MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 chromosome

Total Repeats: 449

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007946	GAATT	2	10	15980	15989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007946	AATGT	2	10	18509	18518	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007946	GATGC	2	10	27241	27250	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007946	GATGC	2	10	37333	37342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007946	TTTTC	2	10	74394	74403	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007946	TAGTG	2	10	79280	79289	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007946	ATTTT	2	10	80996	81005	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007946	GGGAG	2	10	81160	81169	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007946	CGCCA	2	10	81224	81233	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_007946	GTGTT	2	10	123884	123893	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007946	AATTG	2	10	128041	128050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007946	GTAAG	2	10	148791	148800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007946	TCCTC	2	10	150511	150520	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_007946	AATTT	2	10	163114	163123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007946	TATAT	2	10	163200	163209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007946	TACGT	2	10	188238	188247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007946	TGGCC	2	10	189924	189933	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007946	GTCTG	2	10	197634	197643	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007946	TGCGC	2	10	220816	220825	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007946	CGGTT	2	10	228276	228285	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007946	GGTGA	2	10	230582	230591	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007946	AGATA	2	10	270294	270303	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007946	AATCA	2	10	307889	307898	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007946	CCGGA	2	10	307908	307917	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007946	GTCAG	2	10	308763	308772	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007946	CTGAC	2	10	309732	309741	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007946	ACATT	2	10	313416	313425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007946	GCAAT	2	10	314432	314441	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007946	TGTGT	2	10	322272	322281	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007946	TGTTA	2	10	323380	323389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007946	TTGAT	2	10	324270	324279	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007946	AGGGT	2	10	335523	335532	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007946	CAAAA	2	10	340097	340106	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007946	GGTTT	2	10	349617	349626	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007946	AGCGA	2	10	351111	351120	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007946	CAGTT	2	10	376813	376822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007946	TTATT	2	10	400312	400321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007946	TGCAG	2	10	421549	421558	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007946	GTTTC	2	10	446372	446381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007946	GAGTA	2	10	452420	452429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007946	ATAAA	2	10	465957	465966	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007946	GAAGA	2	10	475559	475568	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007946	CAGGT	2	10	490618	490627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007946	TTTTC	2	10	511160	511169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007946	TCAGG	2	10	518920	518929	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007946	CATCT	2	10	521929	521938	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007946	TATTT	2	10	548308	548317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007946	AAAGG	2	10	572633	572642	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007946	GTCAG	2	10	593480	593489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007946	GTTAA	2	10	613697	613706	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007946	ATAGC	2	10	621592	621601	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007946	ATTTG	2	10	640401	640410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007946	TCAAT	2	10	642708	642717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007946	CGTAA	2	10	644504	644513	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007946	AGCAA	2	10	656806	656815	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007946	GTGTT	2	10	661754	661763	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007946	CAGGG	2	10	677441	677450	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_007946	GGCGT	2	10	683790	683799	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007946	TCGCG	2	10	691804	691813	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_007946	GTCGT	2	10	744153	744162	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007946	GATGC	2	10	768998	769007	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007946	ACATA	2	10	798971	798980	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007946	AGCGC	2	10	801999	802008	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_007946	GATGC	2	10	804410	804419	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007946	AAAAC	2	10	811701	811710	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007946	TATAT	2	10	815743	815752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007946	CAGGG	2	10	839281	839290	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007946	AGTAA	2	10	851123	851132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007946	TGTAA	2	10	895991	896000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007946	ATTTT	2	10	911230	911239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007946	CATGC	2	10	919602	919611	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007946	CGCTT	2	10	934807	934816	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007946	GCAAC	2	10	962136	962145	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_007946	TTCAC	2	10	976105	976114	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_007946	TTGTT	2	10	1002023	1002032	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007946	AGCGA	2	10	1003363	1003372	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007946	ATGAC	2	10	1005103	1005112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007946	TTTTC	2	10	1012995	1013004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007946	TTATT	2	10	1013805	1013814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007946	TTCTT	2	10	1015738	1015747	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007946	GTACA	2	10	1018275	1018284	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007946	TTTTA	2	10	1018430	1018439	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007946	CTTAT	2	10	1028936	1028945	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007946	TAAAA	2	10	1039533	1039542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007946	GGAGG	2	10	1052383	1052392	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007946	AAGGA	2	10	1052469	1052478	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007946	CAATA	2	10	1086007	1086016	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007946	TGAGG	2	10	1088008	1088017	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007946	GTTAT	2	10	1088080	1088089	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007946	TGTAA	2	10	1119615	1119624	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007946	ATAAC	2	10	1122501	1122510	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007946	TGGTA	2	10	1127231	1127240	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007946	GATCG	2	10	1154238	1154247	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_007946	GTCAT	2	10	1165655	1165664	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007946	TAAAA	2	10	1166161	1166170	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007946	TGCAG	2	10	1174358	1174367	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007946	GGGGA	2	10	1235508	1235517	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007946	CAGTG	2	10	1247168	1247177	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007946	CGATG	2	10	1260085	1260094	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007946	ATTAA	2	10	1290529	1290538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007946	AAGGA	2	10	1293828	1293837	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007946	TTTAG	2	10	1294183	1294192	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007946	ATTTT	2	10	1296734	1296743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007946	CTGGT	2	10	1296938	1296947	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007946	TATAA	2	10	1300959	1300968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007946	ATAAA	2	10	1324189	1324198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007946	GAAAA	2	10	1329581	1329590	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007946	CTTCA	2	10	1344802	1344811	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_007946	TTATC	2	10	1352120	1352129	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007946	ACCGT	2	10	1363572	1363581	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_007946	TGGGG	2	10	1394189	1394198	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007946	GTTTT	2	10	1400341	1400350	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007946	CAGTA	2	10	1403077	1403086	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_007946	GCCAG	2	10	1447651	1447660	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_007946	TTTGC	2	10	1456630	1456639	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007946	TTTAT	2	10	1489473	1489482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007946	CAGGA	2	10	1492519	1492528	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007946	AGTAC	2	10	1510113	1510122	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007946	TTAAT	2	10	1512828	1512837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007946	CGATC	2	10	1526532	1526541	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_007946	AATAA	2	10	1529636	1529645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007946	ATCTA	2	10	1529771	1529780	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007946	GTAAT	2	10	1531016	1531025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007946	TTATT	2	10	1533156	1533165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007946	ATTTT	2	10	1533390	1533399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007946	CATTG	2	10	1533409	1533418	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007946	CAGGG	2	10	1551348	1551357	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007946	ACGTA	2	10	1565710	1565719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007946	TTTAA	2	10	1582493	1582502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007946	ACGGC	2	10	1582687	1582696	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_007946	ATATT	2	10	1600385	1600394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007946	AAGCG	2	10	1603653	1603662	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007946	GTAAA	2	10	1634845	1634854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007946	TTTAA	2	10	1643732	1643741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007946	AAAAT	2	10	1647397	1647406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007946	ATATC	2	10	1682297	1682306	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007946	AAAAC	2	10	1684255	1684264	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007946	CATCC	2	10	1691035	1691044	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_007946	TGACA	2	10	1701019	1701028	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007946	TCCCG	2	10	1712323	1712332	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_007946	AAAGT	2	10	1713986	1713995	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007946	ATTAA	2	10	1718637	1718646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007946	TGGTT	2	10	1728827	1728836	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007946	AAGTG	2	10	1790477	1790486	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_007946	TGAAG	2	10	3288492	3288501	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
280	NC_007946	ACAAA	2	10	3322747	3322756	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_007946	CGCCC	2	10	3329294	3329303	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.