MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 1886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022651	GCG	2	6	87676	87681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555284
1502	NC_022651	GT	3	6	87683	87688	0 %	50 %	50 %	0 %	556555284
1503	NC_022651	CAG	2	6	87693	87698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555284
1504	NC_022651	CAG	2	6	87736	87741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555285
1505	NC_022651	AGC	2	6	87851	87856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555285
1506	NC_022651	GGT	2	6	87859	87864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555285
1507	NC_022651	CGC	2	6	87879	87884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555285
1508	NC_022651	TCA	2	6	87888	87893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555285
1509	NC_022651	GGT	2	6	87934	87939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555285
1510	NC_022651	GCA	2	6	87963	87968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555285
1511	NC_022651	A	6	6	87985	87990	100 %	0 %	0 %	0 %	556555285
1512	NC_022651	TGCG	2	8	87995	88002	0 %	25 %	50 %	25 %	556555285
1513	NC_022651	GTA	2	6	88078	88083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555285
1514	NC_022651	CAG	2	6	88120	88125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555285
1515	NC_022651	TGC	2	6	88134	88139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555285
1516	NC_022651	GTT	3	9	88150	88158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555285
1517	NC_022651	AGGCCG	2	12	88196	88207	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556555285
1518	NC_022651	GCG	2	6	88235	88240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555285
1519	NC_022651	ATC	2	6	88256	88261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555285
1520	NC_022651	GAA	3	9	88264	88272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555285
1521	NC_022651	CAG	3	9	88324	88332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555285
1522	NC_022651	CAG	2	6	88360	88365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555285
1523	NC_022651	AGA	2	6	88398	88403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555285
1524	NC_022651	CAG	2	6	88516	88521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555285
1525	NC_022651	CAG	2	6	88528	88533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555285
1526	NC_022651	CAT	2	6	88716	88721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555286
1527	NC_022651	CG	3	6	88739	88744	0 %	0 %	50 %	50 %	556555286
1528	NC_022651	GGT	2	6	88811	88816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555286
1529	NC_022651	TGC	2	6	88828	88833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555286
1530	NC_022651	TGC	2	6	88894	88899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555286
1531	NC_022651	GTC	2	6	88901	88906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555286
1532	NC_022651	TCA	2	6	88942	88947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555286
1533	NC_022651	GCA	2	6	89113	89118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555287
1534	NC_022651	GCC	2	6	89141	89146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555287
1535	NC_022651	GCC	2	6	89192	89197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555288
1536	NC_022651	GC	3	6	89201	89206	0 %	0 %	50 %	50 %	556555288
1537	NC_022651	A	7	7	89214	89220	100 %	0 %	0 %	0 %	556555288
1538	NC_022651	ATG	2	6	89264	89269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555288
1539	NC_022651	TCG	2	6	89284	89289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555288
1540	NC_022651	ATA	2	6	89554	89559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555289
1541	NC_022651	GCC	2	6	89838	89843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555289
1542	NC_022651	TAC	2	6	89886	89891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555289
1543	NC_022651	GATGT	2	10	89986	89995	20 %	40 %	40 %	0 %	556555289
1544	NC_022651	TGA	2	6	90140	90145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555289
1545	NC_022651	TGA	2	6	90163	90168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555289
1546	NC_022651	AAT	2	6	90198	90203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555289
1547	NC_022651	GTG	2	6	90204	90209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555289
1548	NC_022651	AT	3	6	90303	90308	50 %	50 %	0 %	0 %	556555289
1549	NC_022651	TGA	2	6	90317	90322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555289
1550	NC_022651	CAT	2	6	90470	90475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555290
1551	NC_022651	A	6	6	90477	90482	100 %	0 %	0 %	0 %	556555290
1552	NC_022651	CAT	2	6	90485	90490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555290
1553	NC_022651	ACC	2	6	90495	90500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555290
1554	NC_022651	AGG	2	6	90671	90676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555290
1555	NC_022651	CGC	2	6	90800	90805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555290
1556	NC_022651	ATTGAA	2	12	90825	90836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	556555290
1557	NC_022651	CAT	2	6	90839	90844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555290
1558	NC_022651	A	7	7	90896	90902	100 %	0 %	0 %	0 %	556555197
1559	NC_022651	A	6	6	90909	90914	100 %	0 %	0 %	0 %	556555197
1560	NC_022651	ATG	2	6	90926	90931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555197
1561	NC_022651	C	6	6	90936	90941	0 %	0 %	0 %	100 %	556555197
1562	NC_022651	TTG	2	6	91230	91235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555197
1563	NC_022651	AGA	2	6	91297	91302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555197
1564	NC_022651	TGA	2	6	91344	91349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555197
1565	NC_022651	GAT	2	6	91351	91356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555197
