MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	ACACG	2	10	3498	3507	40 %	0 %	20 %	40 %	407484808
2	NC_018666	TTGTT	2	10	4557	4566	0 %	80 %	20 %	0 %	407484808
3	NC_018666	AAAAC	2	10	6873	6882	80 %	0 %	0 %	20 %	407484810
4	NC_018666	TTTTG	2	10	18208	18217	0 %	80 %	20 %	0 %	407484827
5	NC_018666	CTTTA	2	10	20049	20058	20 %	60 %	0 %	20 %	407484829
6	NC_018666	AAACT	2	10	22633	22642	60 %	20 %	0 %	20 %	407484831
7	NC_018666	GTACG	2	10	24974	24983	20 %	20 %	40 %	20 %	407484834
8	NC_018666	TGAAC	2	10	25437	25446	40 %	20 %	20 %	20 %	407484834
9	NC_018666	GGTCT	2	10	25613	25622	0 %	40 %	40 %	20 %	407484835
10	NC_018666	CTCTG	2	10	25644	25653	0 %	40 %	20 %	40 %	407484835
11	NC_018666	TATCT	2	10	25922	25931	20 %	60 %	0 %	20 %	407484835
12	NC_018666	TCCCA	2	10	27874	27883	20 %	20 %	0 %	60 %	407484838
13	NC_018666	TGTCG	2	10	30874	30883	0 %	40 %	40 %	20 %	407484843
14	NC_018666	GAACG	2	10	41322	41331	40 %	0 %	40 %	20 %	407484858
15	NC_018666	GATGT	2	10	41794	41803	20 %	40 %	40 %	0 %	407484859
16	NC_018666	CCGGA	2	10	42270	42279	20 %	0 %	40 %	40 %	407484859
17	NC_018666	GACCA	2	10	45486	45495	40 %	0 %	20 %	40 %	407484864
18	NC_018666	CGTGT	2	10	45543	45552	0 %	40 %	40 %	20 %	407484864
19	NC_018666	CAGGT	2	10	45825	45834	20 %	20 %	40 %	20 %	407484866
20	NC_018666	CCGGT	2	10	46434	46443	0 %	20 %	40 %	40 %	407484866
21	NC_018666	CGCTG	2	10	47693	47702	0 %	20 %	40 %	40 %	407484866
22	NC_018666	TATTT	2	10	51988	51997	20 %	80 %	0 %	0 %	407484869
23	NC_018666	GTCAG	2	10	63599	63608	20 %	20 %	40 %	20 %	407484878
24	NC_018666	TATGT	2	10	66177	66186	20 %	60 %	20 %	0 %	407484880
25	NC_018666	TCTTT	2	10	67847	67856	0 %	80 %	0 %	20 %	407484882
26	NC_018666	ATAAA	2	10	69076	69085	80 %	20 %	0 %	0 %	407484883

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.