MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis V583 chromosome

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004668	TTTTTG	2	12	76494	76505	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004668	TTTTTC	2	12	79876	79887	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_004668	GTAAAA	2	12	129564	129575	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004668	TTGTTA	2	12	142928	142939	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004668	AAAAAG	2	12	150373	150384	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004668	ACCTCT	2	12	224778	224789	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_004668	GTTATT	2	12	231086	231097	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004668	TAGGCG	2	12	251646	251657	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_004668	TGGAAG	2	12	253096	253107	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004668	TCATAT	2	12	253534	253545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_004668	TTTTAT	2	12	254362	254373	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004668	GTATAT	2	12	304680	304691	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004668	GTTTAG	2	12	306547	306558	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004668	AAAAAG	2	12	373187	373198	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004668	GACCAA	2	12	390391	390402	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004668	GTCCTC	2	12	409584	409595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004668	TACAAA	2	12	424588	424599	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_004668	TAAAAA	2	12	449947	449958	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004668	TTTTTC	2	12	475887	475898	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_004668	GAAAAA	2	12	482696	482707	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004668	GTAAAA	2	12	488922	488933	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004668	AAAAAT	2	12	493747	493758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004668	AGAAAA	2	12	494214	494225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004668	CGTTTA	2	12	497880	497891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_004668	TAAAAA	2	12	498072	498083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004668	TTAAAT	2	12	498565	498576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004668	AAAATT	2	12	503622	503633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004668	ATTAAC	2	12	504981	504992	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_004668	GATTGG	2	12	518984	518995	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004668	TTTTAA	2	12	519534	519545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004668	CAAAAA	2	12	520350	520361	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_004668	AGAAAA	2	12	531096	531107	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004668	CTATAA	2	12	532090	532101	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_004668	ATAAGT	2	12	535072	535083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004668	AATATT	2	12	535175	535186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004668	ATCATT	2	12	537783	537794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_004668	AAAAGA	2	12	549860	549871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004668	CGGTGG	2	12	551944	551955	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004668	TGATGG	2	12	554347	554358	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004668	AAAAAG	2	12	558861	558872	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004668	ATATTT	2	12	568143	568154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004668	CATTTT	2	12	572897	572908	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_004668	CAAAAA	2	12	579100	579111	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_004668	TTTCGA	2	12	580412	580423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_004668	AAATAT	2	12	599399	599410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004668	TCAATA	2	12	604512	604523	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_004668	AATAAA	2	12	652268	652279	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004668	ATTAAA	2	12	658044	658055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004668	AAAAAG	2	12	676680	676691	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004668	TTTTCA	2	12	681564	681575	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_004668	TGAAAA	2	12	681727	681738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004668	AAACAA	2	12	689495	689506	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_004668	TTAGAA	2	12	725196	725207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004668	TTACAT	2	12	758931	758942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_004668	GGTGAC	2	12	761399	761410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_004668	TAGAAG	2	12	776249	776260	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004668	AAAGGA	2	12	787511	787522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004668	AATAAG	2	12	793832	793843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004668	CTTTTT	2	12	807057	807068	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_004668	ATATAA	2	12	809395	809406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004668	TTTTAT	2	12	847885	847896	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004668	TTAAAA	2	12	904323	904334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004668	AGTCTA	2	12	931281	931292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_004668	TTCATT	2	12	965917	965928	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_004668	ATTGTT	2	12	991142	991153	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004668	AATAAA	2	12	996862	996873	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004668	CTTTTT	2	12	1002764	1002775	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_004668	TAGGCG	2	12	1021469	1021480	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_004668	TGGAAG	2	12	1022919	1022930	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004668	AAAAAG	2	12	1053415	1053426	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004668	TCTTTT	2	12	1054175	1054186	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_004668	AAAAAT	2	12	1055542	1055553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004668	AGAAAA	2	12	1066742	1066753	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004668	AATGAA	2	12	1074532	1074543	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004668	AAAGGA	2	12	1079762	1079773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004668	AATGAA	2	12	1108468	1108479	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004668	GTTATT	2	12	1111246	1111257	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004668	CTTTTT	2	12	1142580	1142591	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_004668	ACTATC	2	12	1170214	1170225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_004668	TTTGTA	2	12	1179166	1179177	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004668	TTTTTC	2	12	1191489	1191500	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_004668	TTTAAA	2	12	1195709	1195720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004668	TAAAAA	2	12	1216036	1216047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004668	AAAAAG	2	12	1221312	1221323	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004668	AAAAAG	2	12	1244967	1244978	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004668	GCAGAA	2	12	1291654	1291665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_004668	GCAGAA	2	12	1291693	1291704	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_004668	AAAAGA	2	12	1291758	1291769	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004668	GCCAAA	2	12	1291807	1291818	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_004668	GAAGCC	2	12	1292152	1292163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004668	AATTCC	2	12	1298662	1298673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004668	AAATTA	2	12	1299592	1299603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004668	AAGAAA	2	12	1323551	1323562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004668	GAGATA	2	12	1381450	1381461	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004668	ATACTA	2	12	1386401	1386412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_004668	TTTTAT	2	12	1445743	1445754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004668	TGATCG	2	12	1532972	1532983	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_004668	TGGTGA	2	12	1533266	1533277	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004668	ACAATT	2	12	1534690	1534701	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_004668	ATCTCT	2	12	1609417	1609428	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_004668	ATAAAA	2	12	1692134	1692145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004668	TAAAAC	2	12	1706219	1706230	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_004668	TGGTTA	2	12	1718614	1718625	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004668	TAAAAA	2	12	1730248	1730259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004668	ATTGTA	2	12	1740656	1740667	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004668	TTTTAT	2	12	1755478	1755489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004668	GGTATA	2	12	1778084	1778095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004668	AGAAAA	2	12	1801383	1801394	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004668	AAGAAA	2	12	1801600	1801611	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004668	TAAAAA	2	12	1807216	1807227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004668	CTTTTT	2	12	1810968	1810979	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_004668	CTTATC	2	12	1815928	1815939	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_004668	TTTCAT	2	12	1875926	1875937	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_004668	TATAAA	2	12	1897842	1897853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004668	AAATAT	2	12	1925842	1925853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004668	TAAAAT	2	12	1926322	1926333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004668	GAAATA	2	12	1929586	1929597	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004668	CGAAAA	2	12	1970863	1970874	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_004668	AAAAAT	2	12	2006599	2006610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004668	TCGTAT	2	12	2046894	2046905	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_004668	TCTGCT	2	12	2059244	2059255	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_004668	TTTTAC	2	12	2104351	2104362	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_004668	CTTCTC	3	18	2191751	2191768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_004668	AATTAA	2	12	2204037	2204048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004668	GGAAAG	2	12	2209118	2209129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004668	ATTATC	2	12	2219159	2219170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_004668	GATAAT	2	12	2219253	2219264	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004668	ATCCCC	2	12	2219859	2219870	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_004668	CGCAGA	2	12	2238196	2238207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.