MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	CCTC	2	8	568	575	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_007414	AG	4	8	576	583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007414	ATT	2	6	648	653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007414	ATA	2	6	661	666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007414	T	7	7	968	974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007414	T	6	6	1022	1027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007414	TTA	2	6	1080	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007414	GT	3	6	1087	1092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007414	TCAT	2	8	1629	1636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007414	TAAT	2	8	1878	1885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007414	A	6	6	2427	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007414	GTA	2	6	2435	2440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007414	GAG	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007414	AGA	2	6	2764	2769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007414	TGGC	2	8	2805	2812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007414	CAA	2	6	2941	2946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007414	CCT	2	6	3904	3909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007414	AAT	2	6	3913	3918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007414	CCG	2	6	3954	3959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007414	A	6	6	3966	3971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007414	CAC	2	6	3976	3981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007414	TCA	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007414	C	6	6	4025	4030	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_007414	GCC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007414	ACT	2	6	4195	4200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007414	CATT	2	8	4207	4214	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007414	A	8	8	4216	4223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007414	CCTGT	2	10	4237	4246	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007414	GACA	2	8	4248	4255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007414	CAT	3	9	4455	4463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007414	TCT	2	6	4473	4478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007414	TCG	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007414	CT	3	6	4592	4597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007414	G	10	10	4631	4640	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007414	ATCA	2	8	4654	4661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007414	CGG	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007414	ATT	2	6	4745	4750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007414	TG	4	8	5372	5379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007414	ATT	2	6	5420	5425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007414	CCG	2	6	5749	5754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_007414	CGG	2	6	5815	5820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007414	T	6	6	5821	5826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007414	TG	3	6	5855	5860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007414	CCG	2	6	5899	5904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007414	CTTC	2	8	5945	5952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007414	TGC	2	6	5953	5958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007414	ACA	2	6	7336	7341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007414	TGA	2	6	9590	9595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007414	CCTC	2	8	9605	9612	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_007414	GTTG	2	8	10021	10028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007414	ATAC	2	8	10044	10051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007414	A	6	6	10166	10171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007414	AACA	2	8	11124	11131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007414	GAT	2	6	11159	11164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007414	AC	3	6	11188	11193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007414	TGCC	2	8	15186	15193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007414	GA	3	6	15208	15213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007414	T	6	6	15280	15285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007414	AGC	2	6	15434	15439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007414	TCA	2	6	15449	15454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007414	CCA	2	6	15485	15490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007414	TCA	2	6	15557	15562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007414	TAT	2	6	15902	15907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007414	AATA	2	8	16015	16022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007414	TCT	2	6	16322	16327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007414	ATT	2	6	16330	16335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007414	TAT	3	9	16349	16357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007414	ATT	2	6	16363	16368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007414	A	8	8	16405	16412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007414	AAT	2	6	16422	16427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007414	AAAT	2	8	16440	16447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007414	AGC	2	6	16478	16483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007414	AATA	2	8	16507	16514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007414	ACA	2	6	16529	16534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007414	AGG	2	6	16754	16759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007414	TCG	2	6	16770	16775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007414	AGA	2	6	16803	16808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007414	TGT	2	6	16860	16865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007414	G	6	6	16869	16874	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007414	TC	3	6	17064	17069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007414	T	6	6	17099	17104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007414	A	6	6	17187	17192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007414	TGT	2	6	17197	17202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007414	AAT	2	6	17234	17239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007414	TG	3	6	17247	17252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007414	TGT	2	6	17271	17276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007414	ATT	2	6	17312	17317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007414	T	7	7	17316	17322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007414	CGG	2	6	19251	19256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007414	AGG	2	6	21094	21099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007414	AC	3	6	22175	22180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007414	TCAG	2	8	22198	22205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007414	A	7	7	22222	22228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007414	ACCA	2	8	22233	22240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007414	A	6	6	22243	22248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007414	T	21	21	22658	22678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007414	T	6	6	22687	22692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007414	GTTTT	2	10	22698	22707	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007414	TGT	2	6	22722	22727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007414	CA	3	6	22739	22744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007414	TGCT	2	8	22813	22820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007414	