MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ehrlichia canis str. Jake chromosome

Total Repeats: 524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007354	TGTAT	2	10	11	20	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007354	TCTTT	2	10	6848	6857	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007354	TTACT	2	10	7439	7448	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007354	ATTAA	2	10	27336	27345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007354	ATACT	2	10	27370	27379	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007354	AAGTA	2	10	27447	27456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007354	TTTGA	2	10	28711	28720	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007354	AAATT	2	10	32880	32889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007354	AAATT	2	10	33140	33149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007354	TATTT	2	10	38721	38730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007354	TATTT	2	10	38918	38927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007354	TATTT	2	10	39126	39135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007354	TATTT	2	10	39322	39331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007354	TATTT	2	10	39519	39528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007354	AAATT	2	10	43166	43175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007354	ATTTT	2	10	43698	43707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007354	CAATA	2	10	46399	46408	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007354	TAATA	2	10	46479	46488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007354	ATTAT	2	10	46553	46562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007354	TTTAA	2	10	46582	46591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007354	TTTAA	2	10	49840	49849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007354	TCCAT	2	10	53850	53859	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_007354	ATGTC	2	10	56116	56125	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007354	AATTT	2	10	61076	61085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007354	TTATG	2	10	61414	61423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007354	TATAA	2	10	62572	62581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007354	GTTTT	2	10	64463	64472	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007354	CTTTT	2	10	66750	66759	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007354	ATGTA	2	10	69465	69474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007354	TGCTA	2	10	75299	75308	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007354	GTATG	2	10	75610	75619	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007354	CAATA	2	10	75684	75693	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007354	AATAA	2	10	76757	76766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007354	TTATA	2	10	90078	90087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007354	GCTAT	2	10	109764	109773	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007354	GTTTT	2	10	116057	116066	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007354	GATAT	2	10	120018	120027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007354	ATCTT	2	10	121962	121971	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007354	TATAT	2	10	122195	122204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007354	TGATT	2	10	127492	127501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007354	ATTAC	2	10	132841	132850	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007354	ATTAT	2	10	140431	140440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007354	TTGTG	2	10	143937	143946	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007354	CTGTG	2	10	145295	145304	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007354	TTAAT	2	10	145392	145401	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007354	AGTAA	2	10	145677	145686	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007354	AGTAA	2	10	145895	145904	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007354	AGTAA	2	10	146114	146123	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007354	TCTTA	2	10	148498	148507	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007354	ATGTT	2	10	149186	149195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007354	TATGA	2	10	152312	152321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007354	CTATT	2	10	160732	160741	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007354	AATCA	2	10	160822	160831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007354	TTTGG	2	10	160881	160890	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007354	GTAAA	2	10	162911	162920	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007354	TGTAT	2	10	168992	169001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007354	TAATA	2	10	170311	170320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007354	TATTT	2	10	173253	173262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007354	TATTG	2	10	175423	175432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007354	ATTAA	2	10	177008	177017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007354	ATATA	2	10	184431	184440	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007354	TTTAG	2	10	184668	184677	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007354	TTTAA	2	10	184682	184691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007354	ATTGT	2	10	190470	190479	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007354	TTATG	2	10	190512	190521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007354	TGTTT	2	10	192988	192997	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007354	ATTTT	2	10	197871	197880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007354	ACTTT	2	10	198473	198482	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_007354	AAATG	2	10	201144	201153	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007354	TGTGT	2	10	201469	201478	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007354	TAATT	2	10	201689	201698	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007354	TATTT	2	10	204420	204429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007354	GTTAA	2	10	205388	205397	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007354	TGTTA	2	10	205450	205459	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007354	TAAAA	2	10	207419	207428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007354	TATAT	2	10	207694	207703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007354	ATACT	2	10	207925	207934	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007354	TTATT	2	10	213208	213217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007354	ATATT	2	10	223246	223255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007354	GGTAA	2	10	223436	223445	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007354	ATATA	2	10	223948	223957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007354	ATAAA	2	10	224679	224688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007354	ACTTA	2	10	229391	229400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007354	TTACT	2	10	233663	233672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_007354	TAATA	2	10	233922	233931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007354	ATTTA	2	10	235532	235541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007354	TATAA	2	10	237025	237034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007354	TTGTG	2	10	239249	239258	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007354	TAAAA	2	10	257220	257229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007354	GTAAA	2	10	257445	257454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007354	GTTAT	2	10	257683	257692	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007354	TGTAT	2	10	258973	258982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007354	ATGTT	2	10	260061	260070	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007354	GTCTT	2	10	267987	267996	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007354	GAAAT	2	10	271556	271565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007354	AATAT	2	10	276865	276874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007354	AGAAT	2	10	277153	277162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007354	ATTAA	2	10	284352	284361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007354	TAGAA	2	10	285821	285830	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007354	TATTT	2	10	285880	285889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007354	CTAGA	2	10	286544	286553	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_007354	TTGTA	2	10	286745	286754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007354	TCGTG	2	10	286968	286977	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007354	TATTT	2	10	287509	287518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007354	GTATA	2	10	293360	293369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007354	AGTTA	2	10	296277	296286	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007354	GTAAT	2	10	296771	296780	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007354	AATCT	2	10	306315	306324	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007354	GTTGC	2	10	306638	306647	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007354	TTATG	2	10	306826	306835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007354	TTGTT	2	10	306999	307008	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007354	ATGTT	2	10	307226	307235	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007354	AGTGT	2	10	307288	307297	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007354	GTTGT	2	10	307480	307489	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007354	GTTAT	2	10	318722	318731	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007354	GCTTA	2	10	318907	318916	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007354	ATGTT	2	10	319049	319058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007354	TTTTG	2	10	319473	319482	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007354	TGTAG	2	10	326907	326916	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007354	ATTTT	2	10	326978	326987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007354	AATGA	2	10	330086	330095	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007354	TTTAA	2	10	332542	332551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007354	ATCTT	2	10	337903	337912	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007354	TGTAT	2	10	338124	338133	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007354	AGAAA	2	10	338197	338206	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007354	TGATG	2	10	347481	347490	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007354	TAATG	2	10	347670	347679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007354	ATTAT	2	10	349204	349213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007354	TTTTA	2	10	360764	360773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007354	ACATA	2	10	364369	364378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007354	TATGT	2	10	364456	364465	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007354	ATAGT	2	10	364761	364770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007354	ATTCA	2	10	366090	366099	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007354	AGTAG	2	10	366236	366245	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007354	GTTAT	2	10	370343	370352	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007354	GTTAT	2	10	370486	370495	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007354	GTTAT	2	10	370628	370637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007354	GTTAT	2	10	370770	370779	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007354	TTGAA	2	10	370911	370920	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007354	ATGTT	2	10	374643	374652	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007354	GTTTA	2	10	383054	383063	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007354	GATTG	2	10	383064	383073	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007354	ATGTT	2	10	383121	383130	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007354	ATTTA	2	10	383479	383488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007354	ATTAT	2	10	389745	389754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007354	ATATA	2	10	393355	393364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007354	TAATG	2	10	398527	398536	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007354	TAACA	2	10	398631	398640	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_007354	ATATT	2	10	403247	403256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_007354	GTAAT	2	10	404934	404943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007354	ATTTT	2	10	406848	406857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007354	ATTGA	2	10	411388	411397	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_007354	ATGTT	2	10	416752	416761	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_007354	ATATT	2	10	426876	426885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_007354	TAAAG	2	10	426990	426999	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_007354	TATTT	2	10	436027	436036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_007354	GTTTA	2	10	442055	442064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_007354	ATTGT	2	10	442141	442150	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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