MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 plasmid pUTI89

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007941	TGGC	2	8	1156	1163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007941	CATT	2	8	2559	2566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007941	GACA	2	8	2600	2607	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007941	CTGG	2	8	2828	2835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007941	ATCA	2	8	3003	3010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007941	TGAA	2	8	4931	4938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007941	CTGC	2	8	5791	5798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007941	GCCT	2	8	5851	5858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007941	TGGC	2	8	14517	14524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007941	CAGC	2	8	15431	15438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007941	CCAC	2	8	16211	16218	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_007941	TTCC	2	8	16376	16383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007941	TTCT	2	8	18986	18993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007941	TAGA	2	8	19344	19351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007941	AAAT	2	8	19630	19637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007941	GTAC	2	8	19971	19978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007941	AAAC	2	8	20059	20066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007941	CTGG	2	8	20116	20123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007941	ACGT	2	8	20735	20742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007941	GCCG	2	8	20803	20810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007941	CAAG	2	8	20888	20895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007941	CATT	2	8	21028	21035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007941	TAAT	2	8	21052	21059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007941	AATA	2	8	21068	21075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007941	TAAT	2	8	22876	22883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007941	TTGT	2	8	26677	26684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007941	GGAA	2	8	30261	30268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007941	GTAT	2	8	32897	32904	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007941	CGGC	2	8	34548	34555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007941	ATGC	2	8	34598	34605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007941	CTGA	2	8	34651	34658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007941	CATC	2	8	34818	34825	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007941	CGCC	2	8	36895	36902	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_007941	GCTG	2	8	37071	37078	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007941	ATTT	2	8	41183	41190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007941	TACT	2	8	41439	41446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007941	TCAT	2	8	41906	41913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007941	TCAT	2	8	41960	41967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007941	TCAT	2	8	42048	42055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007941	GATG	2	8	42120	42127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007941	AAAT	2	8	42292	42299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007941	AGAT	2	8	43280	43287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007941	CCAG	2	8	43408	43415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007941	GTAA	2	8	43937	43944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007941	ATTT	2	8	43957	43964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007941	CATG	2	8	44062	44069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007941	TCAC	2	8	45386	45393	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007941	ACTG	2	8	46538	46545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007941	ACTT	2	8	46611	46618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007941	TCAT	2	8	46762	46769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007941	GTCT	2	8	46956	46963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007941	GTCG	2	8	47393	47400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007941	TGCC	2	8	47584	47591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007941	AATT	2	8	48701	48708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007941	TGAT	2	8	48819	48826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007941	TGTC	2	8	48919	48926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007941	GATG	2	8	49129	49136	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007941	AGGT	2	8	49440	49447	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007941	GATT	2	8	49579	49586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007941	GTTT	2	8	50400	50407	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007941	ATAA	2	8	50456	50463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007941	CAGC	2	8	54783	54790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007941	TGTA	2	8	56536	56543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007941	GGTG	2	8	56564	56571	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007941	GCGG	2	8	64589	64596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007941	ACGG	2	8	65256	65263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007941	ATTT	2	8	66661	66668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007941	GTCA	2	8	66700	66707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007941	TGAC	2	8	70500	70507	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007941	GGCG	2	8	74454	74461	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007941	GGGA	2	8	75700	75707	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007941	ATTT	2	8	77559	77566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007941	AAAT	2	8	77776	77783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007941	ATTA	2	8	78283	78290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007941	AGAA	2	8	85743	85750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007941	AAAT	2	8	102217	102224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007941	AAAT	2	8	102248	102255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007941	GGAA	2	8	113011	113018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007941	TCAT	2	8	113955	113962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007941	TAAT	2	8	114204	114211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.