MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 chromosome

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007946	GAAAAT	2	12	10669	10680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007946	AAGGGA	2	12	86773	86784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007946	GTAGTG	2	12	205181	205192	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007946	TGTTGA	2	12	263509	263520	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007946	CTTTTC	2	12	279500	279511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007946	TTCCCC	2	12	308780	308791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007946	TTTTCT	2	12	340073	340084	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007946	CTATTT	2	12	341110	341121	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007946	GTCACT	2	12	344611	344622	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007946	TGTCTG	2	12	357765	357776	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007946	TGAGGT	2	12	357958	357969	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007946	TTTATT	2	12	374942	374953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007946	AACAAT	2	12	421504	421515	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007946	TATTGA	2	12	424350	424361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007946	TTTTCA	2	12	486608	486619	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007946	CAGGCG	2	12	505452	505463	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007946	TTTCTG	2	12	531814	531825	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007946	TGCAAA	2	12	596760	596771	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007946	CATGAG	2	12	638694	638705	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007946	ATTTTT	2	12	691867	691878	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007946	TTTACC	2	12	702779	702790	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007946	TAACCG	2	12	883670	883681	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007946	CTGGAA	2	12	968682	968693	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007946	AAAGAT	2	12	991475	991486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007946	ATAATG	2	12	1028780	1028791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007946	TGGTAA	2	12	1052571	1052582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007946	TGTTAA	2	12	1061015	1061026	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007946	ATGAAG	2	12	1094574	1094585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007946	CAAATG	2	12	1129102	1129113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007946	CAAACC	2	12	1131644	1131655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007946	CAAAAA	2	12	1166188	1166199	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007946	AAAATG	2	12	1286768	1286779	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007946	AGGGGG	2	12	1297577	1297588	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007946	CTTATT	2	12	1367339	1367350	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007946	CAAAAG	2	12	1374390	1374401	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007946	CTGATC	2	12	1384868	1384879	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007946	GGAAAA	2	12	1403166	1403177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007946	AAAGTT	2	12	1436197	1436208	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007946	TATAAC	2	12	1485424	1485435	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007946	TAAATT	2	12	1531342	1531353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007946	GTTAAT	2	12	1596304	1596315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007946	AAAAAC	2	12	1622672	1622683	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007946	CGTTGT	2	12	1624060	1624071	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007946	ACCGTT	2	12	1630244	1630255	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007946	TGGTTA	2	12	1639073	1639084	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007946	GAATCA	2	12	1653110	1653121	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007946	CAAAAA	2	12	1691109	1691120	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007946	ATACTT	2	12	1776892	1776903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007946	AAAATA	2	12	1790550	1790561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007946	TGTTTT	2	12	1791183	1791194	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007946	ACAGCG	2	12	1901127	1901138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007946	TTTCTT	2	12	1916615	1916626	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007946	AATTCA	2	12	2010401	2010412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007946	ATATTT	2	12	2012388	2012399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007946	TCTTAT	2	12	2024208	2024219	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007946	ATTTTT	2	12	2109640	2109651	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007946	CTGATA	2	12	2173116	2173127	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007946	GAAAAC	2	12	2200454	2200465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007946	TGGCAC	2	12	2347813	2347824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007946	TCTTCC	2	12	2403885	2403896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007946	TGTCAC	2	12	2552676	2552687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007946	AGCGGA	2	12	2555812	2555823	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007946	AGAAAA	2	12	2562955	2562966	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007946	CTGATG	2	12	2656272	2656283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007946	GTTATG	2	12	2674117	2674128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007946	TCGATA	2	12	2684743	2684754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007946	CTGGAA	2	12	2685065	2685076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007946	ACGAGT	2	12	2685462	2685473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007946	CAAGTG	2	12	2691086	2691097	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007946	TCCTTC	2	12	2786800	2786811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007946	TGAGCG	2	12	2821276	2821287	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007946	GCCACA	2	12	2906229	2906240	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007946	ATATAG	2	12	2938825	2938836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007946	TGATAT	2	12	2976684	2976695	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007946	TGACGC	2	12	3028579	3028590	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007946	AATGAT	2	12	3056495	3056506	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007946	GGTTTT	2	12	3072484	3072495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007946	ACAAGA	2	12	3076814	3076825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007946	TTTGTT	2	12	3101638	3101649	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007946	ATTGTG	2	12	3124672	3124683	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007946	GTACCG	2	12	3129733	3129744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007946	TCGATA	2	12	3214250	3214261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007946	GTAAGG	2	12	3234495	3234506	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007946	TTTTCG	2	12	3331718	3331729	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007946	ATTTAA	2	12	3344922	3344933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007946	ATAAAA	2	12	3396802	3396813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007946	ATTTAA	2	12	3407542	3407553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007946	AGTTGT	2	12	3438839	3438850	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007946	CTTTTT	2	12	3443516	3443527	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007946	AATGAT	2	12	3444351	3444362	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007946	TCTCCC	2	12	3466202	3466213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007946	GTAACC	2	12	3491968	3491979	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007946	TTTTAT	2	12	3501748	3501759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007946	AAGCGA	2	12	3507146	3507157	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007946	ACAGAA	2	12	3554531	3554542	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007946	AGCGTT	2	12	3636318	3636329	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007946	TTTATA	2	12	3652999	3653010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007946	AATTTA	2	12	3799212	3799223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007946	CATAAT	2	12	3818846	3818857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007946	TGATAA	2	12	3826022	3826033	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007946	AAGATA	2	12	3896832	3896843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007946	AGATGC	2	12	3912301	3912312	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007946	TGAAAA	2	12	3936188	3936199	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007946	GCCAGC	2	12	3975568	3975579	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007946	CTGAAG	2	12	3978021	3978032	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007946	CTTTTT	2	12	4202207	4202218	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007946	GCCATA	2	12	4255518	4255529	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007946	AAATGG	2	12	4337300	4337311	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007946	GCTTTG	2	12	4363814	4363825	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_007946	CCATGC	2	12	4364353	4364364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007946	TTTGTT	2	12	4364965	4364976	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007946	ATTTTT	2	12	4442643	4442654	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007946	TCATTT	2	12	4469283	4469294	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007946	TAACCA	2	12	4488757	4488768	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007946	ATTTAT	2	12	4537929	4537940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007946	CTGATA	2	12	4614455	4614466	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007946	TTTTTA	2	12	4664709	4664720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007946	TTTAAT	2	12	4696569	4696580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007946	CAGCCT	2	12	4736981	4736992	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007946	CCTGCC	2	12	4799107	4799118	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007946	TCCAGC	2	12	4811068	4811079	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007946	TTAACA	2	12	4835047	4835058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007946	AAATTA	2	12	4860927	4860938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007946	CGTCAC	2	12	4894501	4894512	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007946	TTTCTC	2	12	4894535	4894546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007946	AACAGG	2	12	4909037	4909048	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_007946	CGGTTG	2	12	4944083	4944094	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_007946	GTAAAA	2	12	5054769	5054780	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.