MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886

Total Repeats: 2788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022648	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	556550244
2	NC_022648	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	556550245
3	NC_022648	CGCAG	2	10	8247	8256	20 %	0 %	40 %	40 %	556550250
4	NC_022648	GTGAA	2	10	8924	8933	40 %	20 %	40 %	0 %	556550250
5	NC_022648	CGTAC	2	10	9675	9684	20 %	20 %	20 %	40 %	556550251
6	NC_022648	CGCGC	2	10	10662	10671	0 %	0 %	40 %	60 %	556550253
7	NC_022648	GTTTC	2	10	11558	11567	0 %	60 %	20 %	20 %	556550254
8	NC_022648	CTGGA	2	10	17929	17938	20 %	20 %	40 %	20 %	556554221
9	NC_022648	TCCTT	2	10	19607	19616	0 %	60 %	0 %	40 %	556554222
10	NC_022648	CCAGA	2	10	24137	24146	40 %	0 %	20 %	40 %	556554223
11	NC_022648	GCGAA	2	10	37983	37992	40 %	0 %	40 %	20 %	556550270
12	NC_022648	CCGTT	2	10	38877	38886	0 %	40 %	20 %	40 %	556550270
13	NC_022648	CACGG	2	10	39254	39263	20 %	0 %	40 %	40 %	556550270
14	NC_022648	CGAAT	2	10	41996	42005	40 %	20 %	20 %	20 %	556550274
15	NC_022648	CCATG	2	10	43533	43542	20 %	20 %	20 %	40 %	556550275
16	NC_022648	CCGTA	2	10	45179	45188	20 %	20 %	20 %	40 %	556550276
17	NC_022648	TTAAA	2	10	45917	45926	60 %	40 %	0 %	0 %	556550276
18	NC_022648	ACCCA	2	10	46660	46669	40 %	0 %	0 %	60 %	556550277
19	NC_022648	TTTGA	2	10	48286	48295	20 %	60 %	20 %	0 %	556550278
20	NC_022648	CGGCG	2	10	48537	48546	0 %	0 %	60 %	40 %	556550278
21	NC_022648	AATCA	2	10	48819	48828	60 %	20 %	0 %	20 %	556550279
22	NC_022648	CGGTT	2	10	49774	49783	0 %	40 %	40 %	20 %	556550280
23	NC_022648	TGGCG	2	10	51466	51475	0 %	20 %	60 %	20 %	556550282
24	NC_022648	TGCAC	2	10	53228	53237	20 %	20 %	20 %	40 %	556550283
25	NC_022648	AGGGC	2	10	54313	54322	20 %	0 %	60 %	20 %	556550284
26	NC_022648	AACGT	2	10	57633	57642	40 %	20 %	20 %	20 %	556550288
27	NC_022648	GCGTC	2	10	60617	60626	0 %	20 %	40 %	40 %	556550291
28	NC_022648	ATGTT	2	10	61431	61440	20 %	60 %	20 %	0 %	556550292
29	NC_022648	CTTCG	2	10	61864	61873	0 %	40 %	20 %	40 %	556550292
30	NC_022648	TGCGT	2	10	62150	62159	0 %	40 %	40 %	20 %	556550292
31	NC_022648	AAAGT	2	10	67917	67926	60 %	20 %	20 %	0 %	556550295
32	NC_022648	GGTGA	2	10	70165	70174	20 %	20 %	60 %	0 %	556550296
33	NC_022648	CAGCG	2	10	71448	71457	20 %	0 %	40 %	40 %	556550298
34	NC_022648	TCGCG	2	10	72718	72727	0 %	20 %	40 %	40 %	556550298
35	NC_022648	TCGCT	2	10	77167	77176	0 %	40 %	20 %	40 %	556554226
36	NC_022648	GCGAA	2	10	78884	78893	40 %	0 %	40 %	20 %	556554228
37	NC_022648	TTTTA	2	10	79581	79590	20 %	80 %	0 %	0 %	556554229
38	NC_022648	CAGCA	2	10	81712	81721	40 %	0 %	20 %	40 %	556550301
39	NC_022648	TTGCT	2	10	85809	85818	0 %	60 %	20 %	20 %	556550305
