MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ehrlichia canis str. Jake chromosome

Total Repeats: 11338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007354	TGTAT	2	10	11	20	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007354	AAC	2	6	36	41	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007354	TAC	2	6	64	69	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007354	TAA	2	6	73	78	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007354	A	6	6	103	108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007354	ACAA	2	8	183	190	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007354	ACTT	2	8	246	253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007354	AT	3	6	303	308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007354	ATA	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007354	CAAA	2	8	2377	2384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007354	TGTA	2	8	2425	2432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007354	T	7	7	2468	2474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007354	AAAT	2	8	2475	2482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007354	TAA	2	6	2491	2496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007354	TAA	2	6	2504	2509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007354	A	6	6	2516	2521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007354	ATT	2	6	2542	2547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007354	TA	3	6	2551	2556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007354	T	6	6	2582	2587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007354	T	6	6	5560	5565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007354	TA	3	6	5574	5579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007354	AGA	2	6	5601	5606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007354	T	6	6	6784	6789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007354	T	6	6	6812	6817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007354	GCA	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007354	CTA	2	6	6842	6847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007354	TCTTT	2	10	6848	6857	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007354	TA	4	8	6874	6881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007354	TCT	2	6	6947	6952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007354	ATT	2	6	6960	6965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007354	TAT	2	6	6971	6976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007354	A	8	8	6992	6999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007354	AT	3	6	7005	7010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007354	TTTA	2	8	7013	7020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007354	ATAC	2	8	7053	7060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007354	TA	3	6	7069	7074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007354	A	7	7	7106	7112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007354	TAT	2	6	7119	7124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007354	TAT	2	6	7133	7138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007354	ACT	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007354	TA	4	8	7163	7170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007354	TA	3	6	7173	7178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007354	CTT	2	6	7199	7204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007354	A	7	7	7220	7226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007354	ATTA	2	8	7240	7247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007354	TA	3	6	7258	7263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007354	TTAA	2	8	7317	7324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007354	ATAG	2	8	7355	7362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007354	TTACT	2	10	7439	7448	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007354	A	7	7	7460	7466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007354	TGTTTT	2	12	7484	7495	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007354	ATT	2	6	8324	8329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007354	ACA	3	9	8352	8360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007354	TAT	2	6	8383	8388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007354	TAT	2	6	8401	8406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007354	TTTA	2	8	10314	10321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007354	TGT	2	6	10347	10352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007354	TA	5	10	11414	11423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007354	AT	3	6	11493	11498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007354	T	6	6	11519	11524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007354	TAA	2	6	11539	11544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007354	TAT	2	6	11551	11556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007354	CTA	2	6	11566	11571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007354	TG	3	6	11577	11582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007354	TTA	2	6	11730	11735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007354	TA	3	6	11758	11763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007354	TAA	3	9	11794	11802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007354	GTT	2	6	13240	13245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007354	TTA	2	6	13257	13262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007354	T	6	6	14537	14542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007354	ATTT	2	8	14553	14560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007354	TG	3	6	14611	14616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007354	TTG	2	6	14633	14638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007354	ATA	2	6	14657	14662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007354	T	6	6	14713	14718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007354	TAG	2	6	14735	14740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007354	TGT	2	6	14763	14768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007354	T	7	7	15532	15538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007354	TAA	3	9	15540	15548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007354	T	7	7	16495	16501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007354	TAG	2	6	16509	16514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007354	AATA	2	8	16521	16528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007354	A	7	7	16528	16534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007354	TA	3	6	16535	16540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007354	CTA	3	9	16550	16558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007354	TGC	2	6	16572	16577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007354	TGT	2	6	16578	16583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007354	T	6	6	16605	16610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007354	TTA	2	6	17079	17084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007354	ATA	2	6	17085	17090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007354	T	6	6	17114	17119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007354	AATT	2	8	17132	17139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007354	AGG	2	6	17239	17244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007354	TA	3	6	17254	17259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007354	ATAA	2	8	17274	17281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007354	GTA	2	6	19406	19411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007354	TTGC	2	8	19463	19470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007354	TA	3	6	19477	19482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007354	AAG	2	6	19483	19488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007354	ACTT	2	8	19494	19501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007354	TCT	2	6	19570	19575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007354	TAAA	2	8	19629	19636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007354	TA	3	6	19671	19676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007354	GTA	2	6	19681	19686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007354	AT	3	6	19707	19712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007354	ACA	2	6	22007	22012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007354	AAAC	2	8	23042	23049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007354	ATC	2	6	25935	25940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007354	AG	3	6	25996	26001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007354	ATTT	3	12	26008	26019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007354	CCA	2	6	27263	27268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007354	TAAA	2	8	27296	27303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007354	ATTAA	2	10	27336	27345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007354	CTTT	2	8	27349	27356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_007354	ATACT	2	10	27370	27379	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007354	AAT	2	6	27410	27415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007354	AAGTA	2	10	27447	27456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007354	TA	3	6	27490	27495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007354	ATT	2	6	27526	27531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007354	TA	3	6	27559	27564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007354	TTTGA	2	10	28711	28720	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007354	ATAAAC	2	12	28751	28762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007354	TAA	2	6	30141	30146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007354	TAT	2	6	30218	30223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007354	TGTA	2	8	30265	30272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007354	TA	3	6	30318	30323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007354	TTA	2	6	30351	30356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007354	AAT	2	6	30868	30873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007354	TAA	2	6	30877	30882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007354	ATTT	2	8	30887	30894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007354	GAA	2	6	30907	30912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007354	TCT	2	6	30923	30928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007354	ATA	2	6	30939	30944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007354	TGT	2	6	30958	30963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007354	T	6	6	30963	30968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007354	AAT	2	6	31013	31018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007354	TTG	2	6	31026	31031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007354	TG	4	8	31067	31074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007354	GAA	2	6	31103	31108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007354	TG	3	6	31159	31164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007354	TAA	2	6	31172	31177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007354	TGTT	2	8	31202	31209	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007354	ATT	2	6	31224	31229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007354	TAA	2	6	31341	31346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007354	TAA	2	6	31349	31354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007354	T	6	6	31372	31377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007354	T	6	6	31380	31385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007354	GTA	3	9	31445	31453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007354	A	6	6	31494	31499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007354	TAA	2	6	31504	31509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007354	T	6	6	31511	31516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007354	TTA	2	6	31551	31556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_007354	A	7	7	33104	33110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_007354	GTTT	2	8	46518	46525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
290	NC_007354	ATTAT	2	10	46553	46562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_007354	TTTAA	2	10	46582	46591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_007354	TA	4	8	46718	46725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_007354	GTG	3	9	46770	46778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_007354	TAA	2	6	62275	62280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_007354	TCT	2	6	62359	62364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_007354	TTG	2	6	62380	62385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_007354	TA	3	6	62413	62418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_007354	AGAT	2	8	62429	62436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_007354	TAAA	2	8	62648	62655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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