MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. Sakai plasmid pO157

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002128	GTCC	2	8	79	86	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002128	AAAC	2	8	282	289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_002128	CTGC	2	8	595	602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002128	CAAA	2	8	1282	1289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_002128	GGCA	2	8	2195	2202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002128	AACA	2	8	11119	11126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002128	GACA	2	8	11391	11398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_002128	GTAA	2	8	15586	15593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002128	ATCA	2	8	15881	15888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_002128	TTAT	2	8	16078	16085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002128	CAAA	2	8	24207	24214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_002128	CACT	2	8	25272	25279	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_002128	ACTG	2	8	26423	26430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002128	ACTT	2	8	26496	26503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002128	TCAT	2	8	26647	26654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_002128	TACA	2	8	28237	28244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002128	CTCC	2	8	28297	28304	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_002128	GCTG	2	8	30089	30096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_002128	TTCC	2	8	32213	32220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002128	TCGC	2	8	32628	32635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002128	TGGT	2	8	35964	35971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002128	GCGG	2	8	40731	40738	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_002128	ACGG	2	8	42385	42392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_002128	GCCC	2	8	43069	43076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_002128	ACTG	2	8	43587	43594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002128	ATTT	2	8	43819	43826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002128	GTCA	2	8	43858	43865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_002128	GACT	2	8	47585	47592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_002128	GGCG	2	8	51543	51550	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_002128	TAAG	2	8	54556	54563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002128	CCTC	2	8	70084	70091	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_002128	TCAT	2	8	71145	71152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_002128	TAAT	2	8	71394	71401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002128	TGGC	2	8	72321	72328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002128	GCTC	2	8	72520	72527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_002128	CATT	2	8	73723	73730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_002128	GACA	2	8	73764	73771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002128	CCCT	2	8	73886	73893	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_002128	ATCA	2	8	74169	74176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002128	CTGC	2	8	75242	75249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_002128	CTTC	2	8	75460	75467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002128	TCCG	2	8	76544	76551	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_002128	CTTT	2	8	77171	77178	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002128	TTAT	2	8	77549	77556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002128	AAAT	2	8	77775	77782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002128	TGAT	2	8	78215	78222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002128	GAAA	2	8	78470	78477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002128	TACA	2	8	78894	78901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002128	CCTC	2	8	79120	79127	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_002128	GTTG	2	8	79536	79543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002128	ATAC	2	8	79559	79566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002128	AACA	2	8	80639	80646	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_002128	TGCC	2	8	84701	84708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_002128	AATA	2	8	85530	85537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002128	AAAT	2	8	85955	85962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002128	AATA	2	8	86022	86029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002128	CTGC	2	8	86125	86132	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002128	ACGT	2	8	87142	87149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002128	GCAG	2	8	87151	87158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_002128	TCAG	2	8	91713	91720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_002128	ACCA	2	8	91748	91755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002128	TGCT	2	8	92324	92331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_002128	GCTT	2	8	92349	92356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002128	ATGA	2	8	92539	92546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002128	ATTT	2	8	92650	92657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.