MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_130

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010488	GGC	2	6	76	81	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010488	TGT	2	6	86	91	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010488	CCG	2	6	114	119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_010488	AGT	2	6	599	604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010488	GGC	2	6	657	662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010488	AGG	2	6	769	774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010488	GAT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010488	GTT	2	6	805	810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010488	ATT	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010488	AGG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010488	TTG	2	6	1855	1860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010488	TCT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010488	CCT	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010488	TAC	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010488	TAG	2	6	2463	2468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010488	CTG	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010488	TGT	2	6	2589	2594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010488	GCA	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010488	AGA	2	6	2683	2688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010488	ATC	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010488	CTG	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010488	CAA	2	6	2747	2752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010488	CCA	2	6	2820	2825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010488	ACC	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010488	TCT	2	6	2966	2971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010488	AAT	2	6	3088	3093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010488	AAT	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010488	GCA	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010488	ATT	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010488	GCT	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010488	TAT	2	6	4364	4369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010488	AAT	2	6	4377	4382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010488	CCT	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010488	TTC	2	6	4454	4459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010488	GAA	2	6	13307	13312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010488	ATT	2	6	13331	13336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010488	ATG	2	6	13338	13343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010488	TAA	2	6	13351	13356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010488	TTA	2	6	14290	14295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010488	ATC	2	6	14810	14815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010488	TTA	2	6	20142	20147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010488	ATT	2	6	20211	20216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010488	TTA	2	6	20228	20233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010488	CTC	2	6	24561	24566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010488	TAG	2	6	25063	25068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010488	TCC	2	6	30088	30093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010488	CCG	2	6	30176	30181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010488	TAA	2	6	35551	35556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010488	CGA	2	6	35577	35582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010488	AGC	2	6	36963	36968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010488	GCT	2	6	37003	37008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010488	GGC	2	6	37012	37017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010488	GTC	2	6	37094	37099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010488	TAA	2	6	37112	37117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010488	ATT	2	6	37138	37143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010488	GAC	2	6	38028	38033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010488	ATA	2	6	38053	38058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010488	TAA	2	6	38954	38959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010488	ATC	2	6	38978	38983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010488	CAA	2	6	39014	39019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010488	TCA	2	6	39033	39038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010488	AGT	2	6	39964	39969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010488	GAA	2	6	39984	39989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010488	AAT	2	6	39996	40001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010488	GTT	2	6	40122	40127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010488	ACA	2	6	40137	40142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010488	CAG	2	6	40173	40178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010488	AGT	2	6	40199	40204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010488	CTT	2	6	40417	40422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010488	GTG	2	6	40483	40488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010488	TAC	2	6	40506	40511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010488	TCT	2	6	40519	40524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010488	CAA	2	6	40543	40548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010488	ACC	2	6	40549	40554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_010488	TGC	2	6	41858	41863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010488	CGG	2	6	41875	41880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010488	GTT	2	6	41890	41895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010488	CAT	2	6	44765	44770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010488	CGC	2	6	44862	44867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010488	ACA	2	6	45045	45050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010488	CGC	2	6	45064	45069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010488	ACG	2	6	45071	45076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010488	GGC	2	6	45165	45170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010488	CGG	2	6	45250	45255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010488	GAC	2	6	45299	45304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010488	GCC	2	6	45310	45315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010488	ACA	2	6	45353	45358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010488	AGT	2	6	45363	45368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010488	GCC	2	6	47616	47621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_010488	GGC	2	6	47630	47635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010488	GCG	2	6	47923	47928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010488	TCC	2	6	48002	48007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010488	CGC	2	6	48404	48409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_010488	ACG	2	6	48411	48416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010488	GGC	2	6	48834	48839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010488	GGC	2	6	49485	49490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010488	GCC	2	6	49494	49499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010488	TCC	2	6	49943	49948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_010488	GTT	2	6	49949	49954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010488	GCA	2	6	50216	50221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010488	TCA	2	6	50281	50286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010488	GCA	2	6	52104	52109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010488	ATC	2	6	52300	52305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010488	TAA	2	6	52481	52486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010488	ATT	2	6	52503	52508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010488	CAA	2	6	53114	53119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010488	CAA	2	6	53200	53205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010488	CAA	2	6	53372	53377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010488	ATA	2	6	53575	53580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010488	CAA	3	9	55864	55872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010488	AGT	2	6	55881	55886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010488	GTT	2	6	55901	55906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010488	AAT	2	6	55961	55966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010488	CGT	2	6	55986	55991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010488	GCA	2	6	56843	56848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010488	AAT	2	6	58477	58482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010488	AGT	2	6	58500	58505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010488	ATA	2	6	58516	58521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010488	CTA	2	6	58567	58572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010488	ATT	2	6	58583	58588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010488	TCA	2	6	58834	58839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010488	CCA	2	6	58951	58956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_010488	ATC	2	6	59597	59602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010488	GAA	2	6	59607	59612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010488	ACC	2	6	60378	60383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010488	GAA	2	6	60474	60479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010488	TAT	2	6	60513	60518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010488	GAA	2	6	60547	60552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010488	TCG	2	6	60821	60826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010488	AGG	2	6	60977	60982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010488	GAG	2	6	61018	61023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010488	GCT	2	6	61044	61049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010488	ACT	2	6	61218	61223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010488	GCA	2	6	61285	61290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010488	CAA	2	6	61300	61305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010488	ATT	2	6	61332	61337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010488	ACT	2	6	64878	64883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010488	AAT	2	6	64913	64918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010488	AAT	2	6	65056	65061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010488	TGC	2	6	65141	65146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010488	AGA	2	6	66031	66036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.