MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Eubacterium siraeum V10Sc8a draft genome

Total Repeats: 1420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021043	GCTGA	2	10	3084	3093	20 %	20 %	40 %	20 %	479210987
2	NC_021043	GCCTT	2	10	3519	3528	0 %	40 %	20 %	40 %	479210988
3	NC_021043	CTCGA	2	10	5614	5623	20 %	20 %	20 %	40 %	479210989
4	NC_021043	TAACG	2	10	7712	7721	40 %	20 %	20 %	20 %	479210991
5	NC_021043	AGGTG	2	10	9549	9558	20 %	20 %	60 %	0 %	479210992
6	NC_021043	GCTCA	2	10	13395	13404	20 %	20 %	20 %	40 %	479210995
7	NC_021043	TTACA	2	10	15026	15035	40 %	40 %	0 %	20 %	479210996
8	NC_021043	ACAGA	2	10	17044	17053	60 %	0 %	20 %	20 %	479210997
9	NC_021043	TGAGC	2	10	21799	21808	20 %	20 %	40 %	20 %	479211003
10	NC_021043	CAGTG	2	10	22164	22173	20 %	20 %	40 %	20 %	479211004
11	NC_021043	CACCG	2	10	23293	23302	20 %	0 %	20 %	60 %	479211005
12	NC_021043	CACTT	2	10	28507	28516	20 %	40 %	0 %	40 %	479211011
13	NC_021043	GCCAT	2	10	29894	29903	20 %	20 %	20 %	40 %	479211012
14	NC_021043	AGCAT	2	10	29971	29980	40 %	20 %	20 %	20 %	479211012
15	NC_021043	GTAGC	2	10	31005	31014	20 %	20 %	40 %	20 %	479211013
16	NC_021043	ATCTT	2	10	31500	31509	20 %	60 %	0 %	20 %	479211014
17	NC_021043	GGTGC	2	10	31670	31679	0 %	20 %	60 %	20 %	479211014
18	NC_021043	TGCGG	2	10	31988	31997	0 %	20 %	60 %	20 %	479211014
19	NC_021043	TCCTG	2	10	32515	32524	0 %	40 %	20 %	40 %	479211014
20	NC_021043	CGGTG	2	10	33878	33887	0 %	20 %	60 %	20 %	479211016
21	NC_021043	CACCG	2	10	35671	35680	20 %	0 %	20 %	60 %	479211018
22	NC_021043	TATCC	2	10	36027	36036	20 %	40 %	0 %	40 %	479211018
23	NC_021043	AGGAA	2	10	36876	36885	60 %	0 %	40 %	0 %	479211018
24	NC_021043	CAGAA	2	10	38921	38930	60 %	0 %	20 %	20 %	479211020
25	NC_021043	GTTAA	2	10	39684	39693	40 %	40 %	20 %	0 %	479211021
26	NC_021043	CAGTT	2	10	41784	41793	20 %	40 %	20 %	20 %	479211024
27	NC_021043	CTGTC	2	10	42509	42518	0 %	40 %	20 %	40 %	479211024
28	NC_021043	CTTTG	2	10	43477	43486	0 %	60 %	20 %	20 %	479211025
29	NC_021043	TGCAC	2	10	46573	46582	20 %	20 %	20 %	40 %	479211026
30	NC_021043	TTTTA	2	10	49342	49351	20 %	80 %	0 %	0 %	479211030
31	NC_021043	GATGA	2	10	50036	50045	40 %	20 %	40 %	0 %	479211031
32	NC_021043	CTGAA	2	10	53541	53550	40 %	20 %	20 %	20 %	479211033
33	NC_021043	TCCCA	2	10	54334	54343	20 %	20 %	0 %	60 %	479211034
34	NC_021043	AATCA	2	10	55872	55881	60 %	20 %	0 %	20 %	479211034
35	NC_021043	CAGAA	2	10	59253	59262	60 %	0 %	20 %	20 %	479211037
36	NC_021043	CCACA	2	10	59596	59605	40 %	0 %	0 %	60 %	479211037
37	NC_021043	CGCAG	2	10	61185	61194	20 %	0 %	40 %	40 %	479211037
38	NC_021043	TAATT	2	10	63535	63544	40 %	60 %	0 %	0 %	479211038
39	NC_021043	TTCGG	2	10	66714	66723	0 %	40 %	40 %	20 %	479211042
40	NC_021043	CTTCC	2	10	66862	66871	0 %	40 %	0 %	60 %	479211042
41	NC_021043	TACCG	2	10	67967	67976	20 %	20 %	20 %	40 %	479211045
42	NC_021043	TATAA	2	10	68981	68990	60 %	40 %	0 %	0 %	479211045
43	NC_021043	TTGCA	2	10	72642	72651	20 %	40 %	20 %	20 %	479211048
44	NC_021043	AAGCT	2	10	75594	75603	40 %	20 %	20 %	20 %	479211050
45	NC_021043	AAAGC	2	10	75734	75743	60 %	0 %	20 %	20 %	479211050
