MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_74

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009790	CAGA	2	8	54	61	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009790	CATT	2	8	598	605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009790	GACA	2	8	639	646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009790	CCCT	2	8	761	768	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_009790	CTGG	2	8	868	875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009790	GCCC	2	8	2083	2090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_009790	TGAT	2	8	6933	6940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009790	TCGA	2	8	7588	7595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009790	TGAT	2	8	7703	7710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009790	GGCG	2	8	11556	11563	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009790	CCTT	2	8	11838	11845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009790	GGAA	2	8	12524	12531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009790	TTAC	2	8	12703	12710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009790	GGGC	2	8	12728	12735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009790	GTCT	2	8	12759	12766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009790	GCAA	2	8	13139	13146	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009790	CAGG	2	8	13190	13197	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009790	GCTG	2	8	13251	13258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009790	CCAT	2	8	15132	15139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009790	GTGG	2	8	15340	15347	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009790	CAAT	2	8	18053	18060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009790	GCCC	2	8	18494	18501	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_009790	AGCG	2	8	22365	22372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009790	CCAC	2	8	22804	22811	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009790	GATG	2	8	23011	23018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009790	GACG	2	8	23025	23032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009790	GCCA	2	8	24891	24898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009790	CCTG	2	8	24954	24961	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009790	CTTG	2	8	25004	25011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009790	CAGA	2	8	25384	25391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009790	GCCC	2	8	25416	25423	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_009790	GTAA	2	8	25441	25448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009790	CCAC	2	8	25455	25462	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_009790	TTCC	2	8	25620	25627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009790	CTGG	2	8	26421	26428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009790	AAAG	2	8	26593	26600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009790	TTTC	2	8	26733	26740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009790	GCGT	2	8	26860	26867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009790	AATC	2	8	26966	26973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009790	GATA	2	8	26978	26985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009790	TTAA	2	8	27066	27073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009790	AGTA	2	8	29366	29373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009790	CTGT	2	8	31842	31849	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009790	CGGG	2	8	31893	31900	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009790	ACTG	2	8	32184	32191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009790	TTTA	2	8	37515	37522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009790	ATAA	2	8	37758	37765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009790	ATCA	2	8	37858	37865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009790	TATT	2	8	37887	37894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009790	ACGG	2	8	41056	41063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009790	GCAT	2	8	41292	41299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009790	GAAC	2	8	41326	41333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009790	AAGT	2	8	43111	43118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009790	GCCA	2	8	47307	47314	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009790	CAGC	2	8	47440	47447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009790	CTCC	2	8	48021	48028	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_009790	TTTA	2	8	48693	48700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009790	TTAT	2	8	49245	49252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009790	TAAT	2	8	53574	53581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009790	ATTT	2	8	53585	53592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009790	ATAG	2	8	54488	54495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009790	GGAA	2	8	55396	55403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009790	ATAG	2	8	55501	55508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009790	GGTT	2	8	55630	55637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009790	TTCT	2	8	56645	56652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009790	TACT	2	8	59481	59488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009790	TTCA	2	8	62576	62583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009790	GGGC	2	8	62614	62621	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009790	TGCT	2	8	62719	62726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009790	TGAT	2	8	62956	62963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009790	TCAG	2	8	63038	63045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009790	TCAG	2	8	63170	63177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009790	TACG	2	8	64254	64261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009790	GCTG	2	8	64718	64725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009790	CCTC	2	8	71976	71983	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_009790	AATG	2	8	72106	72113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009790	ACTG	2	8	72251	72258	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009790	CGGG	2	8	72826	72833	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009790	CCCG	2	8	72907	72914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_009790	CAGA	2	8	73110	73117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009790	TGAC	2	8	73174	73181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009790	TGGC	2	8	73419	73426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009790	TACC	2	8	74043	74050	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009790	CCGA	2	8	74086	74093	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009790	ACAG	2	8	74183	74190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.