MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ehrlichia canis str. Jake chromosome

Total Repeats: 1529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007354	ACAA	2	8	183	190	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007354	ACTT	2	8	246	253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007354	CAAA	2	8	2377	2384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007354	TGTA	2	8	2425	2432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007354	AAAT	2	8	2475	2482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007354	TTTA	2	8	7013	7020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007354	ATAC	2	8	7053	7060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007354	ATTA	2	8	7240	7247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007354	TTAA	2	8	7317	7324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007354	ATAG	2	8	7355	7362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007354	TTTA	2	8	10314	10321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007354	ATTT	2	8	14553	14560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007354	AATA	2	8	16521	16528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007354	AATT	2	8	17132	17139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007354	ATAA	2	8	17274	17281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007354	TTGC	2	8	19463	19470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007354	ACTT	2	8	19494	19501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007354	TAAA	2	8	19629	19636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007354	AAAC	2	8	23042	23049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007354	ATTT	3	12	26008	26019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007354	TAAA	2	8	27296	27303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007354	CTTT	2	8	27349	27356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007354	TGTA	2	8	30265	30272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007354	ATTT	2	8	30887	30894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007354	TGTT	2	8	31202	31209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007354	AATT	2	8	33402	33409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007354	GTAA	2	8	33637	33644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007354	AATT	2	8	33661	33668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007354	CTAA	2	8	33868	33875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007354	ATTA	2	8	34020	34027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007354	ATAA	2	8	38703	38710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007354	ATAA	2	8	38900	38907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007354	ATAA	2	8	39108	39115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007354	ATAA	2	8	39304	39311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007354	ATAA	2	8	39501	39508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007354	TATT	2	8	43087	43094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007354	TCTA	2	8	46240	46247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007354	GTTT	2	8	46518	46525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007354	ATGT	2	8	46816	46823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007354	TTTA	2	8	46927	46934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007354	GCTT	2	8	47738	47745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007354	AGTA	2	8	51960	51967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007354	GTCA	2	8	52157	52164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007354	TGTT	2	8	52327	52334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007354	TTTA	2	8	53916	53923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007354	AGTA	2	8	54180	54187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007354	TATT	2	8	57507	57514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007354	TTAA	2	8	57526	57533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007354	GTTT	2	8	60947	60954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007354	TAAT	2	8	61175	61182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007354	TTAG	2	8	61191	61198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007354	ATTT	2	8	61259	61266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007354	TTGT	2	8	62236	62243	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007354	AGAT	2	8	62429	62436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007354	TAAA	2	8	62648	62655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007354	CAAT	2	8	64422	64429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007354	TGTC	2	8	66597	66604	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007354	CATT	2	8	66726	66733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007354	TGTA	2	8	72812	72819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007354	TGTA	2	8	73000	73007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007354	ATTA	2	8	73189	73196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007354	TTAT	3	12	74681	74692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007354	ATTG	2	8	74898	74905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007354	TAAA	2	8	75482	75489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007354	AAAC	2	8	76714	76721	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007354	TGAT	2	8	76824	76831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007354	AATA	2	8	76933	76940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007354	TAAT	2	8	76983	76990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007354	TTTA	2	8	77051	77058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007354	GCTT	2	8	89633	89640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007354	TTAT	2	8	93163	93170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007354	AATC	2	8	101776	101783	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007354	GTAA	2	8	101835	101842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007354	GTAT	2	8	102082	102089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007354	TATT	2	8	104552	104559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007354	ATTA	2	8	107023	107030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007354	TTCC	2	8	109677	109684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007354	TAGT	2	8	109747	109754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007354	AAGA	2	8	110176	110183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007354	AGTA	2	8	110327	110334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007354	TAAA	2	8	112409	112416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007354	TATT	2	8	115736	115743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007354	AATT	2	8	116023	116030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007354	TTAT	2	8	117965	117972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007354	TGTT	2	8	118227	118234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007354	CTTT	2	8	118251	118258	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007354	ATTT	2	8	118392	118399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007354	TATT	2	8	119858	119865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007354	CTTA	2	8	120111	120118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_007354	TAGT	2	8	121546	121553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007354	ATTT	2	8	121839	121846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007354	TTAA	2	8	121872	121879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007354	TTTA	2	8	121884	121891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007354	ACAA	2	8	122040	122047	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007354	TATT	2	8	122217	122224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007354	TAAA	2	8	123474	123481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007354	AGTA	2	8	131986	131993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007354	AGTT	2	8	132033	132040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007354	CATT	2	8	132418	132425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007354	TTTA	2	8	132452	132459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007354	TTTA	2	8	133237	133244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007354	TATG	2	8	133303	133310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007354	ATTA	2	8	133334	133341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007354	ACTT	2	8	133357	133364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007354	AAAC	2	8	135664	135671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007354	GTTA	2	8	135809	135816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007354	AGTA	2	8	136387	136394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007354	GCAA	2	8	138886	138893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007354	TAAA	2	8	139147	139154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007354	TAGA	2	8	139242	139249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007354	AAAT	2	8	140536	140543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007354	TTAA	2	8	141248	141255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007354	TTTA	2	8	143743	143750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007354	ATTG	2	8	143802	143809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007354	TGAA	2	8	143957	143964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007354	TTTA	2	8	148098	148105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007354	TGTT	2	8	148583	148590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007354	ATGA	2	8	148952	148959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007354	TTGA	2	8	148972	148979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007354	TGAA	2	8	149145	149152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007354	ACAA	2	8	151593	151600	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007354	TATT	2	8	152271	152278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007354	GTTT	2	8	152328	152335	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007354	ACTT	2	8	152746	152753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007354	TATT	2	8	153862	153869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007354	TTTA	2	8	157747	157754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007354	GTTT	2	8	157926	157933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007354	ATTA	2	8	159159	159166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007354	TAAG	2	8	159189	159196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007354	GTAT	2	8	159650	159657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007354	GTTT	2	8	159696	159703	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007354	TATT	3	12	160738	160749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007354	TACT	2	8	161031	161038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007354	TAAT	2	8	162250	162257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007354	TATT	2	8	162445	162452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007354	AAAG	2	8	162653	162660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007354	ATAA	2	8	162764	162771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007354	ATTT	2	8	162864	162871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007354	TGAT	2	8	163156	163163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007354	TGTT	2	8	163164	163171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007354	TTAT	2	8	163211	163218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007354	ATGT	2	8	163392	163399	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007354	TTAA	2	8	163400	163407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007354	ATTA	2	8	164734	164741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007354	TAAT	2	8	164795	164802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007354	GTAA	2	8	165997	166004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007354	TGTT	2	8	166252	166259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007354	TTAT	2	8	166374	166381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007354	TTTG	2	8	167384	167391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007354	ACGT	2	8	167605	167612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007354	CCAT	2	8	167646	167653	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_007354	TTTA	2	8	173075	173082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007354	AATT	2	8	173263	173270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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