46	NC_021043	GCCTT	2	10	75902	75911	0 %	40 %	20 %	40 %	479211051
47	NC_021043	GTATA	2	10	76797	76806	40 %	40 %	20 %	0 %	479211051
48	NC_021043	TGCTT	2	10	77919	77928	0 %	60 %	20 %	20 %	479211052
49	NC_021043	ACCGT	2	10	78882	78891	20 %	20 %	20 %	40 %	479211052
50	NC_021043	ATTTT	2	10	81986	81995	20 %	80 %	0 %	0 %	479211054
51	NC_021043	GTGAT	2	10	88836	88845	20 %	40 %	40 %	0 %	479211060
52	NC_021043	AGTAT	2	10	89018	89027	40 %	40 %	20 %	0 %	479211060
53	NC_021043	TCATC	2	10	90687	90696	20 %	40 %	0 %	40 %	479211062
54	NC_021043	GCCGA	2	10	93838	93847	20 %	0 %	40 %	40 %	479211064
55	NC_021043	CCGCA	2	10	104655	104664	20 %	0 %	20 %	60 %	479211070
56	NC_021043	ATAAC	2	10	105372	105381	60 %	20 %	0 %	20 %	479211071
57	NC_021043	AATAT	2	10	105405	105414	60 %	40 %	0 %	0 %	479211071
58	NC_021043	TTCTT	2	10	105477	105486	0 %	80 %	0 %	20 %	479211071
59	NC_021043	ACAGA	2	10	118140	118149	60 %	0 %	20 %	20 %	479211079
60	NC_021043	TCAAA	2	10	118651	118660	60 %	20 %	0 %	20 %	479211079
61	NC_021043	ATGCA	2	10	119581	119590	40 %	20 %	20 %	20 %	479211080
62	NC_021043	AATGC	2	10	119868	119877	40 %	20 %	20 %	20 %	479211080
63	NC_021043	TATGA	2	10	119958	119967	40 %	40 %	20 %	0 %	479211080
64	NC_021043	ACCGT	2	10	129988	129997	20 %	20 %	20 %	40 %	479211086
65	NC_021043	CAGAA	2	10	133171	133180	60 %	0 %	20 %	20 %	479211089
66	NC_021043	GAAAA	2	10	133374	133383	80 %	0 %	20 %	0 %	479211089
67	NC_021043	AAAGC	2	10	133548	133557	60 %	0 %	20 %	20 %	479211089
68	NC_021043	AGCAA	2	10	133647	133656	60 %	0 %	20 %	20 %	479211089
69	NC_021043	GCTCA	2	10	134189	134198	20 %	20 %	20 %	40 %	479211089
70	NC_021043	TAAAA	2	10	136213	136222	80 %	20 %	0 %	0 %	479211090
71	NC_021043	ACCGC	2	10	138622	138631	20 %	0 %	20 %	60 %	479211093
72	NC_021043	AGCAG	2	10	139182	139191	40 %	0 %	40 %	20 %	479211093
73	NC_021043	ACCGC	2	10	141024	141033	20 %	0 %	20 %	60 %	479211094
74	NC_021043	TTATC	2	10	141646	141655	20 %	60 %	0 %	20 %	479211094
75	NC_021043	ACGGT	2	10	142840	142849	20 %	20 %	40 %	20 %	479211096
76	NC_021043	TCCTC	2	10	143543	143552	0 %	40 %	0 %	60 %	479211097
77	NC_021043	TCGTT	2	10	143986	143995	0 %	60 %	20 %	20 %	479211097
78	NC_021043	ATCTT	2	10	144628	144637	20 %	60 %	0 %	20 %	479211098
79	NC_021043	ATGAG	2	10	152451	152460	40 %	20 %	40 %	0 %	479211100
80	NC_021043	TTATC	2	10	155745	155754	20 %	60 %	0 %	20 %	479211103
81	NC_021043	GGCAC	2	10	156509	156518	20 %	0 %	40 %	40 %	479211104
82	NC_021043	AAGAG	2	10	156738	156747	60 %	0 %	40 %	0 %	479211104
83	NC_021043	CAGCT	2	10	157256	157265	20 %	20 %	20 %	40 %	479211104
84	NC_021043	CAAGA	2	10	157767	157776	60 %	0 %	20 %	20 %	479211104
85	NC_021043	ATCTC	2	10	162160	162169	20 %	40 %	0 %	40 %	479211107
86	NC_021043	ATTTC	2	10	162716	162725	20 %	60 %	0 %	20 %	479211108
87	NC_021043	ATAGA	2	10	163741	163750	60 %	20 %	20 %	0 %	479211108
88	NC_021043	CTGCG	2	10	166788	166797	0 %	20 %	40 %	40 %	479211110
89	NC_021043	GGCAA	2	10	167301	167310	40 %	0 %	40 %	20 %	479211110
90	NC_021043	GAAAA	2	10	178409	178418	80 %	0 %	20 %	0 %	479211121
91	NC_021043	TATCA	2	10	180787	180796	40 %	40 %	0 %	20 %	479211122
