MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	CAG	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484806
2	NC_018666	TGA	2	6	891	896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
3	NC_018666	TGC	2	6	977	982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
4	NC_018666	CTC	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484806
5	NC_018666	CTC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484806
6	NC_018666	GGT	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484806
7	NC_018666	TGC	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
8	NC_018666	ATG	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
9	NC_018666	CCA	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484806
10	NC_018666	TCA	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484806
11	NC_018666	TGC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
12	NC_018666	ATG	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
13	NC_018666	GTG	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484806
14	NC_018666	TGC	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
15	NC_018666	GCA	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484806
16	NC_018666	ATG	2	6	1736	1741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
17	NC_018666	ATG	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484807
18	NC_018666	ATT	3	9	1819	1827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484807
19	NC_018666	GCC	2	6	3303	3308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
20	NC_018666	CTT	2	6	3319	3324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484808
21	NC_018666	CCA	2	6	3333	3338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
22	NC_018666	CGC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
23	NC_018666	ACC	3	9	3429	3437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
24	NC_018666	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
25	NC_018666	GTT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484808
26	NC_018666	GCG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
27	NC_018666	CTC	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484808
28	NC_018666	ATC	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
29	NC_018666	CCG	2	6	3936	3941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
30	NC_018666	ACC	2	6	3975	3980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
31	NC_018666	ATG	2	6	4043	4048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
32	NC_018666	ATA	2	6	4053	4058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484808
33	NC_018666	GCG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
34	NC_018666	GCC	2	6	4097	4102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
35	NC_018666	CAG	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484808
36	NC_018666	GCG	2	6	4180	4185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
37	NC_018666	TCA	2	6	4194	4199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
38	NC_018666	GAT	2	6	4206	4211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
39	NC_018666	GTG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484808
40	NC_018666	TGA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
41	NC_018666	CGC	2	6	4618	4623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
42	NC_018666	GCA	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484808
43	NC_018666	CAT	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484809
44	NC_018666	CTC	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484809
45	NC_018666	GCG	2	6	5877	5882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484809
46	NC_018666	GGT	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484809
47	NC_018666	AGA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484810
48	NC_018666	AGC	2	6	7093	7098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484810
49	NC_018666	TGA	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484810
50	NC_018666	AAT	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484810
51	NC_018666	ATG	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484810
52	NC_018666	ACA	2	6	7301	7306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484810
53	NC_018666	CTT	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484810
54	NC_018666	TAT	2	6	7407	7412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484810
55	NC_018666	AGC	2	6	7512	7517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484810
56	NC_018666	CAT	2	6	7583	7588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484810
57	NC_018666	ATG	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484811
58	NC_018666	GTT	2	6	8002	8007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484811
59	NC_018666	GAA	2	6	8014	8019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484811
60	NC_018666	TGC	2	6	8050	8055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484811
61	NC_018666	GTT	2	6	8066	8071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484811
62	NC_018666	CCA	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484811
63	NC_018666	CTG	2	6	8428	8433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484812
64	NC_018666	TGT	2	6	8434	8439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484812
65	NC_018666	TTG	2	6	8465	8470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484812
66	NC_018666	TAC	2	6	8485	8490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484812
67	NC_018666	CAA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484812
68	NC_018666	ACC	2	6	8644	8649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484812
69	NC_018666	AGC	2	6	8683	8688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484812
70	NC_018666	TCA	2	6	8795	8800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484812
71	NC_018666	CTG	2	6	9064	9069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484812
72	NC_018666	TTG	2	6	9152	9157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484812
73	NC_018666	CAG	2	6	9686	9691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484813
74	NC_018666	TGA	2	6	9730	9735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484813
75	NC_018666	TGC	2	6	9816	9821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484813
76	NC_018666	CTC	2	6	9884	9889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484813