40	NC_022648	GATGG	2	10	86545	86554	20 %	20 %	60 %	0 %	556550305
41	NC_022648	GGGAG	2	10	87537	87546	20 %	0 %	80 %	0 %	556554231
42	NC_022648	ACCGG	2	10	88541	88550	20 %	0 %	40 %	40 %	556550307
43	NC_022648	CCTGG	2	10	88797	88806	0 %	20 %	40 %	40 %	556550307
44	NC_022648	ATGCG	2	10	90242	90251	20 %	20 %	40 %	20 %	556550308
45	NC_022648	ATGTT	2	10	93610	93619	20 %	60 %	20 %	0 %	556550310
46	NC_022648	AAAAC	2	10	94025	94034	80 %	0 %	0 %	20 %	556550310
47	NC_022648	TGCAT	2	10	94552	94561	20 %	40 %	20 %	20 %	556550311
48	NC_022648	ATTCC	2	10	94722	94731	20 %	40 %	0 %	40 %	556550311
49	NC_022648	AGTTC	2	10	99815	99824	20 %	40 %	20 %	20 %	556550315
50	NC_022648	TGCCT	2	10	99915	99924	0 %	40 %	20 %	40 %	556550316
51	NC_022648	CGTGG	2	10	101188	101197	0 %	20 %	60 %	20 %	556550317
52	NC_022648	TATCG	2	10	101695	101704	20 %	40 %	20 %	20 %	556550317
53	NC_022648	GGGCT	2	10	105567	105576	0 %	20 %	60 %	20 %	556550320
54	NC_022648	GCCTG	2	10	106027	106036	0 %	20 %	40 %	40 %	556550321
55	NC_022648	TCTGG	2	10	107274	107283	0 %	40 %	40 %	20 %	556550322
56	NC_022648	ACCGT	2	10	107940	107949	20 %	20 %	20 %	40 %	556550322
57	NC_022648	ATCAG	2	10	109713	109722	40 %	20 %	20 %	20 %	556550324
58	NC_022648	AGCCG	2	10	111481	111490	20 %	0 %	40 %	40 %	556550325
59	NC_022648	GCGCA	2	10	113809	113818	20 %	0 %	40 %	40 %	556550327
60	NC_022648	CGCGG	2	10	120978	120987	0 %	0 %	60 %	40 %	556550333
61	NC_022648	CATCG	2	10	123235	123244	20 %	20 %	20 %	40 %	556550336
62	NC_022648	TAACG	2	10	123929	123938	40 %	20 %	20 %	20 %	556550336
63	NC_022648	TCTGT	2	10	126618	126627	0 %	60 %	20 %	20 %	556550338
64	NC_022648	GCAGG	2	10	129050	129059	20 %	0 %	60 %	20 %	556550341
65	NC_022648	TCATT	2	10	134090	134099	20 %	60 %	0 %	20 %	556554237
66	NC_022648	CGAAG	2	10	135567	135576	40 %	0 %	40 %	20 %	556550343
67	NC_022648	ACACG	2	10	135700	135709	40 %	0 %	20 %	40 %	556550343
68	NC_022648	TCGCG	2	10	135961	135970	0 %	20 %	40 %	40 %	556550343
69	NC_022648	GCATC	2	10	136051	136060	20 %	20 %	20 %	40 %	556550343
70	NC_022648	GACTG	2	10	137369	137378	20 %	20 %	40 %	20 %	556550344
71	NC_022648	AGAGC	2	10	137779	137788	40 %	0 %	40 %	20 %	556550344
72	NC_022648	TCTGG	2	10	146243	146252	0 %	40 %	40 %	20 %	556550348
73	NC_022648	GGGCA	2	10	147654	147663	20 %	0 %	60 %	20 %	556550349
74	NC_022648	CAGCG	2	10	147933	147942	20 %	0 %	40 %	40 %	556550350
75	NC_022648	ACGAC	2	10	149213	149222	40 %	0 %	20 %	40 %	556550351
76	NC_022648	GCGCG	2	10	153972	153981	0 %	0 %	60 %	40 %	556550354
77	NC_022648	CCGTC	2	10	154763	154772	0 %	20 %	20 %	60 %	556550355
78	NC_022648	GTGAA	2	10	154773	154782	40 %	20 %	40 %	0 %	556550355
79	NC_022648	GTTCA	2	10	155160	155169	20 %	40 %	20 %	20 %	556550356
80	NC_022648	ATCCA	2	10	155486	155495	40 %	20 %	0 %	40 %	556550356
