MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET46

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010693	CGAC	2	8	892	899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010693	CTTT	2	8	1140	1147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010693	AAAG	2	8	1191	1198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010693	ATGA	2	8	5480	5487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010693	GCTG	2	8	7078	7085	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010693	GAAA	2	8	7334	7341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010693	TGAT	2	8	7378	7385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010693	GATG	2	8	7436	7443	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010693	CAGC	2	8	7658	7665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010693	TAAT	2	8	8348	8355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010693	GTTG	2	8	11852	11859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010693	CTGA	2	8	11889	11896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010693	CGCT	2	8	12213	12220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010693	GCTG	2	8	12338	12345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010693	ACTG	2	8	12738	12745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010693	AAAG	2	8	18418	18425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010693	GCTG	2	8	18524	18531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010693	ACAG	2	8	18626	18633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010693	CTCC	2	8	18772	18779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_010693	CAAT	2	8	19132	19139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010693	GCAG	2	8	19853	19860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010693	AATG	2	8	19892	19899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010693	GCCT	2	8	19911	19918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010693	AAAT	2	8	20338	20345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010693	TAAA	2	8	23502	23509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010693	GCCA	2	8	23880	23887	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010693	CTGC	2	8	24227	24234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010693	TTCG	2	8	25540	25547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010693	AGCA	2	8	25633	25640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010693	GCCT	2	8	25703	25710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010693	CTGG	2	8	28241	28248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010693	GCTC	2	8	28461	28468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010693	CTTT	2	8	29452	29459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010693	ATTA	2	8	29919	29926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010693	TACA	2	8	31187	31194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010693	CTTA	2	8	31256	31263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010693	TTAC	2	8	33916	33923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010693	CTCA	2	8	35073	35080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010693	TAAA	2	8	35743	35750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010693	CAGG	2	8	35764	35771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010693	AAAT	2	8	35885	35892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010693	GAAA	2	8	36460	36467	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010693	TATT	2	8	36590	36597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010693	AGTG	2	8	36629	36636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010693	GACG	2	8	37002	37009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010693	GCAC	2	8	37268	37275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010693	CCCG	2	8	38258	38265	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_010693	GCTG	2	8	39321	39328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010693	ATAC	2	8	43347	43354	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010693	CCCA	2	8	44049	44056	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_010693	ACAA	2	8	45295	45302	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010693	ATTG	2	8	45710	45717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010693	CTGA	2	8	45794	45801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010693	CGGC	2	8	46032	46039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.