MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL05

Total Repeats: 635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018745	ATC	2	6	27775	27780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671654
502	NC_018745	T	6	6	27790	27795	0 %	100 %	0 %	0 %	408671654
503	NC_018745	TCA	2	6	27824	27829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671654
504	NC_018745	ATAA	2	8	27837	27844	75 %	25 %	0 %	0 %	408671654
505	NC_018745	A	7	7	27866	27872	100 %	0 %	0 %	0 %	408671654
506	NC_018745	A	7	7	27901	27907	100 %	0 %	0 %	0 %	408671654
507	NC_018745	TTA	2	6	27932	27937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671654
508	NC_018745	GCT	2	6	28007	28012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671654
509	NC_018745	GATA	2	8	28036	28043	50 %	25 %	25 %	0 %	408671654
510	NC_018745	TTA	2	6	28062	28067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671654
511	NC_018745	ATT	2	6	28190	28195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671654
512	NC_018745	TTG	2	6	28201	28206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671654
513	NC_018745	TTTAA	2	10	28262	28271	40 %	60 %	0 %	0 %	408671654
514	NC_018745	AAG	2	6	28280	28285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671654
515	NC_018745	ATT	2	6	28312	28317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671654
516	NC_018745	ATGT	2	8	28340	28347	25 %	50 %	25 %	0 %	408671654
517	NC_018745	CTA	2	6	28362	28367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671654
518	NC_018745	T	7	7	28414	28420	0 %	100 %	0 %	0 %	408671654
519	NC_018745	GTTT	2	8	28490	28497	0 %	75 %	25 %	0 %	408671654
520	NC_018745	TAAA	2	8	28503	28510	75 %	25 %	0 %	0 %	408671654
521	NC_018745	ATT	2	6	28517	28522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671654
522	NC_018745	T	7	7	28543	28549	0 %	100 %	0 %	0 %	408671654
523	NC_018745	ATG	2	6	28550	28555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671654
524	NC_018745	TTC	2	6	28624	28629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671654
525	NC_018745	ATG	2	6	28669	28674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671654
526	NC_018745	A	6	6	28694	28699	100 %	0 %	0 %	0 %	408671654
527	NC_018745	A	8	8	28712	28719	100 %	0 %	0 %	0 %	408671654
528	NC_018745	TTA	2	6	28957	28962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671655
529	NC_018745	AGT	2	6	29055	29060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671655
530	NC_018745	ATA	2	6	29077	29082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671655
531	NC_018745	AAAT	2	8	29083	29090	75 %	25 %	0 %	0 %	408671655
532	NC_018745	T	6	6	29097	29102	0 %	100 %	0 %	0 %	408671655
533	NC_018745	CTC	2	6	29137	29142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671655
534	NC_018745	AAT	2	6	29168	29173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671655
535	NC_018745	AATCAT	2	12	29176	29187	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408671655
536	NC_018745	CAA	2	6	29264	29269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671655
537	NC_018745	ATA	2	6	29280	29285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671655
538	NC_018745	TTA	2	6	29420	29425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671656
539	NC_018745	ATAA	2	8	29462	29469	75 %	25 %	0 %	0 %	408671656
540	NC_018745	GAT	2	6	29496	29501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671656
541	NC_018745	TTG	2	6	29512	29517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671656
542	NC_018745	T	6	6	29537	29542	0 %	100 %	0 %	0 %	408671656
543	NC_018745	A	6	6	29548	29553	100 %	0 %	0 %	0 %	408671656
544	NC_018745	TA	3	6	29584	29589	50 %	50 %	0 %	0 %	408671656
545	NC_018745	TTG	2	6	29596	29601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671656
546	NC_018745	ACA	2	6	29648	29653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671656
547	NC_018745	TAA	2	6	29679	29684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671656
548	NC_018745	TTC	2	6	29689	29694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671656
549	NC_018745	TGA	2	6	29722	29727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671656
550	NC_018745	A	6	6	29766	29771	100 %	0 %	0 %	0 %	408671656
551	NC_018745	ATT	2	6	29863	29868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671656
552	NC_018745	ATTA	2	8	29878	29885	50 %	50 %	0 %	0 %	408671656
553	NC_018745	TAC	2	6	29904	29909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671656
554	NC_018745	ATTGA	2	10	29954	29963	40 %	40 %	20 %	0 %	408671656
555	NC_018745	GCT	2	6	29969	29974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671656
556	NC_018745	TAA	2	6	30541	30546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671657
557	NC_018745	CATT	2	8	30553	30560	25 %	50 %	0 %	25 %	408671657
558	NC_018745	CTT	2	6	30628	30633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671657
559	NC_018745	TTC	2	6	30642	30647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671657
560	NC_018745	TGG	2	6	30671	30676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671657
561	NC_018745	AGT	2	6	30698	30703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671657
562	NC_018745	T	6	6	30793	30798	0 %	100 %	0 %	0 %	408671657
563	NC_018745	TAC	2	6	30859	30864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671657
564	NC_018745	GA	3	6	30869	30874	50 %	0 %	50 %	0 %	408671657
565	NC_018745	TAC	2	6	30898	30903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671657
566	NC_018745	C	6	6	30920	30925	0 %	0 %	0 %	100 %	408671657
567	NC_018745	GAA	2	6	30927	30932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671657
