MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ehrlichia canis str. Jake chromosome

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007354	TGTTTT	2	12	7484	7495	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007354	ATAAAC	2	12	28751	28762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007354	AATATT	2	12	46663	46674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007354	TAATTT	2	12	48831	48842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007354	TTTAAA	2	12	49913	49924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007354	TATTGG	2	12	51470	51481	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007354	ATATTT	2	12	53766	53777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007354	TTTTCA	2	12	56301	56312	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007354	ATGTTA	2	12	58041	58052	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007354	ATTTGT	2	12	67812	67823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007354	TTTTTA	2	12	69662	69673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007354	CCGGAA	2	12	75724	75735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007354	TATGTT	2	12	93423	93434	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007354	CATGTA	2	12	116009	116020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007354	GGTACT	2	12	117976	117987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007354	AATTTG	2	12	117999	118010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007354	AATTTT	2	12	118532	118543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007354	GTTATT	2	12	118575	118586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007354	TATTGC	2	12	133101	133112	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007354	GATACA	2	12	135520	135531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007354	TGGTAT	2	12	152514	152525	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007354	AATATA	2	12	162220	162231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007354	TATTGT	2	12	168734	168745	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007354	TTTATC	2	12	168882	168893	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007354	AAATTT	2	12	176749	176760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007354	AAATTA	2	12	201664	201675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007354	TTTTGT	2	12	204209	204220	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007354	TTTTAT	2	12	205520	205531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007354	TGATGG	2	12	223135	223146	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007354	TTGCAG	2	12	229295	229306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007354	TATACA	2	12	236530	236541	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007354	TATTTG	2	12	241116	241127	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007354	ATTTTA	2	12	247828	247839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007354	AATTTT	2	12	256758	256769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007354	GAAATT	2	12	259331	259342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007354	TAGTTG	2	12	267651	267662	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007354	TGGTAG	2	12	267702	267713	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007354	ATATAC	2	12	270453	270464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007354	AATGTG	2	12	271612	271623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007354	TGAATA	2	12	275726	275737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007354	AAGTAT	2	12	277078	277089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007354	AGTTTA	2	12	285809	285820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007354	TATAGT	2	12	290043	290054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007354	ATTGAG	2	12	296357	296368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007354	ATTTGA	2	12	300081	300092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007354	GAAAAT	2	12	308955	308966	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007354	ATTTTA	2	12	311382	311393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007354	CAAAAT	2	12	331071	331082	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007354	AAGATA	2	12	332824	332835	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007354	ATTCTA	2	12	385113	385124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007354	CTTGCT	2	12	390074	390085	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007354	TTGATT	2	12	405420	405431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007354	TTGTTA	2	12	422759	422770	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007354	TATAAA	2	12	426951	426962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007354	CTAGTA	2	12	449353	449364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007354	GTATAA	2	12	453924	453935	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007354	GTACTA	2	12	467917	467928	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007354	TAGTTG	2	12	490224	490235	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007354	TATTAA	2	12	512292	512303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007354	TTATGT	2	12	520758	520769	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007354	TATATT	2	12	522729	522740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007354	GTAAGT	2	12	532355	532366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007354	AATAGT	2	12	535979	535990	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007354	ATTTTT	2	12	543742	543753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007354	TGATAT	2	12	563581	563592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007354	ATAGAT	2	12	567487	567498	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007354	TTTTAT	2	12	568268	568279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007354	GTATTA	2	12	589752	589763	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007354	AAAGTT	2	12	609690	609701	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007354	TTATAA	2	12	613520	613531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007354	TGAAAA	2	12	617804	617815	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007354	AAATCT	2	12	627213	627224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007354	AAATAT	2	12	630219	630230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007354	TAAATT	2	12	633088	633099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007354	TGTAAT	2	12	633489	633500	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007354	TTTATT	2	12	641257	641268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007354	TTTACT	2	12	641301	641312	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007354	TTAATA	2	12	650766	650777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007354	AAAATA	2	12	679569	679580	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007354	AAAATA	2	12	704544	704555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007354	AAAACA	2	12	705827	705838	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007354	TATGAC	2	12	705931	705942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007354	CTGATA	2	12	740914	740925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007354	GTTTTT	2	12	755874	755885	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007354	CTTTGA	2	12	781672	781683	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007354	ATTTTA	2	12	796298	796309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007354	TAAAAA	2	12	800923	800934	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007354	TTTAAA	2	12	807801	807812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007354	ATTATA	2	12	808132	808143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007354	TTTAAA	2	12	815058	815069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007354	TGATAA	2	12	818975	818986	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007354	ATTTTT	2	12	819359	819370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007354	AAAATT	2	12	831649	831660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007354	AATACC	2	12	837357	837368	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007354	ATATTA	2	12	847590	847601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007354	TTATCA	2	12	847980	847991	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007354	CAACAT	2	12	872911	872922	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007354	TAACGT	2	12	873042	873053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007354	TAAAAA	2	12	877741	877752	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007354	ATTACA	2	12	880436	880447	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007354	CAATAT	2	12	886560	886571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007354	ATTTAT	2	12	895549	895560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007354	AAAATA	2	12	898559	898570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007354	ATAACT	2	12	908409	908420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007354	CATACT	2	12	918982	918993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007354	TTTTAT	2	12	923337	923348	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007354	ACATAC	2	12	939731	939742	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007354	CTAAAT	2	12	943509	943520	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007354	TTATTT	2	12	955836	955847	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007354	TAAAAG	2	12	958357	958368	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007354	TTTCAA	2	12	963315	963326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007354	AACATA	2	12	983933	983944	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007354	TTTATA	2	12	986711	986722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007354	AATATC	2	12	995130	995141	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007354	TTTAAA	2	12	1002509	1002520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007354	TTCTAA	2	12	1030569	1030580	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007354	TTCTAA	2	12	1030651	1030662	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007354	ATGACT	2	12	1035051	1035062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007354	AATTTA	2	12	1039102	1039113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007354	ATATAC	2	12	1040783	1040794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007354	ATTTCC	2	12	1045192	1045203	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007354	TTTTAC	2	12	1071137	1071148	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007354	CAATTA	2	12	1072320	1072331	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_007354	CAATAT	2	12	1085345	1085356	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_007354	TAAGTA	2	12	1128128	1128139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007354	GATAAA	2	12	1136656	1136667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007354	TATAAA	2	12	1140304	1140315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007354	TTAATA	2	12	1144260	1144271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007354	TATACA	2	12	1159225	1159236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_007354	ACAAAA	2	12	1162914	1162925	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_007354	TTCATT	2	12	1167190	1167201	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_007354	CATAAA	2	12	1237743	1237754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007354	ATAACC	2	12	1249260	1249271	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007354	ACAAAA	2	12	1255334	1255345	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_007354	TTCATT	2	12	1276130	1276141	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_007354	TCATTG	2	12	1277292	1277303	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_007354	TAAACA	2	12	1289630	1289641	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_007354	TTTACA	2	12	1291168	1291179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_007354	TAAAAT	2	12	1296202	1296213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.