MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006832	TGTTTT	2	12	20101	20112	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006832	ATAAAT	2	12	38820	38831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006832	ATTAAT	2	12	46188	46199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006832	AAGTGT	2	12	57370	57381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006832	TTAAAT	2	12	67134	67145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006832	TATAAA	2	12	70335	70346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006832	TTTATA	2	12	91412	91423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006832	TGTTTT	2	12	94461	94472	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006832	AATATA	2	12	95432	95443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006832	CAATAT	2	12	97108	97119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_006832	TATTAA	2	12	100647	100658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006832	TTAATG	2	12	111741	111752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006832	TTTATA	2	12	119080	119091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006832	TAGTAT	2	12	120135	120146	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006832	TATAAA	2	12	137859	137870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006832	TTCTGA	2	12	143148	143159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_006832	TAACAA	2	12	146315	146326	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_006832	ATATTT	2	12	153616	153627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006832	ACTAAT	2	12	153768	153779	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_006832	ATTTTT	2	12	154003	154014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006832	ATTGTA	2	12	169820	169831	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006832	TGGATA	2	12	198371	198382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006832	AATACT	2	12	212140	212151	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_006832	AATTAA	2	12	250399	250410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006832	ATAATT	2	12	257924	257935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006832	TATGAA	2	12	291591	291602	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006832	AAATAT	2	12	292353	292364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006832	TATAAT	2	12	295450	295461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006832	TTAGTA	2	12	298648	298659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006832	ATTAGT	2	12	304943	304954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006832	TTGTAT	2	12	315424	315435	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006832	GTTAAT	2	12	351449	351460	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006832	AATTAA	2	12	364998	365009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006832	TAAGTA	2	12	382622	382633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006832	TATAAT	2	12	414077	414088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006832	TATGTT	2	12	419270	419281	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006832	ATTTTT	2	12	472083	472094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006832	TAGAAT	2	12	481228	481239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006832	TTGTAT	2	12	491102	491113	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006832	AATGTA	2	12	495713	495724	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006832	ATTAGT	2	12	496012	496023	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006832	TCATTT	2	12	500734	500745	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_006832	TTTATA	2	12	508243	508254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006832	ATTAAA	2	12	519646	519657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006832	TTATAT	2	12	532535	532546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006832	TTATAA	2	12	548764	548775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006832	GTTTTT	2	12	550076	550087	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006832	TGGTTT	2	12	550957	550968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006832	GTTTTA	2	12	551093	551104	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006832	TGGTTT	2	12	551225	551236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006832	TGGTTT	2	12	551493	551504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006832	TGGTTT	2	12	551627	551638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006832	TGTATT	2	12	557601	557612	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006832	ATATAA	2	12	557904	557915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006832	TTAACT	2	12	562459	562470	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_006832	ATATTT	2	12	570647	570658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006832	TATATT	2	12	580568	580579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006832	AAATAA	2	12	586964	586975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006832	TTAATA	2	12	600645	600656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006832	ATTTTA	2	12	600673	600684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006832	ATTTTT	2	12	601600	601611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006832	TTTATT	2	12	603938	603949	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006832	TATTAA	2	12	606195	606206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006832	ATATTG	2	12	606526	606537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006832	ATTGAT	2	12	606708	606719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006832	TTAATT	2	12	612221	612232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006832	ATTTTT	2	12	616891	616902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006832	TATATT	2	12	617924	617935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006832	GCTATC	2	12	618880	618891	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006832	AATAAA	2	12	619213	619224	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006832	TTGTAT	2	12	626891	626902	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006832	TTATGT	2	12	629763	629774	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006832	TATTTT	2	12	629994	630005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006832	AGTATA	2	12	659383	659394	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006832	AATATA	2	12	659968	659979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006832	ATTATC	2	12	665494	665505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006832	ATTTTT	2	12	690348	690359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006832	TCTATA	2	12	691584	691595	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_006832	TATTTT	2	12	692931	692942	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006832	CATTAT	2	12	698678	698689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_006832	AATACA	2	12	708102	708113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_006832	AAAATA	2	12	715017	715028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006832	TTAAAA	2	12	725410	725421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006832	AAAACA	3	18	725735	725752	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_006832	AAATTA	2	12	731846	731857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006832	TAATAT	2	12	733661	733672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006832	AGTATT	2	12	747445	747456	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006832	AAGTAT	2	12	754156	754167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006832	GTTATT	2	12	761123	761134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006832	TAAAAA	2	12	761887	761898	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006832	TAATAT	2	12	775984	775995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006832	TAAAAT	2	12	779660	779671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006832	TATTTA	2	12	810278	810289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006832	ATATTT	2	12	818971	818982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006832	AATAGA	2	12	821522	821533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006832	ATAATT	2	12	829416	829427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006832	ATATAA	2	12	834133	834144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006832	TTAAAA	2	12	853581	853592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006832	ATAAAT	2	12	855771	855782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006832	TAAATA	2	12	860257	860268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006832	TAAAAA	2	12	860644	860655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006832	AAAATA	2	12	880596	880607	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006832	TAACAA	2	12	880693	880704	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_006832	TTAACA	2	12	885401	885412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_006832	TAGCTA	2	12	895472	895483	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_006832	TAGACT	2	12	898154	898165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_006832	AAAAAT	2	12	905231	905242	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006832	ATACAA	2	12	907597	907608	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_006832	TATAAA	2	12	912584	912595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006832	ATGCTT	2	12	916752	916763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_006832	ATACTA	2	12	919993	920004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_006832	AAAAAT	2	12	932892	932903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006832	CAATTT	2	12	940943	940954	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_006832	AATATA	2	12	951637	951648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006832	AAATAT	2	12	954473	954484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006832	TAAATT	2	12	967007	967018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006832	ATACAT	2	12	985158	985169	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_006832	TTATAA	2	12	985389	985400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006832	AAATAA	2	12	985673	985684	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006832	CAAAAT	2	12	1010066	1010077	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_006832	CAATAA	2	12	1013343	1013354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_006832	CATATA	2	12	1016367	1016378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_006832	AATACT	2	12	1025824	1025835	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_006832	AATATT	2	12	1025919	1025930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006832	TATCAA	2	12	1026157	1026168	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_006832	TAATTT	2	12	1040724	1040735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006832	AAATTA	2	12	1049274	1049285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006832	CATATA	2	12	1051383	1051394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_006832	TATACC	2	12	1052475	1052486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006832	TAAATT	2	12	1064034	1064045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006832	TTAATA	2	12	1064129	1064140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006832	TATATT	2	12	1075200	1075211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006832	ATGCAA	2	12	1079278	1079289	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_006832	TATCAA	2	12	1081484	1081495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_006832	AGTAAA	2	12	1084958	1084969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006832	TAATAT	2	12	1086507	1086518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006832	TTATAA	2	12	1101234	1101245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006832	ATTACT	2	12	1101617	1101628	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_006832	TAACAA	2	12	1117113	1117124	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_006832	TAACAA	2	12	1117286	1117297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_006832	ATTAAA	2	12	1124025	1124036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_006832	ATATAA	2	12	1213649	1213660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_006832	AATGCA	2	12	1228240	1228251	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_006832	TTCACT	2	12	1232371	1232382	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_006832	ATTTAT	2	12	1287461	1287472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_006832	AGTAAA	2	12	1289499	1289510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_006832	GAACAT	2	12	1299984	1299995	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.