MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886

Total Repeats: 92040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022648	GTT	2	6	29170	29175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556550263
502	NC_022648	TGA	2	6	29261	29266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550263
503	NC_022648	CGC	2	6	29375	29380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556550263
504	NC_022648	TGA	2	6	29387	29392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550263
505	NC_022648	TGC	2	6	29481	29486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550263
506	NC_022648	TCG	2	6	29496	29501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550263
507	NC_022648	CG	3	6	29514	29519	0 %	0 %	50 %	50 %	556550263
508	NC_022648	CTG	2	6	29524	29529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550263
509	NC_022648	TGG	2	6	29582	29587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550263
510	NC_022648	CAT	2	6	29727	29732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556550263
511	NC_022648	CGT	2	6	29773	29778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550263
512	NC_022648	TGA	2	6	29853	29858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550263
513	NC_022648	GGC	2	6	30037	30042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550263
514	NC_022648	GGC	2	6	30084	30089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550263
515	NC_022648	ACG	2	6	30161	30166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556550263
516	NC_022648	CTG	2	6	30170	30175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550263
517	NC_022648	CAG	2	6	30181	30186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556550263
518	NC_022648	GCT	2	6	30248	30253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550263
519	NC_022648	CGGTGA	2	12	30327	30338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556550263
520	NC_022648	TGA	2	6	30355	30360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550263
521	NC_022648	GCTG	2	8	30388	30395	0 %	25 %	50 %	25 %	556550264
522	NC_022648	TGG	2	6	30400	30405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550264
523	NC_022648	GCA	2	6	30430	30435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556550264
524	NC_022648	TCC	2	6	30445	30450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556550264
525	NC_022648	GCG	2	6	30522	30527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550264
526	NC_022648	GCG	2	6	30547	30552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550264
527	NC_022648	TGA	2	6	30610	30615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550264
528	NC_022648	ATT	2	6	30666	30671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556550264
529	NC_022648	GGC	2	6	30672	30677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550264
530	NC_022648	GC	3	6	30676	30681	0 %	0 %	50 %	50 %	556550264
531	NC_022648	T	6	6	30821	30826	0 %	100 %	0 %	0 %	556550264
532	NC_022648	A	6	6	30840	30845	100 %	0 %	0 %	0 %	556550264
533	NC_022648	AAT	2	6	30847	30852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556550264
534	NC_022648	GAT	2	6	31016	31021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550265
535	NC_022648	CAC	2	6	31024	31029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556550265
536	NC_022648	CAA	2	6	31045	31050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556550265
537	NC_022648	CTG	2	6	31112	31117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550265
538	NC_022648	ACC	2	6	31139	31144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556550265
539	NC_022648	GCG	2	6	31163	31168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550265
540	NC_022648	CCG	2	6	31207	31212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556550265
541	NC_022648	ATGG	2	8	31268	31275	25 %	25 %	50 %	0 %	556550265
542	NC_022648	TTG	2	6	31471	31476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556550266
543	NC_022648	AT	3	6	31506	31511	50 %	50 %	0 %	0 %	556550266
544	NC_022648	GTG	2	6	31524	31529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550266
545	NC_022648	CGT	2	6	31740	31745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550266
546	NC_022648	GAA	2	6	31749	31754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556550266
547	NC_022648	TG	3	6	31856	31861	0 %	50 %	50 %	0 %	556550266
548	NC_022648	AGT	2	6	32054	32059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550266
549	NC_022648	TGG	2	6	32062	32067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550266
550	NC_022648	CTC	2	6	32081	32086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556550266
551	NC_022648	TTGA	2	8	32139	32146	25 %	50 %	25 %	0 %	556550266
552	NC_022648	TGG	2	6	32242	32247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550266
553	NC_022648	GCA	2	6	32255	32260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556550266
554	NC_022648	GAA	2	6	32298	32303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556550266
555	NC_022648	GCC	2	6	32483	32488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556550267
556	NC_022648	TGA	2	6	32520	32525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550267
557	NC_022648	ACC	2	6	32558	32563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556550267
558	NC_022648	CTG	2	6	32579	32584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550267
559	NC_022648	CG	3	6	32646	32651	0 %	0 %	50 %	50 %	556550267
560	NC_022648	TGGC	2	8	32682	32689	0 %	25 %	50 %	25 %	556550267
561	NC_022648	TTG	2	6	32697	32702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556550267
562	NC_022648	TGCG	2	8	32760	32767	0 %	25 %	50 %	25 %	556550267
563	NC_022648	TGG	2	6	32784	32789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550267
564	NC_022648	CTG	2	6	32880	32885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550267
565	NC_022648	CTGG	2	8	33142	33149	0 %	25 %	50 %	25 %	556550267
566	NC_022648	ACG	2	6	33221	33226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556550267
567	NC_022648	GTT	2	6	33227	33232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556550267
568	NC_022648	CTGGAT	2	12	33278	33289	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556550267
569	NC_022648	CAG	2	6	33302	33307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556550267
570	NC_022648	TAA	3	9	33338	33346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556550267
571	NC_022648	TCTG	2	8	33469	33476	0 %	50 %	25 %	25 %	556554225
572	NC_022648	TGG	2	6	33492	33497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556554225
573	NC_022648	T	8	8	33535	33542	0 %	100 %	0 %	0 %	556554225
574	NC_022648	ATTT	2	8	33557	33564	25 %	75 %	0 %	0 %	556554225
575	NC_022648	GTG	2	6	33635	33640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556554225
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578	NC_022648	GCC	2	6	33941	33946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556550268
579	NC_022648	GCG	2	6	33958	33963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550268
580	NC_022648	GCG	2	6	33991	33996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550268
581	NC_022648	TCT	2	6	34012	34017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556550268
582	NC_022648	AGT	2	6	34078	34083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550268