81	NC_022648	CTTTA	2	10	156749	156758	20 %	60 %	0 %	20 %	556550358
82	NC_022648	GGGAG	2	10	160614	160623	20 %	0 %	80 %	0 %	556550362
83	NC_022648	TGTGG	2	10	163717	163726	0 %	40 %	60 %	0 %	556554241
84	NC_022648	TTTGC	2	10	168784	168793	0 %	60 %	20 %	20 %	556550369
85	NC_022648	TGCTG	2	10	169845	169854	0 %	40 %	40 %	20 %	556550370
86	NC_022648	TCGGC	2	10	171666	171675	0 %	20 %	40 %	40 %	556554242
87	NC_022648	GGCGT	2	10	172091	172100	0 %	20 %	60 %	20 %	556554242
88	NC_022648	ACCAC	2	10	174994	175003	40 %	0 %	0 %	60 %	556550375
89	NC_022648	GGCGT	2	10	176697	176706	0 %	20 %	60 %	20 %	556550376
90	NC_022648	CGACG	2	10	177736	177745	20 %	0 %	40 %	40 %	556550376
91	NC_022648	TCAAA	2	10	181438	181447	60 %	20 %	0 %	20 %	556550378
92	NC_022648	ACATC	2	10	183871	183880	40 %	20 %	0 %	40 %	556550379
93	NC_022648	CTTTC	2	10	186635	186644	0 %	60 %	0 %	40 %	556550380
94	NC_022648	GCAAA	2	10	187038	187047	60 %	0 %	20 %	20 %	556550380
95	NC_022648	TGGTT	2	10	187123	187132	0 %	60 %	40 %	0 %	556550380
96	NC_022648	TGGTC	2	10	189244	189253	0 %	40 %	40 %	20 %	556550381
97	NC_022648	TGGCG	2	10	190489	190498	0 %	20 %	60 %	20 %	556550382
98	NC_022648	CGGCG	2	10	191119	191128	0 %	0 %	60 %	40 %	556550382
99	NC_022648	TTCCA	2	10	191730	191739	20 %	40 %	0 %	40 %	556550382
100	NC_022648	ACATC	2	10	192014	192023	40 %	20 %	0 %	40 %	556550383
101	NC_022648	GACCG	2	10	192255	192264	20 %	0 %	40 %	40 %	556550383
102	NC_022648	GGTCC	2	10	196053	196062	0 %	20 %	40 %	40 %	556550387
103	NC_022648	ACGGG	2	10	197970	197979	20 %	0 %	60 %	20 %	556550389
104	NC_022648	TGCGC	2	10	199677	199686	0 %	20 %	40 %	40 %	556550390
105	NC_022648	GTGAT	2	10	200129	200138	20 %	40 %	40 %	0 %	556550390
106	NC_022648	GTGAT	2	10	200420	200429	20 %	40 %	40 %	0 %	556550390
107	NC_022648	GCCAG	2	10	204099	204108	20 %	0 %	40 %	40 %	556550394
108	NC_022648	GGCGT	2	10	204937	204946	0 %	20 %	60 %	20 %	556550394
109	NC_022648	GTTCT	2	10	205540	205549	0 %	60 %	20 %	20 %	556550394
110	NC_022648	CTGAA	2	10	207532	207541	40 %	20 %	20 %	20 %	556550396
111	NC_022648	AAGCG	2	10	207596	207605	40 %	0 %	40 %	20 %	556550396
112	NC_022648	TGGTG	2	10	209379	209388	0 %	40 %	60 %	0 %	556550398
113	NC_022648	TGCAC	2	10	209505	209514	20 %	20 %	20 %	40 %	556550398
114	NC_022648	TGCGC	2	10	209898	209907	0 %	20 %	40 %	40 %	556550398
115	NC_022648	CATGG	2	10	211599	211608	20 %	20 %	40 %	20 %	556550400
116	NC_022648	CAGAT	2	10	212638	212647	40 %	20 %	20 %	20 %	556550401
117	NC_022648	ACTTT	2	10	212771	212780	20 %	60 %	0 %	20 %	556550401
118	NC_022648	GACGT	2	10	216691	216700	20 %	20 %	40 %	20 %	556550404
119	NC_022648	ATGCC	2	10	221086	221095	20 %	20 %	20 %	40 %	556550409
120	NC_022648	TGGCC	2	10	222412	222421	0 %	20 %	40 %	40 %	556550411
