MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET49

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010697	ACTA	2	8	871	878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010697	AAAT	2	8	888	895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010697	CAA	2	6	943	948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010697	T	6	6	1493	1498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010697	A	7	7	1515	1521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010697	GAA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010697	TC	3	6	2261	2266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010697	ATG	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010697	GCA	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010697	AGG	2	6	2429	2434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010697	CAGC	2	8	2463	2470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010697	TTA	2	6	2481	2486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010697	GCG	2	6	2487	2492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010697	ATGGT	2	10	2571	2580	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010697	TAA	2	6	2977	2982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010697	A	7	7	2988	2994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010697	ATG	2	6	3010	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010697	GAA	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010697	AGC	2	6	3890	3895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010697	TCA	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010697	GTAA	2	8	11889	11896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010697	AAT	2	6	21045	21050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010697	CT	3	6	21115	21120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010697	ATT	3	9	21127	21135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010697	T	6	6	21160	21165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010697	ACC	2	6	21188	21193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010697	CAA	2	6	21251	21256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010697	CCG	3	9	21780	21788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010697	GCG	2	6	21793	21798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010697	TAAA	2	8	24135	24142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010697	CGG	2	6	24177	24182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010697	T	7	7	24216	24222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010697	CGG	2	6	24240	24245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010697	TGT	2	6	24255	24260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010697	ATG	2	6	24270	24275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010697	GCA	2	6	24301	24306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010697	GCA	2	6	24310	24315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010697	TTC	2	6	24327	24332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010697	AGC	2	6	24428	24433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010697	G	7	7	24455	24461	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010697	AC	3	6	24474	24479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010697	GGA	2	6	24511	24516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010697	GCCC	2	8	24584	24591	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_010697	CGG	2	6	24603	24608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010697	TTG	2	6	25257	25262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010697	GCGG	2	8	25285	25292	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010697	ATG	2	6	25460	25465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010697	TAA	2	6	25528	25533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010697	A	6	6	25669	25674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010697	TGAT	2	8	25708	25715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010697	ATG	2	6	25740	25745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010697	A	6	6	25746	25751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010697	TAT	2	6	25756	25761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010697	TAA	2	6	25812	25817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010697	AAT	2	6	26302	26307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010697	TTTTG	2	10	26359	26368	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010697	ATG	3	9	26369	26377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010697	ATT	2	6	26490	26495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010697	TTTTC	2	10	26524	26533	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010697	TAT	2	6	26567	26572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010697	AT	4	8	26571	26578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010697	T	6	6	26599	26604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010697	CAT	2	6	27314	27319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010697	ATG	2	6	27334	27339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010697	GAA	2	6	28222	28227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010697	AGTAC	2	10	30554	30563	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010697	GGAT	2	8	30596	30603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010697	AGT	2	6	30732	30737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010697	ATC	2	6	31246	31251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010697	T	6	6	31265	31270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010697	TGC	2	6	31335	31340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010697	TTG	2	6	31424	31429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010697	TAT	2	6	32074	32079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010697	AT	3	6	32104	32109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010697	T	7	7	32139	32145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010697	ACC	2	6	32180	32185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010697	T	8	8	32303	32310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010697	AAC	2	6	32335	32340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010697	AAT	2	6	32376	32381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010697	CAT	2	6	32382	32387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010697	CCG	2	6	32661	32666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010697	ATA	2	6	32944	32949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010697	TGA	2	6	33005	33010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010697	CCCTGC	2	12	33082	33093	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010697	CTG	2	6	33124	33129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010697	TGC	2	6	34170	34175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010697	AGCC	2	8	34184	34191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010697	TTA	2	6	34207	34212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010697	AATT	2	8	34983	34990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010697	AGG	2	6	35045	35050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010697	A	8	8	35152	35159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010697	CGC	2	6	35180	35185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010697	T	6	6	35213	35218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010697	TA	3	6	35239	35244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010697	TA	3	6	35255	35260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010697	TA	3	6	35494	35499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010697	ACA	2	6	35734	35739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010697	ATA	2	6	35762	35767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010697	GGC	2	6	35770	35775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010697	CCG	2	6	35811	35816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010697	ACTA	2	8	35863	35870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010697	ACA	2	6	35883	35888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010697	GCC	2	6	36325	36330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010697	ATA	2	6	36340	36345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010697	GCC	2	6	36351	36356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010697	GCCCT	2	10	36374	36383	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_010697	GAAGC	2	10	36411	36420	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010697	G	6	6	37689	37694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010697	AC	4	8	37740	37747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010697	AT	3	6	37771	37776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010697	TA	3	6	37780	37785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010697	TA	3	6	37800	37805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010697	CAT	2	6	37857	37862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010697	TACA	2	8	37898	37905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010697	AC	3	6	38591	38596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010697	GTAC	2	8	38598	38605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010697	TAA	3	9	38610	38618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010697	GAAAA	2	10	38991	39000	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010697	CGT	2	6	42465	42470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010697	ATAC	2	8	42519	42526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010697	ATAC	2	8	42562	42569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010697	CTA	2	6	42597	42602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010697	TTA	2	6	43881	43886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010697	GGT	2	6	44499	44504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010697	T	7	7	44504	44510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010697	TCCG	2	8	44532	44539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010697	CGT	2	6	44888	44893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010697	CGGAAG	2	12	44990	45001	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010697	CCG	2	6	45072	45077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010697	TTC	2	6	45089	45094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010697	GC	3	6	45100	45105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010697	AT	3	6	45132	45137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010697	TCGT	2	8	45181	45188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010697	ATCCG	2	10	45294	45303	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_010697	AGTA	2	8	45406	45413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010697	GAC	2	6	45531	45536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010697	CGC	2	6	45577	45582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010697	TTAT	2	8	45692	45699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010697	TTTC	2	8	46165	46172	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010697	T	7	7	46185	46191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010697	CAT	2	6	46486	46491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010697	T	9	9	47303	47311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010697	CAT	2	6	47703	47708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_010697	CT	3	6	47727	47732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010697	GAT	2	6	47826	47831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010697	CGC	2	6	47885	47890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_010697	GTCT	2	8	47915	47922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010697	AGA	3	9	47982	47990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_010697	TTAG	2	8	48076	48083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010697	TAA	2	6	48097	48102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010697	TTA	2	6	48117	48122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_010697	A	6	6	48731	48736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.