583	NC_022648	GAT	2	6	34099	34104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550268
584	NC_022648	CGC	3	9	34236	34244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556550268
585	NC_022648	GCC	2	6	34264	34269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556550268
586	NC_022648	CTG	2	6	34303	34308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550268
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589	NC_022648	CAT	2	6	34363	34368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556550268
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592	NC_022648	CGG	2	6	35239	35244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550269
593	NC_022648	TCCT	2	8	35300	35307	0 %	50 %	0 %	50 %	556550269
594	NC_022648	CTTA	2	8	35328	35335	25 %	50 %	0 %	25 %	556550269
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596	NC_022648	TCT	2	6	35379	35384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556550269
597	NC_022648	CT	3	6	35457	35462	0 %	50 %	0 %	50 %	556550269
598	NC_022648	GCG	2	6	35583	35588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550269
599	NC_022648	CG	3	6	35607	35612	0 %	0 %	50 %	50 %	556550269
600	NC_022648	AAG	2	6	35644	35649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556550269
601	NC_022648	CGG	2	6	35699	35704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550269
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604	NC_022648	TGG	2	6	35791	35796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550269
605	NC_022648	GTC	2	6	35806	35811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550269
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607	NC_022648	CAC	2	6	36033	36038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556550269
608	NC_022648	GGC	2	6	36039	36044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550269
609	NC_022648	TGA	2	6	36079	36084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550269
610	NC_022648	CA	3	6	36146	36151	50 %	0 %	0 %	50 %	556550269
611	NC_022648	AGCC	2	8	36230	36237	25 %	0 %	25 %	50 %	556550269
612	NC_022648	ACG	2	6	36247	36252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556550269
613	NC_022648	GTT	2	6	36260	36265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556550269
614	NC_022648	ACT	2	6	36411	36416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556550270
615	NC_022648	GC	3	6	36420	36425	0 %	0 %	50 %	50 %	556550270
616	NC_022648	CAT	2	6	36490	36495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556550270
617	NC_022648	GACC	2	8	36496	36503	25 %	0 %	25 %	50 %	556550270
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620	NC_022648	G	7	7	36601	36607	0 %	0 %	100 %	0 %	556550270
621	NC_022648	CCG	3	9	36715	36723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556550270
622	NC_022648	GAA	2	6	36739	36744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556550270
623	NC_022648	GAA	2	6	36788	36793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556550270
624	NC_022648	ATT	2	6	36830	36835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556550270
625	NC_022648	GCG	3	9	36861	36869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550270
626	NC_022648	GAA	2	6	36896	36901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556550270
627	NC_022648	GCT	2	6	36940	36945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550270
628	NC_022648	TGA	2	6	36949	36954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550270
629	NC_022648	GTG	2	6	36989	36994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550270
630	NC_022648	ATC	2	6	37016	37021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556550270
631	NC_022648	GGT	2	6	37169	37174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550270
632	NC_022648	CTC	2	6	37249	37254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556550270
633	NC_022648	GGC	2	6	37297	37302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550270
634	NC_022648	CGA	2	6	37327	37332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556550270
635	NC_022648	TGA	2	6	37335	37340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550270
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641	NC_022648	CTGT	2	8	37670	37677	0 %	50 %	25 %	25 %	556550270
642	NC_022648	GCGT	2	8	37851	37858	0 %	25 %	50 %	25 %	556550270
643	NC_022648	GAA	2	6	37973	37978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556550270
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645	NC_022648	A	6	6	38010	38015	100 %	0 %	0 %	0 %	556550270
646	NC_022648	CGG	3	9	38026	38034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550270
647	NC_022648	ACT	2	6	38067	38072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556550270
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649	NC_022648	GC	5	10	38282	38291	0 %	0 %	50 %	50 %	556550270
650	NC_022648	GCT	2	6	38297	38302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556550270
651	NC_022648	CTGAAA	2	12	38384	38395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	556550270
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654	NC_022648	CGTC	2	8	38474	38481	0 %	25 %	25 %	50 %	556550270
655	NC_022648	CGG	2	6	38491	38496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550270
656	NC_022648	TGA	2	6	38599	38604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550270
657	NC_022648	GGC	2	6	38657	38662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550270
658	NC_022648	CAG	2	6	38762	38767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556550270
659	NC_022648	TGA	2	6	38805	38810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556550270
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661	NC_022648	GCG	2	6	38867	38872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550270
662	NC_022648	CCGTT	2	10	38877	38886	0 %	40 %	20 %	40 %	556550270
663	NC_022648	GGC	2	6	38923	38928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556550270
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665	NC_022648	GCTG	2	8	38950	38957	0 %	25 %	50 %	25 %	556550270
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703	NC_022648	CA	3	6	40649	40654	50 %	0 %	0 %	50 %	556550272
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725	NC_022648	ATT	2	6	41837	41842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556550274
726	NC_022648	TTCA	2	8	41959	41966	25 %	50 %	0 %	25 %	556550274
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728	NC_022648	CGAAT	2	10	41996	42005	40 %	20 %	20 %	20 %	556550274
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746	NC_022648	GGT	2	6	42817	42822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550274
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995	NC_022648	TGG	2	6	54978	54983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556550284
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997	NC_022648	TGGC	2	8	55105	55112	0 %	25 %	50 %	25 %	556550284
998	NC_022648	GAA	2	6	55121	55126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556550284
999	NC_022648	TAA	2	6	55178	55183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556550284
1000	NC_022648	CAG	2	6	55271	55276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556550285

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