77	NC_018666	CTC	2	6	9935	9940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484813
78	NC_018666	GGT	2	6	9989	9994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484813
79	NC_018666	TGC	2	6	10101	10106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484813
80	NC_018666	ATG	2	6	10137	10142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484813
81	NC_018666	CCA	2	6	10150	10155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484813
82	NC_018666	TCA	2	6	10168	10173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484813
83	NC_018666	TGC	2	6	10233	10238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484813
84	NC_018666	ATG	2	6	10260	10265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484813
85	NC_018666	GTG	2	6	10266	10271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484813
86	NC_018666	TGC	2	6	10374	10379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484813
87	NC_018666	GCA	2	6	10393	10398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484813
88	NC_018666	ATG	2	6	10575	10580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484813
89	NC_018666	ATG	2	6	10608	10613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484814
90	NC_018666	TAA	2	6	10670	10675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484814
91	NC_018666	AGG	2	6	10724	10729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484814
92	NC_018666	ATA	2	6	10776	10781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484815
93	NC_018666	TAA	2	6	10815	10820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484815
94	NC_018666	AGG	2	6	10842	10847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484815
95	NC_018666	TCA	3	9	11563	11571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484816
96	NC_018666	CCG	2	6	11617	11622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484816
97	NC_018666	TAG	2	6	11635	11640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484816
98	NC_018666	TCT	2	6	11691	11696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484817
99	NC_018666	AAT	2	6	11800	11805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484817
100	NC_018666	TGT	2	6	11941	11946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484818
101	NC_018666	GAT	2	6	12050	12055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484818
102	NC_018666	CAG	2	6	12068	12073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484818
103	NC_018666	TTA	2	6	12094	12099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484818
104	NC_018666	TCA	2	6	12169	12174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484818
105	NC_018666	TGC	2	6	12226	12231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484818
106	NC_018666	CAT	2	6	12260	12265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484818
107	NC_018666	ATA	2	6	12283	12288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484818
108	NC_018666	TCA	2	6	12296	12301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484818
109	NC_018666	TAT	2	6	12302	12307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484818
110	NC_018666	ATA	2	6	12337	12342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484818
111	NC_018666	GAA	2	6	12344	12349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484818
112	NC_018666	ACG	2	6	12477	12482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484818
113	NC_018666	ACT	2	6	12501	12506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484818
114	NC_018666	ATT	2	6	12534	12539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484818
115	NC_018666	TAT	2	6	12552	12557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484818
116	NC_018666	ATA	2	6	12564	12569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484818
117	NC_018666	ATA	2	6	12679	12684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484818
118	NC_018666	AAT	2	6	12787	12792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484818
119	NC_018666	ACG	2	6	12918	12923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484818
120	NC_018666	ACT	2	6	12952	12957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484818
121	NC_018666	CTG	2	6	13753	13758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484819
122	NC_018666	GAA	2	6	13803	13808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484819
123	NC_018666	AAG	2	6	14177	14182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484820
124	NC_018666	TAA	2	6	14218	14223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484820
125	NC_018666	AGC	2	6	14357	14362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484821
126	NC_018666	TGA	2	6	14367	14372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484821
127	NC_018666	GAC	2	6	14419	14424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484821
128	NC_018666	TTA	2	6	14484	14489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484821
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253	NC_018666	ACC	2	6	26448	26453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484836
254	NC_018666	TCA	2	6	26476	26481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484836
255	NC_018666	GAA	2	6	26528	26533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484836
256	NC_018666	TTG	2	6	26632	26637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484836
257	NC_018666	CTG	2	6	26703	26708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484836
258	NC_018666	GCA	2	6	26836	26841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484836
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260	NC_018666	CAT	2	6	26945	26950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484836
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282	NC_018666	CTT	2	6	29473	29478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484840
283	NC_018666	GGT	2	6	29513	29518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484840
284	NC_018666	CAT	2	6	29519	29524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484840
285	NC_018666	CAC	2	6	29549	29554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484840
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499	NC_018666	CGG	2	6	56244	56249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484873
500	NC_018666	TTG	2	6	56345	56350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484873

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