MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis V583 chromosome

Total Repeats: 490

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004668	ATATA	2	10	1535	1544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004668	TAAAA	2	10	16426	16435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004668	AAATA	2	10	31381	31390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004668	GATAA	2	10	38793	38802	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004668	ATGCT	2	10	51458	51467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_004668	TCCAT	2	10	59415	59424	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_004668	AAAAT	2	10	76596	76605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004668	TAAAA	2	10	85391	85400	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004668	GTAAA	2	10	98372	98381	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004668	AGTAT	2	10	111043	111052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004668	TGGAA	2	10	129489	129498	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004668	GACTT	2	10	130859	130868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_004668	TGTGG	2	10	134095	134104	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004668	GTAAT	2	10	134437	134446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004668	TTATT	2	10	134836	134845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004668	TAAAT	2	10	162848	162857	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004668	AAAAG	2	10	172187	172196	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004668	TTTCT	2	10	179506	179515	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_004668	CTTTT	2	10	179587	179596	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_004668	AGTTT	2	10	189464	189473	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004668	TAGAA	2	10	196821	196830	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004668	ACAAA	2	10	198238	198247	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_004668	GATTT	2	10	198372	198381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004668	TGTCT	2	10	206203	206212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_004668	GAAAA	2	10	221370	221379	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004668	AAACA	2	10	231107	231116	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_004668	GTAAA	2	10	231145	231154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004668	AAGAG	2	10	244291	244300	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004668	ATTCA	2	10	248369	248378	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_004668	TCGTG	2	10	249547	249556	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004668	CCGTA	2	10	251886	251895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_004668	AGGGA	2	10	252987	252996	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004668	AAAAG	2	10	254599	254608	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004668	CTTTT	2	10	254759	254768	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_004668	TTGGT	2	10	255185	255194	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004668	GGAAT	2	10	256370	256379	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004668	TATCA	2	10	272199	272208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_004668	TAAAT	2	10	292449	292458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004668	CTTTT	2	10	298500	298509	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_004668	TAAAA	2	10	324354	324363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004668	GGAAG	2	10	328434	328443	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004668	TTAGA	2	10	346010	346019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004668	AGGAA	2	10	346051	346060	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004668	CCATT	2	10	346111	346120	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_004668	CAAGA	2	10	363007	363016	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_004668	TCAAT	2	10	381504	381513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_004668	TTGTA	2	10	386680	386689	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004668	TAGTT	2	10	387450	387459	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004668	CAGTG	2	10	389745	389754	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_004668	ACGGA	2	10	390523	390532	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_004668	AAGGA	2	10	393164	393173	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004668	CTAAA	2	10	398185	398194	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004668	AAAAT	2	10	411736	411745	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004668	CTTTT	2	10	430887	430896	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_004668	TTTTA	2	10	432757	432766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004668	AAAGA	2	10	448354	448363	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004668	ACAAA	2	10	448376	448385	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_004668	TTTAT	2	10	448478	448487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004668	ACGAA	2	10	448844	448853	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_004668	AGTTT	2	10	449517	449526	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004668	GGGGA	2	10	450117	450126	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004668	TAAAA	2	10	450174	450183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004668	AAAAT	2	10	483924	483933	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004668	TTATG	2	10	484574	484583	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004668	GACTT	2	10	490217	490226	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_004668	GAAAT	2	10	491195	491204	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004668	TTTTA	2	10	491219	491228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004668	TAATA	2	10	494628	494637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004668	TAAAT	2	10	497780	497789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004668	AGTTA	2	10	498895	498904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004668	ATAGT	2	10	501268	501277	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004668	TAGTT	2	10	502424	502433	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004668	ATTTT	2	10	505091	505100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004668	TTTTA	2	10	505547	505556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004668	TGTTT	2	10	506810	506819	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004668	TTTTA	2	10	507025	507034	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004668	TAATA	2	10	516218	516227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004668	GAATA	2	10	516401	516410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004668	AGATT	2	10	519329	519338	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004668	TCTTT	2	10	521388	521397	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_004668	TGAAT	2	10	522089	522098	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004668	AAAGA	2	10	522688	522697	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004668	AGTGA	2	10	522817	522826	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004668	AAAAT	2	10	530764	530773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004668	AGTAA	2	10	532063	532072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004668	ATGTG	2	10	532833	532842	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004668	GCATA	2	10	534237	534246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_004668	TATAA	2	10	548028	548037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004668	TGATT	2	10	548227	548236	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004668	AACGT	2	10	548350	548359	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_004668	TAAAA	2	10	551722	551731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004668	TTGTT	2	10	551845	551854	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004668	TCAAA	2	10	552227	552236	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004668	AACCT	2	10	555009	555018	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_004668	ATTGG	2	10	562616	562625	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004668	AAATT	2	10	564649	564658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004668	TGATA	2	10	564793	564802	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004668	AATGG	2	10	564945	564954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004668	AAATG	2	10	566373	566382	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004668	AAATA	2	10	568811	568820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004668	ATAAA	2	10	568909	568918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004668	TTTAT	2	10	568985	568994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004668	AAAAT	2	10	568995	569004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004668	TAATA	2	10	569986	569995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004668	AAAAT	2	10	570010	570019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004668	TGTTC	2	10	574615	574624	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_004668	ATAGA	2	10	574750	574759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004668	TATCA	2	10	583144	583153	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_004668	AAAGA	2	10	585225	585234	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004668	TTATT	2	10	586922	586931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004668	GAAGA	2	10	588712	588721	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004668	TAACA	2	10	595818	595827	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_004668	AAAAC	2	10	604553	604562	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_004668	ACGAT	2	10	624485	624494	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004668	TAAAA	2	10	631424	631433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004668	TTTGT	2	10	631860	631869	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004668	ATAGA	2	10	632493	632502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004668	ATGAT	2	10	635395	635404	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004668	CTTTA	2	10	642349	642358	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_004668	GATAT	2	10	651009	651018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004668	CTTTA	2	10	651063	651072	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_004668	ATAAA	2	10	652245	652254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004668	TAAAG	2	10	668937	668946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004668	TTTTA	2	10	689268	689277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004668	AATAG	2	10	701701	701710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004668	TTTGC	2	10	703769	703778	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_004668	ATTTT	2	10	705351	705360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004668	ATAAA	2	10	716257	716266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004668	ATAAA	2	10	735848	735857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004668	CACTA	2	10	739809	739818	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_004668	TAAAA	2	10	752022	752031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004668	AACAT	2	10	777156	777165	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_004668	AAACA	2	10	784189	784198	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004668	TTGAT	2	10	784724	784733	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004668	AAGAG	2	10	785154	785163	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004668	GGGAA	2	10	787523	787532	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004668	GAAAA	2	10	789294	789303	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004668	TTTTG	2	10	793806	793815	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004668	GTTCG	2	10	809305	809314	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_004668	GATAA	2	10	819746	819755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004668	AATAA	2	10	826038	826047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004668	TTTTA	2	10	826157	826166	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004668	TAAAC	2	10	832874	832883	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_004668	CTAAA	2	10	835768	835777	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_004668	AATAA	2	10	843346	843355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004668	TATCA	2	10	860274	860283	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_004668	GAAGA	2	10	872893	872902	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004668	AATGA	2	10	890702	890711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_004668	TACGG	2	10	2769871	2769880	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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487	NC_004668	ATATT	2	10	3213568	3213577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_004668	CATAA	2	10	3215151	3215160	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
489	NC_004668	AGACC	2	10	3217419	3217428	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
490	NC_004668	AAATT	2	10	3217701	3217710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.