MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_4

Total Repeats: 888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022650	TGA	2	6	32278	32283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555143
502	NC_022650	ATG	2	6	32396	32401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555143
503	NC_022650	AGT	2	6	32440	32445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555143
504	NC_022650	T	7	7	32449	32455	0 %	100 %	0 %	0 %	556555143
505	NC_022650	T	6	6	32467	32472	0 %	100 %	0 %	0 %	556555143
506	NC_022650	A	6	6	32485	32490	100 %	0 %	0 %	0 %	556555143
507	NC_022650	TCT	2	6	32627	32632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555143
508	NC_022650	CTT	2	6	32717	32722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555143
509	NC_022650	CTG	2	6	32723	32728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555143
510	NC_022650	CGG	2	6	32752	32757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555143
511	NC_022650	TTG	2	6	32865	32870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555143
512	NC_022650	TAA	2	6	32983	32988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555143
513	NC_022650	TCC	2	6	32992	32997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555143
514	NC_022650	TGG	2	6	33040	33045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555143
515	NC_022650	ATT	2	6	33062	33067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555143
516	NC_022650	GCTGCA	2	12	33071	33082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556555143
517	NC_022650	GCT	2	6	33110	33115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555143
518	NC_022650	GCG	3	9	33116	33124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555143
519	NC_022650	GCA	2	6	33128	33133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555143
520	NC_022650	GCG	2	6	33164	33169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555143
521	NC_022650	GAA	2	6	33197	33202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555143
522	NC_022650	CGG	2	6	33211	33216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555143
523	NC_022650	GGA	2	6	33233	33238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555143
524	NC_022650	GGC	2	6	33242	33247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555143
525	NC_022650	GGT	2	6	33302	33307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555143
526	NC_022650	GGA	2	6	33341	33346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555143
527	NC_022650	AGT	2	6	33404	33409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555143
528	NC_022650	GGT	2	6	33494	33499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555143
529	NC_022650	GCTT	2	8	33502	33509	0 %	50 %	25 %	25 %	556555143
530	NC_022650	TGG	2	6	33619	33624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555143
531	NC_022650	TGA	2	6	33694	33699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555143
532	NC_022650	ACAA	2	8	33717	33724	75 %	0 %	0 %	25 %	556555143
533	NC_022650	TGA	2	6	33850	33855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555144
534	NC_022650	ATC	2	6	33909	33914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555144
535	NC_022650	A	6	6	33963	33968	100 %	0 %	0 %	0 %	556555144
536	NC_022650	A	6	6	34009	34014	100 %	0 %	0 %	0 %	556555144
537	NC_022650	TAA	2	6	34016	34021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555144
538	NC_022650	CAT	2	6	34151	34156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555145
539	NC_022650	TAGCTG	2	12	34159	34170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556555145
540	NC_022650	GTA	2	6	34183	34188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555145
541	NC_022650	ATG	2	6	34228	34233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555145
542	NC_022650	TTTA	2	8	34258	34265	25 %	75 %	0 %	0 %	556555145
543	NC_022650	GGA	2	6	34295	34300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555145
544	NC_022650	AGC	2	6	34457	34462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555145
545	NC_022650	GGC	2	6	34544	34549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555145
546	NC_022650	AGA	2	6	34565	34570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555145
547	NC_022650	AC	4	8	34618	34625	50 %	0 %	0 %	50 %	556555145
548	NC_022650	A	6	6	34640	34645	100 %	0 %	0 %	0 %	556555145
549	NC_022650	CAG	2	6	34654	34659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555145
550	NC_022650	CAG	2	6	34746	34751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555145
551	NC_022650	TAA	2	6	34778	34783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555145
552	NC_022650	TAA	2	6	34917	34922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555146
553	NC_022650	TTA	2	6	34927	34932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555146
554	NC_022650	T	6	6	34982	34987	0 %	100 %	0 %	0 %	556555146
555	NC_022650	TGA	2	6	35063	35068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555146
556	NC_022650	CATA	2	8	35093	35100	50 %	25 %	0 %	25 %	556555146
557	NC_022650	GTG	2	6	35108	35113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555146
558	NC_022650	TGGT	2	8	35121	35128	0 %	50 %	50 %	0 %	556555146
559	NC_022650	ATC	2	6	35167	35172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555146
560	NC_022650	TCT	2	6	35205	35210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555146
561	NC_022650	TTA	2	6	35218	35223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555146
562	NC_022650	TGG	2	6	35257	35262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555146
563	NC_022650	GTAT	2	8	35281	35288	25 %	50 %	25 %	0 %	556555146
564	NC_022650	TAT	2	6	35296	35301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555146
565	NC_022650	AAG	2	6	35302	35307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555146
566	NC_022650	TTA	2	6	35360	35365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555146
567	NC_022650	ACT	2	6	35382	35387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555146
568	NC_022650	T	7	7	35449	35455	0 %	100 %	0 %	0 %	556555146
569	NC_022650	TCT	2	6	35459	35464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555146
570	NC_022650	T	6	6	35990	35995	0 %	100 %	0 %	0 %	556555147
571	NC_022650	ATC	2	6	35997	36002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555147
572	NC_022650	GCG	2	6	36018	36023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555147
573	NC_022650	T	8	8	36193	36200	0 %	100 %	0 %	0 %	556555148
574	NC_022650	GATA	2	8	36231	36238	50 %	25 %	25 %	0 %	556555148
575	NC_022650	AT	3	6	36239	36244	50 %	50 %	0 %	0 %	556555148