1566	NC_022651	CCG	2	6	91368	91373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555197
1567	NC_022651	GGCA	2	8	91374	91381	25 %	0 %	50 %	25 %	556555197
1568	NC_022651	TGG	2	6	91425	91430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555197
1569	NC_022651	CCA	2	6	91482	91487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555197
1570	NC_022651	TCA	2	6	91542	91547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555197
1571	NC_022651	CTG	2	6	91559	91564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555197
1572	NC_022651	CTG	2	6	91674	91679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555197
1573	NC_022651	CCA	2	6	91749	91754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555197
1574	NC_022651	TGG	2	6	91758	91763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555197
1575	NC_022651	TG	3	6	91769	91774	0 %	50 %	50 %	0 %	556555197
1576	NC_022651	CAT	2	6	91922	91927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555198
1577	NC_022651	TCA	2	6	91939	91944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555198
1578	NC_022651	T	6	6	91966	91971	0 %	100 %	0 %	0 %	556555198
1579	NC_022651	CAA	2	6	92014	92019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555198
1580	NC_022651	TCG	2	6	92064	92069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555198
1581	NC_022651	ACC	2	6	92109	92114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555198
1582	NC_022651	CAGCT	2	10	92117	92126	20 %	20 %	20 %	40 %	556555198
1583	NC_022651	CAA	2	6	92222	92227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555198
1584	NC_022651	GGA	2	6	92240	92245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555198
1585	NC_022651	CTTT	2	8	92301	92308	0 %	75 %	0 %	25 %	556555198
1586	NC_022651	T	6	6	92306	92311	0 %	100 %	0 %	0 %	556555198
1587	NC_022651	AGAT	2	8	92316	92323	50 %	25 %	25 %	0 %	556555198
1588	NC_022651	GGCA	2	8	92353	92360	25 %	0 %	50 %	25 %	556555198
1589	NC_022651	AAAATC	2	12	92411	92422	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556555198
1590	NC_022651	TTA	2	6	92433	92438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555198
1591	NC_022651	ATA	2	6	92465	92470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555198
1592	NC_022651	T	7	7	92478	92484	0 %	100 %	0 %	0 %	556555198
1593	NC_022651	GGT	2	6	92528	92533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555198
1594	NC_022651	CAA	2	6	93283	93288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555291
1595	NC_022651	GCC	2	6	93342	93347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555291
1596	NC_022651	AGG	3	9	93406	93414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555291
1597	NC_022651	CTG	2	6	93615	93620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555292
1598	NC_022651	GTT	2	6	93691	93696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555292
1599	NC_022651	CA	3	6	93794	93799	50 %	0 %	0 %	50 %	556555292
1600	NC_022651	ATAGAT	2	12	94070	94081	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	556555293
1601	NC_022651	GCA	2	6	94135	94140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555293
1602	NC_022651	CTT	2	6	94489	94494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555294
1603	NC_022651	TTC	2	6	94503	94508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555294
1604	NC_022651	TAA	2	6	94638	94643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555294
1605	NC_022651	T	8	8	94659	94666	0 %	100 %	0 %	0 %	556555294
1606	NC_022651	TGC	2	6	94673	94678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555294
1607	NC_022651	A	7	7	94684	94690	100 %	0 %	0 %	0 %	556555294
1608	NC_022651	TAA	2	6	94714	94719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555294
1609	NC_022651	TAA	2	6	94759	94764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555294
1610	NC_022651	ATT	2	6	94809	94814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555294
1611	NC_022651	AAT	2	6	94815	94820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555294
1612	NC_022651	AGA	2	6	94914	94919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555294
1613	NC_022651	AGAT	2	8	95061	95068	50 %	25 %	25 %	0 %	556555294
1614	NC_022651	CCAG	2	8	95189	95196	25 %	0 %	25 %	50 %	556555294
1615	NC_022651	ATCAAA	2	12	95216	95227	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556555294
1616	NC_022651	AT	3	6	95243	95248	50 %	50 %	0 %	0 %	556555294
1617	NC_022651	CAT	2	6	95276	95281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555294
1618	NC_022651	A	6	6	95289	95294	100 %	0 %	0 %	0 %	556555294
1619	NC_022651	ATT	2	6	95324	95329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555294
1620	NC_022651	A	7	7	95357	95363	100 %	0 %	0 %	0 %	556555294
1621	NC_022651	A	6	6	95372	95377	100 %	0 %	0 %	0 %	556555294
1622	NC_022651	ATAGT	2	10	95401	95410	40 %	40 %	20 %	0 %	556555294
1623	NC_022651	CAA	2	6	95415	95420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555294
1624	NC_022651	ATA	2	6	95523	95528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555294
1625	NC_022651	TAA	2	6	95540	95545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555294
1626	NC_022651	AAT	2	6	95549	95554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555294
1627	NC_022651	A	6	6	96918	96923	100 %	0 %	0 %	0 %	556555199
1628	NC_022651	GCTG	2	8	97030	97037	0 %	25 %	50 %	25 %	556555199
1629	NC_022651	GTT	2	6	97068	97073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555199
1630	NC_022651	CTG	2	6	97125	97130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555199
1631	NC_022651	GTG	2	6	97143	97148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555199
1632	NC_022651	TGGC	2	8	97163	97170	0 %	25 %	50 %	25 %	556555199
1633	NC_022651	GCA	2	6	97259	97264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555199
1634	NC_022651	TGA	2	6	97403	97408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555295