92	NC_021043	GAGCG	2	10	181653	181662	20 %	0 %	60 %	20 %	479211123
93	NC_021043	TCTTA	2	10	182776	182785	20 %	60 %	0 %	20 %	479211124
94	NC_021043	GCACG	2	10	185750	185759	20 %	0 %	40 %	40 %	479211124
95	NC_021043	CGTCA	2	10	186345	186354	20 %	20 %	20 %	40 %	479211125
96	NC_021043	CTTTG	2	10	186939	186948	0 %	60 %	20 %	20 %	479211125
97	NC_021043	ATCTC	2	10	187043	187052	20 %	40 %	0 %	40 %	479211126
98	NC_021043	CCGTA	2	10	187698	187707	20 %	20 %	20 %	40 %	479211126
99	NC_021043	TCTGC	2	10	190580	190589	0 %	40 %	20 %	40 %	479211127
100	NC_021043	GCACA	2	10	190692	190701	40 %	0 %	20 %	40 %	479211127
101	NC_021043	ACAGA	2	10	190965	190974	60 %	0 %	20 %	20 %	479211127
102	NC_021043	CCGCC	2	10	191561	191570	0 %	0 %	20 %	80 %	479211129
103	NC_021043	GTGCC	2	10	194237	194246	0 %	20 %	40 %	40 %	479211132
104	NC_021043	CTTGC	2	10	196130	196139	0 %	40 %	20 %	40 %	479211133
105	NC_021043	AAGAC	2	10	198575	198584	60 %	0 %	20 %	20 %	479211136
106	NC_021043	GCAAG	2	10	198985	198994	40 %	0 %	40 %	20 %	479211137
107	NC_021043	CTTGT	2	10	205151	205160	0 %	60 %	20 %	20 %	479211138
108	NC_021043	TCCGT	2	10	206123	206132	0 %	40 %	20 %	40 %	479211138
109	NC_021043	ATATC	2	10	208640	208649	40 %	40 %	0 %	20 %	479211140
110	NC_021043	AGCCG	2	10	208887	208896	20 %	0 %	40 %	40 %	479211140
111	NC_021043	CTTGC	2	10	209098	209107	0 %	40 %	20 %	40 %	479211140
112	NC_021043	CATAG	2	10	209790	209799	40 %	20 %	20 %	20 %	479211140
113	NC_021043	CGTTT	2	10	210003	210012	0 %	60 %	20 %	20 %	479211140
114	NC_021043	CGTAT	2	10	214167	214176	20 %	40 %	20 %	20 %	479211140
115	NC_021043	ATATG	2	10	215502	215511	40 %	40 %	20 %	0 %	479211141
116	NC_021043	TGCGG	2	10	221388	221397	0 %	20 %	60 %	20 %	479211145
117	NC_021043	ACCCC	2	10	221587	221596	20 %	0 %	0 %	80 %	479211145
118	NC_021043	GTTGT	2	10	224137	224146	0 %	60 %	40 %	0 %	479211149
119	NC_021043	TATAA	2	10	225312	225321	60 %	40 %	0 %	0 %	479211149
120	NC_021043	AAGTT	2	10	225346	225355	40 %	40 %	20 %	0 %	479211149
121	NC_021043	ATAAC	2	10	225949	225958	60 %	20 %	0 %	20 %	479211149
122	NC_021043	CCTCA	2	10	226464	226473	20 %	20 %	0 %	60 %	479211150
123	NC_021043	GATAC	2	10	230808	230817	40 %	20 %	20 %	20 %	479211153
124	NC_021043	TGCCG	2	10	233834	233843	0 %	20 %	40 %	40 %	479211155
125	NC_021043	TTTTC	2	10	236352	236361	0 %	80 %	0 %	20 %	479211156
126	NC_021043	AACGT	2	10	236717	236726	40 %	20 %	20 %	20 %	479211156
127	NC_021043	TCTGC	2	10	239502	239511	0 %	40 %	20 %	40 %	479211157
128	NC_021043	CGTTC	2	10	241763	241772	0 %	40 %	20 %	40 %	479211158
129	NC_021043	AATAT	2	10	244274	244283	60 %	40 %	0 %	0 %	479211159
130	NC_021043	GTGCA	2	10	252453	252462	20 %	20 %	40 %	20 %	479211167
131	NC_021043	CCGAT	2	10	252661	252670	20 %	20 %	20 %	40 %	479211167
132	NC_021043	CTTAT	2	10	254567	254576	20 %	60 %	0 %	20 %	479211170
133	NC_021043	AGAAC	2	10	256592	256601	60 %	0 %	20 %	20 %	479211171
134	NC_021043	GCACA	2	10	259613	259622	40 %	0 %	20 %	40 %	479211172
135	NC_021043	TGTCG	2	10	259813	259822	0 %	40 %	40 %	20 %	479211172
136	NC_021043	GAATT	2	10	261454	261463	40 %	40 %	20 %	0 %	479211174
