MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli CFT073 chromosome

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004431	GAAAAT	2	12	11401	11412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004431	CTGGAT	2	12	30389	30400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_004431	AAGGGA	2	12	88157	88168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004431	AACGGC	2	12	128661	128672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004431	ATTGTT	2	12	158142	158153	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004431	CGCCAG	2	12	204269	204280	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_004431	GTAGTG	2	12	210409	210420	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004431	AATATA	2	12	297564	297575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004431	CAGCGT	2	12	311077	311088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_004431	ATTGTC	2	12	330948	330959	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_004431	ATTGTG	2	12	333102	333113	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004431	TTTTCT	2	12	404577	404588	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_004431	CTATTT	2	12	405614	405625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_004431	GTCACT	2	12	409115	409126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_004431	GTAACA	2	12	419906	419917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_004431	TGTCTG	2	12	422265	422276	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_004431	TGAGGT	2	12	422458	422469	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004431	CGGACG	2	12	430321	430332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004431	TTTATT	2	12	434600	434611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004431	CAGACG	2	12	452577	452588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004431	CTGGTA	2	12	479858	479869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_004431	AACAAT	2	12	481277	481288	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_004431	TATTGA	2	12	484123	484134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004431	CAGGCG	2	12	565936	565947	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004431	ATTTTT	2	12	750619	750630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004431	CGCTGG	2	12	750710	750721	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_004431	TTTACC	2	12	761468	761479	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004431	CCAGCG	2	12	772102	772113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_004431	AGATAA	2	12	893823	893834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004431	GCCGTT	2	12	909100	909111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_004431	CCTGCG	2	12	975470	975481	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_004431	ATGTTG	2	12	975490	975501	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004431	TAACCG	2	12	976945	976956	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004431	AAAGAT	2	12	1037861	1037872	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004431	AAAAAG	2	12	1037881	1037892	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004431	TGGTAA	2	12	1098951	1098962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004431	ATGAAG	2	12	1141080	1141091	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004431	TATTCT	2	12	1158906	1158917	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004431	ATTATC	2	12	1172389	1172400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_004431	TTTGTC	2	12	1176301	1176312	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_004431	CTGTTC	2	12	1208190	1208201	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004431	CCAAAA	2	12	1209726	1209737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_004431	ATCACA	2	12	1214426	1214437	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004431	GAATAA	2	12	1222386	1222397	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004431	CAAACC	2	12	1223566	1223577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_004431	TGGCGG	2	12	1236567	1236578	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_004431	CAAAAA	2	12	1264643	1264654	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_004431	TGCGCC	2	12	1345446	1345457	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_004431	TAAAAA	2	12	1384195	1384206	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004431	AGCGTT	2	12	1490850	1490861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_004431	CTGATC	2	12	1554835	1554846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_004431	TAGATA	2	12	1556216	1556227	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004431	TATAAC	2	12	1608689	1608700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_004431	ATTAAT	2	12	1667671	1667682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004431	TGTTAA	2	12	1668092	1668103	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004431	CAGCAA	2	12	1668267	1668278	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004431	ATGCCG	2	12	1685744	1685755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004431	AGAACG	2	12	1739077	1739088	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_004431	ACCGTT	2	12	1756196	1756207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004431	TGGTTA	2	12	1765025	1765036	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004431	CGTAAC	2	12	1810295	1810306	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_004431	CTCGCC	2	12	1818195	1818206	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_004431	TTGCCG	2	12	1825961	1825972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004431	TTTCTA	2	12	1903238	1903249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_004431	AAAATA	2	12	1910819	1910830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004431	CCATCC	2	12	1953901	1953912	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_004431	ACGTTT	2	12	1955730	1955741	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_004431	GTGCTT	2	12	1955778	1955789	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_004431	GCACCA	2	12	1983583	1983594	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_004431	TTTCTT	2	12	2041486	2041497	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_004431	CCACTT	2	12	2082822	2082833	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_004431	AATTCA	2	12	2135197	2135208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_004431	TTCTGA	2	12	2136783	2136794	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_004431	ATTTTT	2	12	2200127	2200138	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004431	GTCAAC	2	12	2201011	2201022	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004431	TAAAGT	2	12	2210512	2210523	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004431	AAATAA	2	12	2210828	2210839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004431	AATATA	2	12	2212530	2212541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004431	TTTTCA	2	12	2214199	2214210	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_004431	CCCGCC	2	12	2219578	2219589	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
81	NC_004431	ATTTTT	2	12	2258339	2258350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004431	CTGATA	2	12	2321826	2321837	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_004431	GAAAAC	2	12	2350137	2350148	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_004431	CATTTT	2	12	2406019	2406030	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_004431	GTTTAG	2	12	2430528	2430539	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004431	GTAATC	2	12	2440503	2440514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_004431	TTCTGG	2	12	2440542	2440553	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_004431	GCTATC	2	12	2483806	2483817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_004431	CCTTAC	2	12	2495772	2495783	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_004431	TGCGCC	2	12	2667439	2667450	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_004431	TAAATG	2	12	2689274	2689285	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004431	ACTGAA	2	12	2690038	2690049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_004431	CAGTTG	2	12	2738856	2738867	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_004431	TCGCAG	2	12	2743169	2743180	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004431	TTATTT	2	12	2776973	2776984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004431	GCGATC	2	12	2793356	2793367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_004431	GTTATG	2	12	2795097	2795108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004431	CAGCCA	2	12	2828806	2828817	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_004431	CTTCGC	2	12	2912937	2912948	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_004431	TAGCCG	2	12	2963457	2963468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_004431	CAGCAA	2	12	2993624	2993635	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004431	CCTGCA	2	12	3009005	3009016	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_004431	TGACCG	2	12	3027684	3027695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_004431	TGACAG	2	12	3047116	3047127	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_004431	AAGGAA	2	12	3050344	3050355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004431	GAAGCC	2	12	3078791	3078802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_004431	CTTTCG	2	12	3102413	3102424	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_004431	AATGGG	2	12	3142487	3142498	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004431	AATGAT	2	12	3177373	3177384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004431	GGTTTT	2	12	3192698	3192709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004431	TCTTCG	2	12	3350800	3350811	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004431	TCAATA	2	12	3353065	3353076	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_004431	CCAGCG	2	12	3377835	3377846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_004431	ATAAAC	2	12	3489394	3489405	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_004431	TAAACA	2	12	3490199	3490210	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_004431	ATTCCG	2	12	3510732	3510743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_004431	ATTTAA	2	12	3555814	3555825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004431	TGGCTT	2	12	3561487	3561498	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_004431	ATTTAA	2	12	3618444	3618455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004431	CTTTTT	2	12	3656149	3656160	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_004431	CCATGA	2	12	3678603	3678614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_004431	TTTCCG	2	12	3691112	3691123	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_004431	GCGCCT	2	12	3704399	3704410	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_004431	TTTTAT	2	12	3715996	3716007	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004431	AAGCGA	2	12	3721391	3721402	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_004431	TTTCGC	2	12	3758806	3758817	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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128	NC_004431	AACAGA	2	12	3844320	3844331	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_004431	AGCGTT	2	12	3849970	3849981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_004431	GATAAA	2	12	3866531	3866542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004431	CCTTTC	2	12	3886809	3886820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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140	NC_004431	CATCAC	2	12	3988095	3988106	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.