MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 8478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008563	AGC	2	6	46	51	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008563	ACA	2	6	162	167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008563	CAC	2	6	185	190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008563	ACC	3	9	195	203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008563	AAC	2	6	310	315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008563	GAA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008563	AAC	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008563	AAG	2	6	7886	7891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008563	CGG	2	6	8018	8023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008563	CGT	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008563	ATC	2	6	8047	8052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008563	TGA	2	6	9790	9795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008563	TCT	2	6	9840	9845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008563	CGC	2	6	9894	9899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_008563	GTT	2	6	9922	9927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008563	ATC	3	9	10544	10552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008563	AAT	2	6	10566	10571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008563	ATA	2	6	10607	10612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008563	TGG	2	6	11835	11840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008563	CTG	2	6	11869	11874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008563	TTA	2	6	11910	11915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008563	TTG	2	6	11967	11972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008563	TGA	2	6	12047	12052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008563	TAG	2	6	12072	12077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008563	ATG	2	6	12163	12168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008563	CCG	2	6	15423	15428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008563	GCC	2	6	15523	15528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008563	CGG	2	6	15533	15538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008563	ATC	2	6	15565	15570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008563	TGC	2	6	15577	15582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008563	CGC	2	6	15737	15742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008563	TAT	2	6	15743	15748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008563	TTA	2	6	15916	15921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008563	AGA	2	6	15936	15941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008563	ATA	2	6	18484	18489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008563	AAT	2	6	19876	19881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008563	TTC	2	6	19882	19887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008563	TCA	2	6	19928	19933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008563	GCC	2	6	19934	19939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008563	GAT	2	6	20037	20042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008563	ACA	3	9	22309	22317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008563	TTG	2	6	22333	22338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008563	AGC	2	6	22398	22403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008563	GCA	2	6	22447	22452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008563	TGA	2	6	22490	22495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008563	CAT	2	6	22503	22508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008563	CTT	2	6	22650	22655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008563	GCA	2	6	22773	22778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008563	TTC	2	6	22789	22794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008563	CTT	2	6	22826	22831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008563	TGC	2	6	27258	27263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008563	AGC	2	6	28725	28730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008563	ACA	2	6	31096	31101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008563	TGT	2	6	31213	31218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008563	TCT	2	6	31278	31283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008563	TGC	2	6	31284	31289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008563	ATA	2	6	31363	31368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008563	GCC	2	6	31418	31423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008563	TCG	2	6	31437	31442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008563	TCA	2	6	31468	31473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008563	TGA	2	6	35973	35978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008563	TTA	2	6	36051	36056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008563	GGA	2	6	36689	36694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008563	TGA	2	6	36740	36745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008563	CGA	2	6	37389	37394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008563	GAC	2	6	38807	38812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008563	ATT	2	6	38851	38856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008563	GCG	2	6	41773	41778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008563	ATT	3	9	44620	44628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008563	ATT	2	6	44744	44749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008563	TGT	2	6	44768	44773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008563	GAG	2	6	44866	44871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008563	TTG	2	6	48151	48156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008563	GCT	2	6	48188	48193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008563	AAG	2	6	48222	48227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008563	ATT	2	6	49788	49793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008563	GCA	2	6	53137	53142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008563	TGA	2	6	53196	53201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008563	TGA	2	6	53217	53222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008563	CGC	2	6	53276	53281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008563	TTG	2	6	53314	53319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008563	CCA	2	6	53383	53388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008563	CAA	2	6	57927	57932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008563	CAT	2	6	60307	60312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008563	AGC	2	6	61425	61430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008563	GCG	2	6	61460	61465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008563	ACC	2	6	65122	65127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008563	GTG	2	6	65149	65154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008563	AAT	2	6	71995	72000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008563	TAA	2	6	72088	72093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008563	TTC	2	6	73082	73087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008563	ATT	2	6	73157	73162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008563	CAT	2	6	73236	73241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008563	CCA	2	6	73334	73339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008563	GTT	2	6	73361	73366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008563	ATA	2	6	73509	73514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008563	ATT	2	6	73530	73535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008563	TGA	2	6	73565	73570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008563	CAA	2	6	73604	73609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008563	ATC	2	6	73766	73771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008563	GAA	2	6	74874	74879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008563	ATG	2	6	74887	74892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008563	CGC	2	6	75855	75860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_008563	AAT	2	6	81001	81006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008563	AGG	2	6	81023	81028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008563	ACT	2	6	81159	81164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008563	CAT	2	6	81175	81180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008563	CTG	2	6	81226	81231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008563	TAG	4	12	86095	86106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008563	TGC	2	6	86258	86263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008563	GGT	2	6	86264	86269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008563	CCG	2	6	86299	86304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008563	AAT	2	6	86333	86338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008563	TGA	2	6	86399	86404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008563	ATT	2	6	86456	86461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008563	GAT	2	6	86537	86542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008563	CAA	2	6	86579	86584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008563	ATT	2	6	86596	86601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008563	GTA	2	6	86607	86612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008563	TAT	2	6	87885	87890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008563	GGA	2	6	87910	87915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008563	TCC	2	6	87938	87943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008563	TTA	2	6	87953	87958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008563	TAT	2	6	91554	91559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008563	CTG	2	6	91598	91603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008563	AAT	2	6	91612	91617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008563	ATT	2	6	91645	91650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008563	CTG	2	6	91712	91717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008563	AGA	2	6	91759	91764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008563	TGA	2	6	91843	91848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008563	AAC	2	6	91915	91920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008563	TCC	2	6	91988	91993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_008563	GCT	2	6	92131	92136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008563	TCA	2	6	92176	92181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008563	CTG	2	6	92189	92194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008563	AAG	2	6	92373	92378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008563	CAA	2	6	92398	92403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008563	AAG	2	6	103167	103172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008563	CGA	2	6	107680	107685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008563	CCG	2	6	108926	108931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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