MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 chromosome

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010498	GAAAAT	2	12	10499	10510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010498	AAGGGA	2	12	90964	90975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010498	ATTGTT	2	12	157972	157983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010498	GTAGTG	2	12	209562	209573	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010498	AGGGAG	2	12	272855	272866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010498	ACTTAC	2	12	309221	309232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010498	TTTTCT	2	12	345927	345938	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010498	CTATTT	2	12	346964	346975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010498	TGTCTG	2	12	357043	357054	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010498	TGAGGT	2	12	357236	357247	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010498	TTTATT	2	12	369070	369081	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010498	TATTGA	2	12	407370	407381	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010498	TTTTTA	2	12	424095	424106	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010498	AACAAT	2	12	429653	429664	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010498	TATTGA	2	12	432496	432507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010498	CAGGCG	2	12	519634	519645	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010498	GGATAA	2	12	587376	587387	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010498	TGCAAA	2	12	613764	613775	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010498	CAAATT	2	12	695861	695872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010498	ATTTTT	2	12	707516	707527	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010498	AATCAG	2	12	754879	754890	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010498	ATCGTG	2	12	776045	776056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010498	TTTTCT	2	12	786961	786972	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010498	CAGAAA	2	12	824901	824912	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010498	AACAGG	2	12	925024	925035	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010498	GTAAGG	2	12	936514	936525	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010498	GGGGGT	2	12	967675	967686	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010498	ACGGCA	2	12	970451	970462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010498	AGGGGG	2	12	1001605	1001616	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010498	ACAAAA	2	12	1032525	1032536	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010498	GCTGGG	2	12	1040930	1040941	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010498	GTTCTG	2	12	1100734	1100745	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010498	ACTGAC	2	12	1114709	1114720	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010498	ATCACG	2	12	1124555	1124566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010498	TTTATG	2	12	1138460	1138471	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010498	AGTTTT	2	12	1138693	1138704	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010498	TTTACG	2	12	1144811	1144822	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010498	TGTCCA	2	12	1148270	1148281	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010498	GTTTTT	2	12	1185790	1185801	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010498	TAAATA	2	12	1225503	1225514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010498	ATAAGA	2	12	1259045	1259056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010498	TCAGAA	2	12	1271277	1271288	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010498	CATTAA	2	12	1279987	1279998	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010498	GGTGTC	2	12	1302193	1302204	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010498	GACAGT	2	12	1322567	1322578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010498	TGAAAT	2	12	1366246	1366257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010498	AAAGAA	2	12	1370154	1370165	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010498	GTAATA	2	12	1388388	1388399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010498	CTTTTT	2	12	1498248	1498259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010498	AGTCTT	2	12	1507170	1507181	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010498	AAAACA	2	12	1507430	1507441	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010498	ATAGAA	2	12	1515636	1515647	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010498	TAAGTA	2	12	1521713	1521724	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010498	CATAAC	2	12	1672669	1672680	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010498	TAACGG	2	12	1681500	1681511	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010498	GTTTTT	2	12	1696376	1696387	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010498	CAAATT	2	12	1726783	1726794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010498	AGTTAT	2	12	1848457	1848468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010498	AACTTT	2	12	1899149	1899160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010498	GATCAG	2	12	1903397	1903408	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010498	ACAAAA	2	12	2002194	2002205	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010498	TTTTTG	2	12	2086063	2086074	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010498	ATCATT	2	12	2132353	2132364	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010498	CATTAT	2	12	2156112	2156123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010498	TCCTTA	2	12	2157527	2157538	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010498	ATCTTT	2	12	2200291	2200302	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010498	TTCCAG	2	12	2223069	2223080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010498	ATCGGG	2	12	2267120	2267131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010498	CGGTTA	2	12	2306010	2306021	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010498	TCTTCC	2	12	2349495	2349506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010498	TAAATG	2	12	2493776	2493787	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010498	TGTCAC	2	12	2507411	2507422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010498	AGCGGA	2	12	2510559	2510570	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010498	AGAAAA	2	12	2517703	2517714	