MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 8306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009801	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009801	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009801	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009801	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009801	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009801	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009801	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009801	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009801	CGC	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009801	AAG	2	6	9297	9302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009801	CGG	2	6	9429	9434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009801	CGT	2	6	9449	9454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009801	ATC	2	6	9458	9463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009801	ATC	3	9	11785	11793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009801	AAT	2	6	11807	11812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009801	ATA	2	6	11848	11853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009801	CTG	2	6	13115	13120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009801	AGA	2	6	13127	13132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009801	TTA	2	6	13156	13161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009801	ATG	2	6	13409	13414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009801	CCG	2	6	16668	16673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009801	GCC	2	6	16768	16773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009801	CGG	2	6	16778	16783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009801	ATC	2	6	16810	16815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009801	TGC	2	6	16822	16827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009801	CGC	2	6	16982	16987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_009801	TAT	2	6	16988	16993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009801	ATT	2	6	17079	17084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009801	ATT	2	6	17111	17116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009801	GAC	2	6	17117	17122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009801	ATT	2	6	17130	17135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009801	ACA	2	6	17170	17175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009801	TTC	2	6	17303	17308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009801	GAT	2	6	17358	17363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009801	TCA	2	6	20630	20635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009801	ATT	2	6	20713	20718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009801	AAT	2	6	20848	20853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009801	TAT	2	6	20929	20934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009801	AAC	2	6	20944	20949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009801	ACC	2	6	21061	21066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009801	ACT	2	6	21085	21090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009801	CCA	2	6	21098	21103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009801	TAT	2	6	21142	21147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009801	ATT	2	6	21193	21198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009801	TTG	3	9	21199	21207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009801	TTG	2	6	21272	21277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009801	ATC	2	6	21346	21351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009801	CTC	2	6	21391	21396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009801	TAT	2	6	21402	21407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009801	TCA	2	6	21410	21415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009801	TGA	2	6	21626	21631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009801	GGC	2	6	21697	21702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009801	TAT	2	6	21738	21743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009801	ATT	2	6	21781	21786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009801	TAC	2	6	21792	21797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009801	GTT	2	6	21907	21912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009801	ATT	2	6	21913	21918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009801	TGA	2	6	21959	21964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009801	ATT	2	6	21981	21986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009801	CTT	2	6	21989	21994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009801	AAG	2	6	21998	22003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009801	ATT	2	6	22015	22020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009801	ATT	2	6	22058	22063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009801	TAA	2	6	22085	22090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009801	TCA	2	6	22091	22096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009801	CTT	2	6	22120	22125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009801	ACT	2	6	23602	23607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009801	AAG	2	6	23631	23636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009801	TAA	2	6	23676	23681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009801	GAG	2	6	23697	23702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009801	CTT	2	6	24357	24362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009801	TGC	2	6	28945	28950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009801	CGC	2	6	28978	28983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009801	AGC	2	6	30429	30434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009801	TCT	2	6	32524	32529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009801	TGT	2	6	32535	32540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009801	TCT	2	6	32600	32605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009801	TGC	2	6	32606	32611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009801	GCC	2	6	32740	32745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009801	TCG	2	6	32759	32764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009801	TCA	2	6	32790	32795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009801	TGT	2	6	37932	37937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009801	GAC	2	6	39385	39390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009801	ATT	2	6	39429	39434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009801	CTG	2	6	39453	39458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009801	GCG	2	6	42352	42357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009801	ATT	2	6	45325	45330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009801	TGT	2	6	45344	45349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009801	ACC	2	6	45554	45559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009801	ACG	2	6	45567	45572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009801	CGC	2	6	48965	48970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009801	ATT	2	6	50368	50373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009801	GCG	2	6	52887	52892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009801	CAG	2	6	52919	52924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009801	CAT	2	6	52944	52949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009801	CGA	2	6	52962	52967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009801	CAA	2	6	57945	57950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009801	CAT	2	6	60325	60330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009801	GTG	2	6	60415	60420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009801	GCG	2	6	61446	61451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009801	ACC	2	6	65107	65112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009801	GTG	2	6	65134	65139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009801	AAT	2	6	71865	71870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009801	TAA	2	6	71958	71963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009801	TCT	2	6	72047	72052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009801	CGC	2	6	73898	73903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_009801	AAT	2	6	79044	79049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009801	AGG	2	6	79066	79071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009801	CAT	2	6	79218	79223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009801	CAG	2	6	79256	79261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009801	CTG	2	6	79269	79274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009801	CGC	2	6	79289	79294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009801	AGA	2	6	85348	85353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009801	TAG	4	12	85360	85371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009801	TGC	2	6	85523	85528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009801	GGT	2	6	85529	85534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009801	TGA	2	6	85664	85669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009801	ATT	2	6	85722	85727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009801	GAT	2	6	85804	85809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009801	CAA	2	6	85846	85851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009801	ATT	2	6	85863	85868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009801	TTC	2	6	85991	85996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009801	ATT	2	6	86000	86005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009801	GGA	2	6	87177	87182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009801	TCC	2	6	87205	87210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009801	TTA	2	6	87220	87225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009801	TAT	2	6	90821	90826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009801	AAT	2	6	90879	90884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009801	ATT	2	6	90912	90917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009801	TGA	2	6	91110	91115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009801	TGC	2	6	91157	91162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009801	AAC	2	6	91182	91187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009801	TCC	2	6	91255	91260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009801	AAG	2	6	102434	102439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009801	CGA	2	6	106947	106952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009801	CCG	2	6	108193	108198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009801	ATA	2	6	108239	108244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009801	TTA	2	6	109931	109936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009801	TCA	2	6	114813	114818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009801	TGA	2	6	114860	114865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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