MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 1886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022651	AAT	2	6	61136	61141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555259
1002	NC_022651	GAA	2	6	61215	61220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555259
1003	NC_022651	CTT	2	6	61241	61246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555259
1004	NC_022651	CAG	2	6	61258	61263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555259
1005	NC_022651	GCAT	2	8	61350	61357	25 %	25 %	25 %	25 %	556555259
1006	NC_022651	ATC	2	6	61361	61366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555259
1007	NC_022651	TAA	2	6	61399	61404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555259
1008	NC_022651	GTT	2	6	61437	61442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555260
1009	NC_022651	TGTT	2	8	61445	61452	0 %	75 %	25 %	0 %	556555260
1010	NC_022651	TCA	2	6	61456	61461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555260
1011	NC_022651	T	6	6	61487	61492	0 %	100 %	0 %	0 %	556555260
1012	NC_022651	C	6	6	61547	61552	0 %	0 %	0 %	100 %	556555260
1013	NC_022651	CATTT	2	10	61558	61567	20 %	60 %	0 %	20 %	556555260
1014	NC_022651	GCA	2	6	61574	61579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555260
1015	NC_022651	ACAT	2	8	61612	61619	50 %	25 %	0 %	25 %	556555260
1016	NC_022651	GCA	2	6	61690	61695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555260
1017	NC_022651	CAG	2	6	61697	61702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555260
1018	NC_022651	TCT	2	6	61723	61728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555260
1019	NC_022651	CT	3	6	61761	61766	0 %	50 %	0 %	50 %	556555260
1020	NC_022651	GTG	2	6	61837	61842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555260
1021	NC_022651	AAAC	2	8	61856	61863	75 %	0 %	0 %	25 %	556555260
1022	NC_022651	ACA	2	6	61945	61950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555260
1023	NC_022651	GGC	2	6	61956	61961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555260
1024	NC_022651	GAC	2	6	61978	61983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555260
1025	NC_022651	ATT	2	6	61986	61991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555260
1026	NC_022651	CCCT	2	8	62005	62012	0 %	25 %	0 %	75 %	556555261
1027	NC_022651	CTG	2	6	62029	62034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555261
1028	NC_022651	GCT	2	6	62052	62057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555261
1029	NC_022651	TCT	2	6	62135	62140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555261
1030	NC_022651	GCTCT	2	10	62144	62153	0 %	40 %	20 %	40 %	556555261
1031	NC_022651	GCGT	2	8	62154	62161	0 %	25 %	50 %	25 %	556555261
1032	NC_022651	GTA	2	6	62275	62280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555261
1033	NC_022651	GCC	2	6	62311	62316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555261
1034	NC_022651	GC	3	6	62390	62395	0 %	0 %	50 %	50 %	556555261
1035	NC_022651	CAA	2	6	62418	62423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555261
1036	NC_022651	CAC	2	6	62467	62472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555261
1037	NC_022651	TTC	2	6	62543	62548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555261
1038	NC_022651	C	6	6	62598	62603	0 %	0 %	0 %	100 %	556555261
1039	NC_022651	CCA	2	6	62661	62666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555261
1040	NC_022651	TGG	3	9	62869	62877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555261
1041	NC_022651	CGG	2	6	62908	62913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555261
1042	NC_022651	GCG	2	6	62934	62939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555261
1043	NC_022651	CCGGG	2	10	62979	62988	0 %	0 %	60 %	40 %	556555261
1044	NC_022651	AGGC	2	8	62994	63001	25 %	0 %	50 %	25 %	556555261
1045	NC_022651	TGTCC	2	10	63078	63087	0 %	40 %	20 %	40 %	556555261
1046	NC_022651	ACG	2	6	63100	63105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555261
1047	NC_022651	TCA	2	6	63110	63115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555261
1048	NC_022651	TGTT	2	8	63122	63129	0 %	75 %	25 %	0 %	556555261
1049	NC_022651	ACG	2	6	63145	63150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555261
1050	NC_022651	TGG	2	6	63201	63206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555261
1051	NC_022651	TCA	2	6	63224	63229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555261
1052	NC_022651	CCA	2	6	63240	63245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555261
1053	NC_022651	CAGA	2	8	63312	63319	50 %	0 %	25 %	25 %	556555261
1054	NC_022651	CAC	2	6	63327	63332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555261
1055	NC_022651	GC	3	6	63453	63458	0 %	0 %	50 %	50 %	556555262
1056	NC_022651	CTGG	2	8	63471	63478	0 %	25 %	50 %	25 %	556555262
1057	NC_022651	GGCT	2	8	63481	63488	0 %	25 %	50 %	25 %	556555262
1058	NC_022651	CACGG	2	10	63495	63504	20 %	0 %	40 %	40 %	556555262
1059	NC_022651	CCG	2	6	63629	63634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555262
1060	NC_022651	CTT	2	6	63761	63766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555262