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010498	CTGATG	2	12	2585811	2585822	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010498	TCGATA	2	12	2615955	2615966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010498	CAAGTG	2	12	2622297	2622308	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010498	CTAACC	2	12	2665969	2665980	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010498	TCCTTC	2	12	2735249	2735260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010498	TGAGCG	2	12	2774749	2774760	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010498	TGGACA	2	12	2784758	2784769	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010498	CAGTTT	2	12	2799366	2799377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010498	TTTTAC	2	12	2856616	2856627	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010498	TTTGTT	2	12	3030433	3030444	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010498	ATCGCG	2	12	3119954	3119965	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010498	GTAAGG	2	12	3134627	3134638	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010498	ATCCGC	2	12	3162587	3162598	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010498	GGCAAA	2	12	3165628	3165639	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010498	ACTGAG	2	12	3168007	3168018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010498	TATCGC	2	12	3206819	3206830	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010498	TCACCG	2	12	3208589	3208600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010498	TCCGCC	2	12	3221777	3221788	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010498	ATCAGT	2	12	3225116	3225127	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010498	CCGGAT	2	12	3225466	3225477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010498	GCTCCT	2	12	3234966	3234977	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010498	TAAGGG	2	12	3245917	3245928	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010498	CATTTG	2	12	3251091	3251102	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010498	ATTATC	2	12	3265254	3265265	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010498	TGAACT	2	12	3268585	3268596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010498	TATAAT	2	12	3272163	3272174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010498	AAACAA	2	12	3279125	3279136	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_010498	ACGCAG	2	12	3329563	3329574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010498	TTTTCG	2	12	3336209	3336220	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010498	TCACCC	2	12	3337163	3337174	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010498	ATTTAA	2	12	3410325	3410336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010498	ATATTC	2	12	3410495	3410506	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_010498	AGTTGT	2	12	3436547	3436558	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010498	AATGAT	2	12	3442659	3442670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010498	TCTCCC	2	12	3464386	3464397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010498	GTAACC	2	12	3496290	3496301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010498	TGCATT	2	12	3506769	3506780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_010498	TTTTAT	2	12	3508666	3508677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010498	AAGCGA	2	12	3514065	3514076	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010498	CTTTCT	2	12	3537934	3537945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010498	GTGCAG	2	12	3642745	3642756	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_010498	TGCGTC	2	12	3645331	3645342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010498	AGCGTT	2	12	3645753	3645764	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010498	CCTTTC	2	12	3665775	3665786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010498	ATTACG	2	12	3703690	3703701	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010498	AATTTA	2	12	3753930	3753941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010498	AGATGC	2	12	3866164	3866175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010498	AAATTT	2	12	4003789	4003800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010498	TTTATC	2	12	4012148	4012159	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_010498	TATCAA	2	12	4012722	4012733	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010498	GTTATT	2	12	4167073	4167084	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010498	GACTAT	2	12	4178234	4178245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010498	TGCGAT	2	12	4178308	4178319	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_010498	AAGAAA	2	12	4186251	4186262	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010498	CTTAAT	2	12	4206918	4206929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_010498	CTTTTT	2	12	4221138	4221149	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_010498	GCGTAA	2	12	4355031	4355042	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_010498	AGGGTT	2	12	4365103	4365114	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010498	ATTCTG	2	12	4383546	4383557	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_010498	AACTAA	2	12	4435390	4435401	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_010498	TCATTT	2	12	4566561	4566572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_010498	TTTTAT	2	12	4585108	4585119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010498	GTCTTT	2	12	4625554	4625565	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_010498	AATATC	2	12	4650052	4650063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_010498	GGGAGA	2	12	4668766	4668777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010498	CTGATA	2	12	4685665	4685676	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_010498	TTTTTA	2	12	4737679	4737690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010498	TTTAAT	2	12	4769628	4769639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010498	CATACG	2	12	4802943	4802954	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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146	NC_010498	AATAAA	2	12	4834525	4834536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010498	TGAAAA	2	12	4867516	4867527	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_010498	TTTTCA	2	12	5024274	5024285	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_010498	AATGAT	2	12	5034015	5034026	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.