137	NC_021043	GGCAA	2	10	262186	262195	40 %	0 %	40 %	20 %	479211175
138	NC_021043	AAGGA	2	10	262754	262763	60 %	0 %	40 %	0 %	479211175
139	NC_021043	TTATC	2	10	265508	265517	20 %	60 %	0 %	20 %	479211178
140	NC_021043	CGTTG	2	10	266679	266688	0 %	40 %	40 %	20 %	479211178
141	NC_021043	TCTGC	2	10	267728	267737	0 %	40 %	20 %	40 %	479211178
142	NC_021043	TCTTA	2	10	268324	268333	20 %	60 %	0 %	20 %	479211179
143	NC_021043	CGAGC	2	10	275911	275920	20 %	0 %	40 %	40 %	479211184
144	NC_021043	AAGAA	2	10	276187	276196	80 %	0 %	20 %	0 %	479211184
145	NC_021043	ACGGC	2	10	280623	280632	20 %	0 %	40 %	40 %	479211187
146	NC_021043	CACGC	2	10	282529	282538	20 %	0 %	20 %	60 %	479211189
147	NC_021043	CGCAC	2	10	283159	283168	20 %	0 %	20 %	60 %	479211189
148	NC_021043	CTTTT	2	10	286916	286925	0 %	80 %	0 %	20 %	479211194
149	NC_021043	CTTTT	2	10	287036	287045	0 %	80 %	0 %	20 %	479211195
150	NC_021043	TACGG	2	10	293441	293450	20 %	20 %	40 %	20 %	479211198
151	NC_021043	TCTTT	2	10	295679	295688	0 %	80 %	0 %	20 %	479211199
152	NC_021043	TCTGC	2	10	302617	302626	0 %	40 %	20 %	40 %	479211203
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155	NC_021043	ATCCT	2	10	309379	309388	20 %	40 %	0 %	40 %	479211207
156	NC_021043	CTGCT	2	10	311585	311594	0 %	40 %	20 %	40 %	479211208
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160	NC_021043	GATAA	2	10	323089	323098	60 %	20 %	20 %	0 %	479211214
161	NC_021043	TGTTT	2	10	325105	325114	0 %	80 %	20 %	0 %	479211215
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165	NC_021043	TCCGC	2	10	330820	330829	0 %	20 %	20 %	60 %	479211219
166	NC_021043	TTGCC	2	10	331865	331874	0 %	40 %	20 %	40 %	479211219
167	NC_021043	TTCGT	2	10	332374	332383	0 %	60 %	20 %	20 %	479211219
168	NC_021043	GCATT	2	10	333419	333428	20 %	40 %	20 %	20 %	479211219
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247	NC_021043	GAAGA	2	10	539159	539168	60 %	0 %	40 %	0 %	479211378
248	NC_021043	CGCTG	2	10	539250	539259	0 %	20 %	40 %	40 %	479211379
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250	NC_021043	TCCGG	2	10	552397	552406	0 %	20 %	40 %	40 %	479211387
251	NC_021043	AAGTG	2	10	554411	554420	40 %	20 %	40 %	0 %	479211388
252	NC_021043	TAATC	2	10	555643	555652	40 %	40 %	0 %	20 %	479211388
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256	NC_021043	GCGTA	2	10	561803	561812	20 %	20 %	40 %	20 %	479211390
257	NC_021043	CTGTA	2	10	562752	562761	20 %	40 %	20 %	20 %	479211391
258	NC_021043	TTTCA	2	10	563290	563299	20 %	60 %	0 %	20 %	479211391
259	NC_021043	GGCGG	2	10	568109	568118	0 %	0 %	80 %	20 %	479211396
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382	NC_021043	GACAG	2	10	835388	835397	40 %	0 %	40 %	20 %	479211594
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385	NC_021043	CAGGA	2	10	839949	839958	40 %	0 %	40 %	20 %	479211595
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387	NC_021043	CCCGA	2	10	847772	847781	20 %	0 %	20 %	60 %	479211601
388	NC_021043	GATAC	2	10	851642	851651	40 %	20 %	20 %	20 %	479211605
389	NC_021043	AAAAG	2	10	852864	852873	80 %	0 %	20 %	0 %	479211606
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