MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_80

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009786	CCTTT	2	10	8252	8261	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009786	AGTAT	2	10	11253	11262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009786	GAGCA	2	10	11682	11691	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009786	CTGAC	2	10	12737	12746	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_009786	GAGTA	2	10	13828	13837	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009786	AAACA	2	10	16583	16592	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009786	CAATT	2	10	17762	17771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009786	CCGCC	2	10	22638	22647	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_009786	ATCAC	2	10	24734	24743	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009786	TAGAA	2	10	33619	33628	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009786	AAAAG	2	10	39026	39035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009786	CAGTG	2	10	39223	39232	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009786	TCGCT	2	10	40295	40304	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009786	CTTTC	2	10	43230	43239	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009786	GTCCC	2	10	43683	43692	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_009786	CGTCC	2	10	43693	43702	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_009786	GTCAG	2	10	45542	45551	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009786	AAGGT	2	10	46909	46918	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009786	AACCA	2	10	51257	51266	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009786	GATAA	2	10	56685	56694	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009786	TGCGA	2	10	57682	57691	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009786	TGCAC	2	10	59664	59673	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009786	ACATA	2	10	64030	64039	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.