121	NC_022648	ACCGC	2	10	222425	222434	20 %	0 %	20 %	60 %	556550411
122	NC_022648	GTAAC	2	10	223155	223164	40 %	20 %	20 %	20 %	556550411
123	NC_022648	AGCCG	2	10	223783	223792	20 %	0 %	40 %	40 %	556550411
124	NC_022648	GGTGG	2	10	223892	223901	0 %	20 %	80 %	0 %	556550411
125	NC_022648	ACGGT	2	10	234902	234911	20 %	20 %	40 %	20 %	556550422
126	NC_022648	AGCTC	2	10	235590	235599	20 %	20 %	20 %	40 %	556550422
127	NC_022648	TGATT	2	10	237743	237752	20 %	60 %	20 %	0 %	556550425
128	NC_022648	GTGAA	2	10	249579	249588	40 %	20 %	40 %	0 %	556550432
129	NC_022648	TAATT	2	10	249763	249772	40 %	60 %	0 %	0 %	556550432
130	NC_022648	CGCGG	2	10	253747	253756	0 %	0 %	60 %	40 %	556550437
131	NC_022648	TGAAC	2	10	258663	258672	40 %	20 %	20 %	20 %	556550441
132	NC_022648	AAACG	2	10	260848	260857	60 %	0 %	20 %	20 %	556550443
133	NC_022648	TGCAT	2	10	262316	262325	20 %	40 %	20 %	20 %	556550445
134	NC_022648	AGGGC	2	10	263628	263637	20 %	0 %	60 %	20 %	556550446
135	NC_022648	AGGGA	2	10	264191	264200	40 %	0 %	60 %	0 %	556550446
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149	NC_022648	TACCG	2	10	286661	286670	20 %	20 %	20 %	40 %	556554265
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246	NC_022648	AGTTC	2	10	457959	457968	20 %	40 %	20 %	20 %	556550566
247	NC_022648	CACTT	2	10	459533	459542	20 %	40 %	0 %	40 %	556550567
248	NC_022648	CTCGT	2	10	459807	459816	0 %	40 %	20 %	40 %	556550568
249	NC_022648	GCGAC	2	10	460741	460750	20 %	0 %	40 %	40 %	556550569
250	NC_022648	GCGCT	2	10	463152	463161	0 %	20 %	40 %	40 %	556550572
251	NC_022648	AGCGT	2	10	465226	465235	20 %	20 %	40 %	20 %	556550575
252	NC_022648	AAGGC	2	10	467080	467089	40 %	0 %	40 %	20 %	556550576
253	NC_022648	TGCCG	2	10	470719	470728	0 %	20 %	40 %	40 %	556550580
254	NC_022648	CGCCA	2	10	472245	472254	20 %	0 %	20 %	60 %	556550582
255	NC_022648	CACAA	2	10	472414	472423	60 %	0 %	0 %	40 %	556550582
256	NC_022648	GGGCA	2	10	472593	472602	20 %	0 %	60 %	20 %	556550582
257	NC_022648	GTGAT	2	10	473711	473720	20 %	40 %	40 %	0 %	556550583
258	NC_022648	ACCGC	2	10	475768	475777	20 %	0 %	20 %	60 %	556550586
259	NC_022648	CCAGC	2	10	479661	479670	20 %	0 %	20 %	60 %	556550588
260	NC_022648	GTTTT	2	10	481495	481504	0 %	80 %	20 %	0 %	556554302
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262	NC_022648	CGTTC	2	10	484470	484479	0 %	40 %	20 %	40 %	556550593
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392	NC_022648	TCGCG	2	10	738279	738288	0 %	20 %	40 %	40 %	556550789
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499	NC_022648	CGGAA	2	10	927527	927536	40 %	0 %	40 %	20 %	556550956
500	NC_022648	ATGGC	2	10	927600	927609	20 %	20 %	40 %	20 %	556550956

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