	A	7	7	342639	342645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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758	NC_011415	CAA	2	6	343138	343143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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760	NC_011415	AGG	2	6	343205	343210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_011415	AC	3	6	343247	343252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
763	NC_011415	ATT	2	6	343271	343276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
764	NC_011415	TGTTA	2	10	343727	343736	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
765	NC_011415	TGTGGA	2	12	343800	343811	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
766	NC_011415	ATA	2	6	344006	344011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
767	NC_011415	TTAC	2	8	344013	344020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
768	NC_011415	TTA	2	6	344076	344081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
769	NC_011415	AAAT	2	8	344094	344101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
770	NC_011415	AAC	2	6	344127	344132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
771	NC_011415	TGT	2	6	344158	344163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
772	NC_011415	A	6	6	344198	344203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_011415	TA	3	6	344226	344231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_011415	T	6	6	344254	344259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
775	NC_011415	AT	3	6	344325	344330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
776	NC_011415	GAG	2	6	344401	344406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
777	NC_011415	TCA	2	6	344418	344423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
778	NC_011415	GTT	2	6	344460	344465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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