576	NC_022650	T	6	6	36246	36251	0 %	100 %	0 %	0 %	556555148
577	NC_022650	AT	3	6	36263	36268	50 %	50 %	0 %	0 %	556555148
578	NC_022650	CAA	2	6	36293	36298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555148
579	NC_022650	T	6	6	36319	36324	0 %	100 %	0 %	0 %	556555148
580	NC_022650	TCTT	2	8	36334	36341	0 %	75 %	0 %	25 %	556555148
581	NC_022650	ATTC	2	8	36368	36375	25 %	50 %	0 %	25 %	556555148
582	NC_022650	TAA	2	6	36404	36409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555148
583	NC_022650	GAA	2	6	36439	36444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555148
584	NC_022650	CTAA	2	8	36448	36455	50 %	25 %	0 %	25 %	556555148
585	NC_022650	TTA	2	6	36478	36483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555148
586	NC_022650	GAA	2	6	36502	36507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555148
587	NC_022650	CAT	2	6	36570	36575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555149
588	NC_022650	ACA	2	6	36592	36597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555149
589	NC_022650	ATA	3	9	36715	36723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555149
590	NC_022650	CGA	2	6	36727	36732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555149
591	NC_022650	AAC	2	6	36744	36749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555149
592	NC_022650	GATA	2	8	36774	36781	50 %	25 %	25 %	0 %	556555149
593	NC_022650	TAA	2	6	36787	36792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555149
594	NC_022650	AAAAGA	2	12	36852	36863	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	556555149
595	NC_022650	CTA	2	6	36913	36918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555149
596	NC_022650	ACAAA	2	10	36919	36928	80 %	0 %	0 %	20 %	556555149
597	NC_022650	TAA	2	6	37016	37021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555150
598	NC_022650	TTTG	2	8	37163	37170	0 %	75 %	25 %	0 %	556555150
599	NC_022650	AAG	2	6	37184	37189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555150
600	NC_022650	GGC	2	6	37194	37199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555150
601	NC_022650	AAC	2	6	37228	37233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555150
602	NC_022650	TAT	2	6	37248	37253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555150
603	NC_022650	ATT	2	6	37291	37296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555150
604	NC_022650	TCTT	2	8	37312	37319	0 %	75 %	0 %	25 %	556555151
605	NC_022650	TTC	2	6	37349	37354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555151
606	NC_022650	AC	3	6	37365	37370	50 %	0 %	0 %	50 %	556555151
607	NC_022650	TTTG	2	8	37512	37519	0 %	75 %	25 %	0 %	556555151
608	NC_022650	TCC	2	6	37794	37799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555152
609	NC_022650	TAA	2	6	37875	37880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555152
610	NC_022650	GCTG	2	8	37890	37897	0 %	25 %	50 %	25 %	556555152
611	NC_022650	T	7	7	37901	37907	0 %	100 %	0 %	0 %	556555152
612	NC_022650	CT	3	6	38008	38013	0 %	50 %	0 %	50 %	556555152
613	NC_022650	GGCT	2	8	38022	38029	0 %	25 %	50 %	25 %	556555152
614	NC_022650	CAT	2	6	38077	38082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555152
615	NC_022650	GCT	2	6	38136	38141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555152
616	NC_022650	AATT	2	8	38186	38193	50 %	50 %	0 %	0 %	556555152
617	NC_022650	TTA	2	6	38213	38218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555153
618	NC_022650	TAAA	2	8	38249	38256	75 %	25 %	0 %	0 %	556555153
619	NC_022650	ATT	2	6	38300	38305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555153
620	NC_022650	ATAA	2	8	38335	38342	75 %	25 %	0 %	0 %	556555153
621	NC_022650	ACA	2	6	38373	38378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555153
622	NC_022650	AGAA	2	8	38396	38403	75 %	0 %	25 %	0 %	556555153
623	NC_022650	CTTT	2	8	38508	38515	0 %	75 %	0 %	25 %	556555154
624	NC_022650	TGC	2	6	38543	38548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555154
625	NC_022650	ACC	3	9	38579	38587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555154
626	NC_022650	CTT	2	6	38592	38597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555154
627	NC_022650	GTA	2	6	38616	38621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555154
628	NC_022650	CTG	2	6	38635	38640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555154
629	NC_022650	TGT	2	6	38655	38660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555154
630	NC_022650	TG	3	6	38672	38677	0 %	50 %	50 %	0 %	556555154
631	NC_022650	TGA	2	6	38699	38704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555154
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634	NC_022650	T	6	6	38781	38786	0 %	100 %	0 %	0 %	556555155
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638	NC_022650	ACT	2	6	39196	39201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555155
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644	NC_022650	GTTT	2	8	39544	39551	0 %	75 %	25 %	0 %	556555156
645	NC_022650	ATA	2	6	39604	39609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555156
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751	NC_022650	T	6	6	46754	46759	0 %	100 %	0 %	0 %	556555169
752	NC_022650	T	6	6	46832	46837	0 %	100 %	0 %	0 %	556555169
753	NC_022650	TTCT	2	8	46849	46856	0 %	75 %	0 %	25 %	556555169
754	NC_022650	AAC	2	6	46879	46884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555169
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758	NC_022650	ATG	2	6	47117	47122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555169
759	NC_022650	T	6	6	47294	47299	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
760	NC_022650	CTG	3	9	47321	47329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555170
761	NC_022650	T	6	6	47330	47335	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
762	NC_022650	GCG	2	6	47438	47443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555170
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772	NC_022650	TAG	2	6	47845	47850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555170
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788	NC_022650	CTT	2	6	48685	48690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555170
789	NC_022650	T	7	7	48711	48717	0 %	100 %	0 %	0 %	556555170
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793	NC_022650	CGCC	2	8	48906	48913	0 %	0 %	25 %	75 %	556555170
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888	NC_022650	T	6	6	54633	54638	0 %	100 %	0 %	0 %	556555174

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