1061	NC_022651	TTG	2	6	63886	63891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555262
1062	NC_022651	ACC	2	6	63901	63906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555262
1063	NC_022651	CCG	2	6	63910	63915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555262
1064	NC_022651	ATT	2	6	63930	63935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555262
1065	NC_022651	ACC	2	6	64032	64037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555262
1066	NC_022651	CAC	2	6	64050	64055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555262
1067	NC_022651	A	7	7	64097	64103	100 %	0 %	0 %	0 %	556555262
1068	NC_022651	ATT	2	6	64117	64122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555262
1069	NC_022651	TAT	2	6	64127	64132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555262
1070	NC_022651	T	6	6	64132	64137	0 %	100 %	0 %	0 %	556555262
1071	NC_022651	CCAG	2	8	64164	64171	25 %	0 %	25 %	50 %	556555263
1072	NC_022651	CGCTT	2	10	64343	64352	0 %	40 %	20 %	40 %	556555263
1073	NC_022651	AT	3	6	64397	64402	50 %	50 %	0 %	0 %	556555263
1074	NC_022651	TGA	2	6	64438	64443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555263
1075	NC_022651	CTG	2	6	64480	64485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555263
1076	NC_022651	AG	3	6	64609	64614	50 %	0 %	50 %	0 %	556555263
1077	NC_022651	GCA	2	6	64770	64775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555264
1078	NC_022651	T	6	6	64831	64836	0 %	100 %	0 %	0 %	556555264
1079	NC_022651	T	6	6	64840	64845	0 %	100 %	0 %	0 %	556555264
1080	NC_022651	TGT	2	6	64897	64902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555264
1081	NC_022651	TGC	2	6	64924	64929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555264
1082	NC_022651	TGGT	2	8	64970	64977	0 %	50 %	50 %	0 %	556555264
1083	NC_022651	CAT	2	6	65026	65031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555264
1084	NC_022651	ACG	2	6	65046	65051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555265
1085	NC_022651	AATA	2	8	65066	65073	75 %	25 %	0 %	0 %	556555265
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1087	NC_022651	TCA	2	6	65116	65121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555265
1088	NC_022651	AAC	2	6	65156	65161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555265
1089	NC_022651	AAC	2	6	65168	65173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555265
1090	NC_022651	GTG	2	6	65205	65210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555265
1091	NC_022651	TGC	2	6	65240	65245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555265
1092	NC_022651	GAA	2	6	65261	65266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555265
1093	NC_022651	CAT	2	6	65267	65272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555265
1094	NC_022651	CAG	3	9	65278	65286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555265
1095	NC_022651	A	7	7	65335	65341	100 %	0 %	0 %	0 %	556555265
1096	NC_022651	TTC	2	6	65480	65485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555266
1097	NC_022651	GAT	2	6	65512	65517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555266
1098	NC_022651	CCT	2	6	65648	65653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555266
1099	NC_022651	A	6	6	65843	65848	100 %	0 %	0 %	0 %	556555267
1100	NC_022651	CTGT	2	8	65895	65902	0 %	50 %	25 %	25 %	556555267
1101	NC_022651	CT	3	6	65912	65917	0 %	50 %	0 %	50 %	556555267
1102	NC_022651	TTG	2	6	65923	65928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555267
1103	NC_022651	AAC	2	6	65960	65965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555267
1104	NC_022651	A	6	6	66044	66049	100 %	0 %	0 %	0 %	556555267
1105	NC_022651	ACA	2	6	66084	66089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555267
1106	NC_022651	ACG	2	6	66155	66160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555267
1107	NC_022651	TGA	2	6	66206	66211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555267
1108	NC_022651	TA	3	6	66236	66241	50 %	50 %	0 %	0 %	556555267
1109	NC_022651	CT	3	6	66243	66248	0 %	50 %	0 %	50 %	556555267
1110	NC_022651	TCT	2	6	66264	66269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555267
1111	NC_022651	TATT	2	8	66381	66388	25 %	75 %	0 %	0 %	556555267
1112	NC_022651	CA	3	6	66430	66435	50 %	0 %	0 %	50 %	556555267
1113	NC_022651	T	6	6	66626	66631	0 %	100 %	0 %	0 %	556555268
1114	NC_022651	TCA	2	6	66637	66642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555268
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1116	NC_022651	TTA	2	6	66811	66816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555268
1117	NC_022651	TCT	2	6	66945	66950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555268
1118	NC_022651	TATT	2	8	66962	66969	25 %	75 %	0 %	0 %	556555268
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1123	NC_022651	A	6	6	67440	67445	100 %	0 %	0 %	0 %	556555191
1124	NC_022651	ACA	2	6	67692	67697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555191
1125	NC_022651	TTA	2	6	67727	67732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555191