568	NC_018745	T	6	6	30943	30948	0 %	100 %	0 %	0 %	408671657
569	NC_018745	ATC	2	6	31028	31033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671657
570	NC_018745	ATG	2	6	31063	31068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671657
571	NC_018745	TGA	3	9	31070	31078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671657
572	NC_018745	ATT	2	6	31086	31091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671657
573	NC_018745	GAA	2	6	31092	31097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671657
574	NC_018745	CGG	2	6	31129	31134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408671657
575	NC_018745	TAA	2	6	31188	31193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671657
576	NC_018745	A	6	6	31236	31241	100 %	0 %	0 %	0 %	408671657
577	NC_018745	AAT	2	6	31281	31286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671657
578	NC_018745	GCT	2	6	31293	31298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671657
579	NC_018745	ATACCT	2	12	31389	31400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671657
580	NC_018745	AAG	2	6	31411	31416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671657
581	NC_018745	TAAA	2	8	31454	31461	75 %	25 %	0 %	0 %	408671657
582	NC_018745	TAA	2	6	31471	31476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671657
583	NC_018745	ACT	2	6	31478	31483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671657
584	NC_018745	T	6	6	31530	31535	0 %	100 %	0 %	0 %	408671657
585	NC_018745	T	7	7	31633	31639	0 %	100 %	0 %	0 %	408671657
586	NC_018745	ATA	2	6	31646	31651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671657
587	NC_018745	TAT	2	6	31661	31666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671657
588	NC_018745	C	6	6	31669	31674	0 %	0 %	0 %	100 %	408671657
589	NC_018745	CATTT	2	10	31826	31835	20 %	60 %	0 %	20 %	408671657
590	NC_018745	AAT	2	6	31876	31881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671657
591	NC_018745	GCA	2	6	31986	31991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671657
592	NC_018745	TAT	2	6	32005	32010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671657
593	NC_018745	TTAT	2	8	32055	32062	25 %	75 %	0 %	0 %	408671657
594	NC_018745	A	7	7	32198	32204	100 %	0 %	0 %	0 %	408671657
595	NC_018745	TTC	2	6	32237	32242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671657
596	NC_018745	TA	3	6	32257	32262	50 %	50 %	0 %	0 %	408671657
597	NC_018745	TTA	2	6	32265	32270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671657
598	NC_018745	CAA	2	6	32350	32355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671657
599	NC_018745	AAT	2	6	32370	32375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671657
600	NC_018745	GCC	2	6	32420	32425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671657
601	NC_018745	T	7	7	32467	32473	0 %	100 %	0 %	0 %	408671657
602	NC_018745	GCT	2	6	32517	32522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671657
603	NC_018745	T	6	6	32538	32543	0 %	100 %	0 %	0 %	408671657
604	NC_018745	AAC	2	6	32570	32575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671657
605	NC_018745	TTG	2	6	32681	32686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671657
606	NC_018745	GTA	2	6	32719	32724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671657
607	NC_018745	A	6	6	32763	32768	100 %	0 %	0 %	0 %	408671657
608	NC_018745	GGTG	2	8	32852	32859	0 %	25 %	75 %	0 %	408671657
609	NC_018745	T	6	6	32904	32909	0 %	100 %	0 %	0 %	408671657
610	NC_018745	GCA	2	6	32930	32935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671657
611	NC_018745	CTT	2	6	33020	33025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671658
612	NC_018745	T	7	7	33024	33030	0 %	100 %	0 %	0 %	408671658
613	NC_018745	TCG	2	6	33044	33049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671658
614	NC_018745	GTTT	2	8	33055	33062	0 %	75 %	25 %	0 %	408671658
615	NC_018745	TTC	2	6	33074	33079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671658
616	NC_018745	T	6	6	33115	33120	0 %	100 %	0 %	0 %	408671658
617	NC_018745	TTTC	2	8	33169	33176	0 %	75 %	0 %	25 %	408671658
618	NC_018745	AT	3	6	33213	33218	50 %	50 %	0 %	0 %	408671658
619	NC_018745	TGT	2	6	33359	33364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671658
620	NC_018745	AAT	2	6	33377	33382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671658
621	NC_018745	ACC	2	6	33386	33391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671658
622	NC_018745	TTA	2	6	33393	33398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671658
623	NC_018745	TCC	2	6	33467	33472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671658
624	NC_018745	T	6	6	33531	33536	0 %	100 %	0 %	0 %	408671658
625	NC_018745	ATT	2	6	33557	33562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671658
626	NC_018745	TTGATG	2	12	33616	33627	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408671658
627	NC_018745	TCA	2	6	33660	33665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671658
628	NC_018745	TGC	2	6	33668	33673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671658
629	NC_018745	AGA	2	6	33695	33700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671658
630	NC_018745	CT	3	6	33701	33706	0 %	50 %	0 %	50 %	408671658
631	NC_018745	CAT	2	6	33721	33726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671658
632	NC_018745	T	6	6	33790	33795	0 %	100 %	0 %	0 %	408671658
633	NC_018745	TAT	2	6	33916	33921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671658
634	NC_018745	AT	3	6	33920	33925	50 %	50 %	0 %	0 %	408671658
635	NC_018745	AAAT	2	8	33946	33953	75 %	25 %	0 %	0 %	408671658

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