GCTT	2	8	22838	22845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007414	T	7	7	22844	22850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007414	ATA	3	9	22858	22866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007414	AT	3	6	22910	22915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007414	A	6	6	22978	22983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007414	CTT	2	6	31376	31381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007414	AGG	2	6	36078	36083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007414	TAA	2	6	36942	36947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007414	TGT	2	6	36972	36977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007414	GTG	2	6	37498	37503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007414	ATG	2	6	37513	37518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007414	GTAA	2	8	38796	38803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007414	AG	3	6	38857	38862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007414	A	6	6	38880	38885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007414	TAT	2	6	38909	38914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007414	TAA	2	6	39036	39041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007414	ATCA	2	8	39091	39098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007414	TATAA	2	10	39108	39117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007414	AT	3	6	39151	39156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007414	TAT	3	9	39154	39162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007414	TGT	2	6	39169	39174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007414	GA	3	6	39184	39189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007414	CTT	2	6	39222	39227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007414	TA	3	6	39256	39261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007414	TTAT	2	8	39288	39295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007414	AGG	2	6	42828	42833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007414	AGG	2	6	42847	42852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007414	TA	3	6	46432	46437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007414	AAT	2	6	46476	46481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007414	TA	3	6	47062	47067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007414	TAT	2	6	47094	47099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007414	G	6	6	47114	47119	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007414	T	6	6	47143	47148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007414	CAAA	2	8	47417	47424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007414	GAA	2	6	47620	47625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007414	CTG	2	6	47658	47663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007414	AGTG	2	8	47672	47679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007414	CTT	2	6	47682	47687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007414	TGGA	2	8	47791	47798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007414	GTGC	2	8	47832	47839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007414	CGCC	2	8	47850	47857	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_007414	TA	3	6	48284	48289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007414	CAG	2	6	48299	48304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007414	ACATA	2	10	48310	48319	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007414	TA	3	6	48332	48337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007414	CAGCT	2	10	48426	48435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_007414	GCA	2	6	48440	48445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_007414	CACT	2	8	48482	48489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007414	ATA	2	6	48497	48502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007414	GT	3	6	49614	49619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007414	ACTG	2	8	49633	49640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_007414	ACTT	2	8	49706	49713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_007414	TCAT	2	8	49857	49864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_007414	TACA	2	8	51447	51454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_007414	CTCTTT	2	12	51455	51466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_007414	ATA	2	6	51802	51807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_007414	GC	3	6	51820	51825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_007414	AT	3	6	51845	51850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_007414	GTG	2	6	53265	53270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_007414	TC	3	6	54610	54615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_007414	GGT	2	6	54853	54858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_007414	TCA	2	6	55046	55051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_007414	TGA	2	6	55053	55058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_007414	TTA	2	6	55076	55081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_007414	GT	3	6	55101	55106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_007414	TCT	2	6	55141	55146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_007414	TTC	2	6	55180	55185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_007414	GCG	2	6	55230	55235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_007414	ATA	2	6	55246	55251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_007414	CTT	2	6	55271	55276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_007414	AAC	2	6	55307	55312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_007414	T	6	6	55320	55325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_007414	TGT	2	6	55342	55347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_007414	TAA	2	6	55372	55377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_007414	A	7	7	55376	55382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_007414	TC	3	6	57633	57638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_007414	TCG	2	6	57661	57666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_007414	TCG	2	6	57704	57709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_007414	ATT	2	6	57715	57720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_007414	GTC	2	6	57900	57905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_007414	GAG	2	6	58207	58212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_007414	AAT	2	6	58261	58266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_007414	TGT	2	6	58614	58619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_007414	AAG	2	6	58703	58708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_007414	GA	3	6	58812	58817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_007414	CTC	2	6	61613	61618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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191	NC_007414	CCGG	2	8	61680	61687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_007414	ACGGG	2	10	61690	61699	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
193	NC_007414	TGA	2	6	61759	61764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
194	NC_007414	GAC	2	6	61809	61814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_007414	TG	3	6	62680	62685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
196	NC_007414	CGC	2	6	63298	63303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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198	NC_007414	CGC	2	6	64178	64183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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201	NC_007414	CGC	2	6	64312	64317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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256	NC_007414	CAG	2	6	88919	88924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.