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1127	NC_022651	GAA	2	6	67904	67909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555191
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1132	NC_022651	AAAT	2	8	68519	68526	75 %	25 %	0 %	0 %	556555192
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1166	NC_022651	ATG	2	6	71178	71183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555271
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1252	NC_022651	GCT	2	6	75023	75028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555274
1253	NC_022651	TGG	2	6	75045	75050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555274
1254	NC_022651	GGGC	2	8	75131	75138	0 %	0 %	75 %	25 %	556555274
1255	NC_022651	CTG	2	6	75168	75173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555274
1256	NC_022651	CGT	2	6	75188	75193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555274
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1258	NC_022651	TGC	3	9	75238	75246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555274
1259	NC_022651	CTG	2	6	75285	75290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555274
1260	NC_022651	TGA	2	6	75292	75297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555274
1261	NC_022651	CTG	2	6	75321	75326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555274
1262	NC_022651	TTG	2	6	75327	75332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555274
1263	NC_022651	TGA	2	6	75334	75339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555274
1264	NC_022651	GTT	2	6	75348	75353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555274
1265	NC_022651	CTG	2	6	75369	75374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555274
1266	NC_022651	GCT	3	9	75431	75439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555274
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1270	NC_022651	GGT	2	6	75581	75586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555274
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1277	NC_022651	GCG	2	6	75829	75834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555274
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1284	NC_022651	CGC	2	6	76238	76243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555275
1285	NC_022651	GCT	2	6	76294	76299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555275
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1287	NC_022651	TTGA	2	8	76364	76371	25 %	50 %	25 %	0 %	556555275
1288	NC_022651	CCG	2	6	76374	76379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555275
1289	NC_022651	GCTGC	2	10	76385	76394	0 %	20 %	40 %	40 %	556555275
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1296	NC_022651	TGA	2	6	76591	76596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555275
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1362	NC_022651	GACG	2	8	80221	80228	25 %	0 %	50 %	25 %	556555278
1363	NC_022651	A	6	6	80406	80411	100 %	0 %	0 %	0 %	556555194
1364	NC_022651	CGC	3	9	80420	80428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555194
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1367	NC_022651	CAA	2	6	80496	80501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555194
1368	NC_022651	TGA	3	9	80506	80514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555194
1369	NC_022651	GC	4	8	80528	80535	0 %	0 %	50 %	50 %	556555194
1370	NC_022651	AAT	2	6	80544	80549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555194
1371	NC_022651	CGG	2	6	80603	80608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555194
1372	NC_022651	CAC	2	6	80615	80620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555194
1373	NC_022651	TGGC	2	8	80667	80674	0 %	25 %	50 %	25 %	556555194
1374	NC_022651	TA	3	6	80722	80727	50 %	50 %	0 %	0 %	556555194
1375	NC_022651	CAT	2	6	80811	80816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555194
1376	NC_022651	A	6	6	80821	80826	100 %	0 %	0 %	0 %	556555194
1377	NC_022651	GCG	2	6	80874	80879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555194
1378	NC_022651	ATA	2	6	81042	81047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555279
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1382	NC_022651	GAGCA	2	10	81246	81255	40 %	0 %	40 %	20 %	556555279
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1412	NC_022651	CGTAT	2	10	83864	83873	20 %	40 %	20 %	20 %	556555282
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1487	NC_022651	CCA	2	6	87126	87131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555284
1488	NC_022651	GCC	2	6	87151	87156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555284
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1490	NC_022651	CAT	2	6	87231	87236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555284
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1492	NC_022651	ATC	2	6	87313	87318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555284
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1499	NC_022651	GCA	2	6	87609	87614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555284
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