MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_2

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022649	TGC	2	6	115	120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
2	NC_022649	ACG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555084
3	NC_022649	CTG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
4	NC_022649	AAG	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555084
5	NC_022649	ATC	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555084
6	NC_022649	TCG	2	6	903	908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
7	NC_022649	GCG	2	6	921	926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555084
8	NC_022649	TAT	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555083
9	NC_022649	TGA	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555083
10	NC_022649	CCA	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555086
11	NC_022649	CCG	2	6	3017	3022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555086
12	NC_022649	TCT	2	6	3460	3465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555086
13	NC_022649	CAT	2	6	3586	3591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
14	NC_022649	ATG	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555087
15	NC_022649	CAT	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
16	NC_022649	CGT	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555087
17	NC_022649	CAT	2	6	4009	4014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
18	NC_022649	TCA	2	6	4027	4032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
19	NC_022649	CGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555087
20	NC_022649	GCC	2	6	4233	4238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555087
21	NC_022649	CCA	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555087
22	NC_022649	GAA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555088
23	NC_022649	TCA	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555088
24	NC_022649	ACG	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555088

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.