MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	T	6	6	5808	5813	0 %	100 %	0 %	0 %	407484809
2	NC_018666	A	6	6	8984	8989	100 %	0 %	0 %	0 %	407484812
3	NC_018666	T	6	6	10682	10687	0 %	100 %	0 %	0 %	407484814
4	NC_018666	T	6	6	11856	11861	0 %	100 %	0 %	0 %	407484817
5	NC_018666	A	7	7	11952	11958	100 %	0 %	0 %	0 %	407484818
6	NC_018666	T	8	8	12059	12066	0 %	100 %	0 %	0 %	407484818
7	NC_018666	T	7	7	12330	12336	0 %	100 %	0 %	0 %	407484818
8	NC_018666	A	6	6	12848	12853	100 %	0 %	0 %	0 %	407484818
9	NC_018666	A	6	6	13561	13566	100 %	0 %	0 %	0 %	407484819
10	NC_018666	A	6	6	13689	13694	100 %	0 %	0 %	0 %	407484819
11	NC_018666	A	6	6	13841	13846	100 %	0 %	0 %	0 %	407484819
12	NC_018666	T	7	7	14349	14355	0 %	100 %	0 %	0 %	407484821
13	NC_018666	T	6	6	18132	18137	0 %	100 %	0 %	0 %	407484827
14	NC_018666	C	7	7	18449	18455	0 %	0 %	0 %	100 %	407484827
15	NC_018666	T	6	6	18508	18513	0 %	100 %	0 %	0 %	407484827
16	NC_018666	C	12	12	18782	18793	0 %	0 %	0 %	100 %	407484828
17	NC_018666	T	6	6	19120	19125	0 %	100 %	0 %	0 %	407484829
18	NC_018666	C	8	8	19883	19890	0 %	0 %	0 %	100 %	407484829
19	NC_018666	C	6	6	21076	21081	0 %	0 %	0 %	100 %	407484829
20	NC_018666	T	7	7	21268	21274	0 %	100 %	0 %	0 %	407484829
21	NC_018666	T	9	9	21379	21387	0 %	100 %	0 %	0 %	407484829
22	NC_018666	C	10	10	21690	21699	0 %	0 %	0 %	100 %	407484830
23	NC_018666	T	7	7	21958	21964	0 %	100 %	0 %	0 %	407484830
24	NC_018666	T	7	7	22145	22151	0 %	100 %	0 %	0 %	407484830
25	NC_018666	T	6	6	23257	23262	0 %	100 %	0 %	0 %	407484832
26	NC_018666	T	6	6	23306	23311	0 %	100 %	0 %	0 %	407484832
27	NC_018666	T	6	6	23734	23739	0 %	100 %	0 %	0 %	407484832
28	NC_018666	T	6	6	24652	24657	0 %	100 %	0 %	0 %	407484834
29	NC_018666	T	8	8	26593	26600	0 %	100 %	0 %	0 %	407484836
30	NC_018666	C	6	6	29128	29133	0 %	0 %	0 %	100 %	407484839
31	NC_018666	A	8	8	32624	32631	100 %	0 %	0 %	0 %	407484845
32	NC_018666	T	6	6	40041	40046	0 %	100 %	0 %	0 %	407484856
33	NC_018666	A	7	7	40616	40622	100 %	0 %	0 %	0 %	407484857
34	NC_018666	A	6	6	40790	40795	100 %	0 %	0 %	0 %	407484857
35	NC_018666	T	8	8	44204	44211	0 %	100 %	0 %	0 %	407484863
36	NC_018666	T	6	6	44414	44419	0 %	100 %	0 %	0 %	407484863
37	NC_018666	T	7	7	44600	44606	0 %	100 %	0 %	0 %	407484863
38	NC_018666	A	6	6	44877	44882	100 %	0 %	0 %	0 %	407484864
39	NC_018666	C	6	6	45983	45988	0 %	0 %	0 %	100 %	407484866
40	NC_018666	T	6	6	48038	48043	0 %	100 %	0 %	0 %	407484866
41	NC_018666	T	6	6	48734	48739	0 %	100 %	0 %	0 %	407484866
42	NC_018666	C	6	6	49174	49179	0 %	0 %	0 %	100 %	407484866
43	NC_018666	C	7	7	49540	49546	0 %	0 %	0 %	100 %	407484867
44	NC_018666	A	6	6	52471	52476	100 %	0 %	0 %	0 %	407484870
45	NC_018666	A	6	6	52780	52785	100 %	0 %	0 %	0 %	407484870
46	NC_018666	G	9	9	56275	56283	0 %	0 %	100 %	0 %	407484873
47	NC_018666	C	6	6	56474	56479	0 %	0 %	0 %	100 %	407484873
48	NC_018666	A	8	8	56501	56508	100 %	0 %	0 %	0 %	407484873
49	NC_018666	A	6	6	56745	56750	100 %	0 %	0 %	0 %	407484873
50	NC_018666	G	6	6	56871	56876	0 %	0 %	100 %	0 %	407484873
51	NC_018666	A	6	6	57250	57255	100 %	0 %	0 %	0 %	407484873
52	NC_018666	G	6	6	57331	57336	0 %	0 %	100 %	0 %	407484873
53	NC_018666	A	6	6	57497	57502	100 %	0 %	0 %	0 %	407484873
54	NC_018666	A	6	6	58805	58810	100 %	0 %	0 %	0 %	407484873
55	NC_018666	A	6	6	61137	61142	100 %	0 %	0 %	0 %	407484876
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57	NC_018666	A	6	6	62450	62455	100 %	0 %	0 %	0 %	407484877
58	NC_018666	A	6	6	64969	64974	100 %	0 %	0 %	0 %	407484879
59	NC_018666	A	7	7	65343	65349	100 %	0 %	0 %	0 %	407484879
60	NC_018666	T	6	6	65363	65368	0 %	100 %	0 %	0 %	407484879
61	NC_018666	A	7	7	65536	65542	100 %	0 %	0 %	0 %	407484879
62	NC_018666	T	6	6	65628	65633	0 %	100 %	0 %	0 %	407484879
63	NC_018666	A	6	6	65739	65744	100 %	0 %	0 %	0 %	407484879
64	NC_018666	A	6	6	66031	66036	100 %	0 %	0 %	0 %	407484879
65	NC_018666	A	8	8	66087	66094	100 %	0 %	0 %	0 %	407484879
66	NC_018666	A	7	7	66132	66138	100 %	0 %	0 %	0 %	407484879
67	NC_018666	T	6	6	66298	66303	0 %	100 %	0 %	0 %	407484880
68	NC_018666	T	7	7	66355	66361	0 %	100 %	0 %	0 %	407484880
69	NC_018666	T	6	6	66619	66624	0 %	100 %	0 %	0 %	407484880
70	NC_018666	T	6	6	66784	66789	0 %	100 %	0 %	0 %	407484880
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74	NC_018666	T	6	6	68216	68221	0 %	100 %	0 %	0 %	407484882
75	NC_018666	T	7	7	68346	68352	0 %	100 %	0 %	0 %	407484882
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77	NC_018666	A	7	7	69801	69807	100 %	0 %	0 %	0 %	407484883

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.