1635	NC_022651	AT	3	6	97419	97424	50 %	50 %	0 %	0 %	556555295
1636	NC_022651	ATTT	2	8	97431	97438	25 %	75 %	0 %	0 %	556555295
1637	NC_022651	TAT	2	6	97467	97472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555295
1638	NC_022651	ATATC	2	10	97487	97496	40 %	40 %	0 %	20 %	556555295
1639	NC_022651	CCCGTG	2	12	97668	97679	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556555296
1640	NC_022651	GAT	2	6	97706	97711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555296
1641	NC_022651	TGC	2	6	97720	97725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555296
1642	NC_022651	C	7	7	97808	97814	0 %	0 %	0 %	100 %	556555296
1643	NC_022651	AGA	2	6	97854	97859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555296
1644	NC_022651	ATC	2	6	97865	97870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555296
1645	NC_022651	GGT	2	6	97927	97932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555296
1646	NC_022651	CA	3	6	97983	97988	50 %	0 %	0 %	50 %	556555296
1647	NC_022651	CCA	2	6	98031	98036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555296
1648	NC_022651	GCA	2	6	98146	98151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555296
1649	NC_022651	CG	3	6	98167	98172	0 %	0 %	50 %	50 %	556555296
1650	NC_022651	CAG	2	6	98182	98187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555296
1651	NC_022651	TCA	2	6	98222	98227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555296
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1653	NC_022651	GTA	2	6	98242	98247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555296
1654	NC_022651	GCA	2	6	98274	98279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555296
1655	NC_022651	CAG	2	6	98293	98298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555296
1656	NC_022651	GCC	2	6	98307	98312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555296
1657	NC_022651	CGG	2	6	98328	98333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555296
1658	NC_022651	TCA	2	6	98463	98468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555296
1659	NC_022651	ATT	2	6	98530	98535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555296
1660	NC_022651	CCG	2	6	98560	98565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555296
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1662	NC_022651	CAG	2	6	98587	98592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555296
1663	NC_022651	CT	3	6	98628	98633	0 %	50 %	0 %	50 %	556555296
1664	NC_022651	CCT	2	6	98648	98653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555297
1665	NC_022651	TGC	2	6	98706	98711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555297
1666	NC_022651	CGG	2	6	98755	98760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555297
1667	NC_022651	CA	3	6	98780	98785	50 %	0 %	0 %	50 %	556555297
1668	NC_022651	TGT	2	6	98831	98836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555297
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1679	NC_022651	CCGG	2	8	99191	99198	0 %	0 %	50 %	50 %	556555297
1680	NC_022651	GAG	2	6	99207	99212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555297
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1724	NC_022651	GT	3	6	101695	101700	0 %	50 %	50 %	0 %	556555301
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1731	NC_022651	TGA	2	6	102059	102064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555301
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1733	NC_022651	AAAT	2	8	102160	102167	75 %	25 %	0 %	0 %	556555301
1734	NC_022651	TGA	2	6	102344	102349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555301
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1740	NC_022651	AG	3	6	102597	102602	50 %	0 %	50 %	0 %	556555301
1741	NC_022651	ATT	2	6	102604	102609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555301
1742	NC_022651	AAT	2	6	102612	102617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555301
1743	NC_022651	A	6	6	102620	102625	100 %	0 %	0 %	0 %	556555301
1744	NC_022651	GAA	2	6	102669	102674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555301
1745	NC_022651	AAG	2	6	102695	102700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555301
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1747	NC_022651	A	6	6	102727	102732	100 %	0 %	0 %	0 %	556555301
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1871	NC_022651	T	6	6	109179	109184	0 %	100 %	0 %	0 %	556555201
1872	NC_022651	ACA	2	6	109185	109190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555201
1873	NC_022651	GAG	2	6	109243	109248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555201
1874	NC_022651	TCC	2	6	109316	109321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555201
1875	NC_022651	CATCAG	2	12	109347	109358	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556555201
1876	NC_022651	TGT	2	6	109439	109444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555201
1877	NC_022651	ATC	2	6	109529	109534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555201
1878	NC_022651	AGC	2	6	109570	109575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555306
1879	NC_022651	AGTGGA	2	12	109653	109664	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	556555306
1880	NC_022651	GCC	2	6	109681	109686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555306
1881	NC_022651	TTCT	2	8	109692	109699	0 %	75 %	0 %	25 %	556555306
1882	NC_022651	TAA	2	6	109725	109730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555306
1883	NC_022651	AGA	2	6	109746	109751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555306
1884	NC_022651	CGC	2	6	109768	109773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555306
1885	NC_022651	CCA	2	6	109886	109891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555306
1886	NC_022651	ATTC	2	8	109904	109911	25 %	50 %	0 %	25 %	556555306

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