MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	TC	3	6	766	771	0 %	50 %	0 %	50 %	407484806
2	NC_018666	CAG	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484806
3	NC_018666	TGA	2	6	891	896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
4	NC_018666	TGC	2	6	977	982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
5	NC_018666	CTC	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484806
6	NC_018666	CTC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484806
7	NC_018666	GGT	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484806
8	NC_018666	TGC	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
9	NC_018666	ATG	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
10	NC_018666	CCA	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484806
11	NC_018666	TCA	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484806
12	NC_018666	GCCA	2	8	1349	1356	25 %	0 %	25 %	50 %	407484806
13	NC_018666	TGC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
14	NC_018666	ATG	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
15	NC_018666	GTG	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484806
16	NC_018666	TGC	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
17	NC_018666	GCA	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484806
18	NC_018666	ATG	2	6	1736	1741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
19	NC_018666	ATG	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484807
20	NC_018666	CCTT	2	8	1800	1807	0 %	50 %	0 %	50 %	407484807
21	NC_018666	ATT	3	9	1819	1827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484807
22	NC_018666	GCC	2	6	3303	3308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
23	NC_018666	CTT	2	6	3319	3324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484808
24	NC_018666	CCA	2	6	3333	3338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
25	NC_018666	CGC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
26	NC_018666	ACC	3	9	3429	3437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
27	NC_018666	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
28	NC_018666	GCCA	2	8	3473	3480	25 %	0 %	25 %	50 %	407484808
29	NC_018666	ACACG	2	10	3498	3507	40 %	0 %	20 %	40 %	407484808
30	NC_018666	GTT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484808
31	NC_018666	GCG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
32	NC_018666	CTC	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484808
33	NC_018666	ATC	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
34	NC_018666	CCG	2	6	3936	3941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
35	NC_018666	ACC	2	6	3975	3980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
36	NC_018666	ATG	2	6	4043	4048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
37	NC_018666	ATA	2	6	4053	4058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484808
38	NC_018666	GCG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
39	NC_018666	GCC	2	6	4097	4102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
40	NC_018666	CAG	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484808
41	NC_018666	GCG	2	6	4180	4185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
42	NC_018666	TCA	2	6	4194	4199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
43	NC_018666	GAT	2	6	4206	4211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
44	NC_018666	GTG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484808
45	NC_018666	TTGTT	2	10	4557	4566	0 %	80 %	20 %	0 %	407484808
46	NC_018666	TGA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
47	NC_018666	CGC	2	6	4618	4623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
48	NC_018666	CAGC	2	8	4626	4633	25 %	0 %	25 %	50 %	407484808
49	NC_018666	GCA	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484808
50	NC_018666	CAT	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484809
51	NC_018666	T	6	6	5808	5813	0 %	100 %	0 %	0 %	407484809
52	NC_018666	CTC	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484809
53	NC_018666	GCG	2	6	5877	5882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484809
54	NC_018666	GGT	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484809
55	NC_018666	AAAAC	2	10	6873	6882	80 %	0 %	0 %	20 %	407484810
56	NC_018666	TA	3	6	6938	6943	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
57	NC_018666	GAAG	2	8	6976	6983	50 %	0 %	50 %	0 %	407484810
58	NC_018666	GA	3	6	7018	7023	50 %	0 %	50 %	0 %	407484810
59	NC_018666	AATA	2	8	7026	7033	75 %	25 %	0 %	0 %	407484810
60	NC_018666	AGA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484810
61	NC_018666	AGC	2	6	7093	7098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484810
62	NC_018666	TGA	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484810
63	NC_018666	AAT	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484810
64	NC_018666	ATG	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484810
65	NC_018666	AT	3	6	7276	7281	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
66	NC_018666	ACA	2	6	7301	7306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484810
67	NC_018666	TA	3	6	7327	7332	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
68	NC_018666	CTT	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484810
69	NC_018666	TAT	2	6	7407	7412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484810
70	NC_018666	AGC	2	6	7512	7517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484810
71	NC_018666	CAT	2	6	7583	7588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484810
72	NC_018666	GTCA	2	8	7794	7801	25 %	25 %	25 %	25 %	407484811
73	NC_018666	GT	3	6	7869	7874	0 %	50 %	50 %	0 %	407484811
74	NC_018666	ACTTAT	2	12	7883	7894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407484811
75	NC_018666	ATG	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484811
76	NC_018666	GTT	2	6	8002	8007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484811
77	NC_018666	GAA	2	6	8014	8019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484811
78	NC_018666	GGAA	2	8	8029	8036	50 %	0 %	50 %	0 %	407484811
79	NC_018666	TGC	2	6	8050	8055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484811
80	NC_018666	GTT	2	6	8066	8071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484811
81	NC_018666	CCA	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484811
82	NC_018666	CTG	2	6	8428	8433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484812
83	NC_018666	TGT	2	6	8434	8439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484812
84	NC_018666	TTG	2	6	8465	8470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484812
85	NC_018666	TAC	2	6	8485	8490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484812
86	NC_018666	CAA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484812
87	NC_018666	CTGA	2	8	8541	8548	25 %	25 %	25 %	25 %	407484812
88	NC_018666	ACC	2	6	8644	8649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484812
89	NC_018666	AGC	2	6	8683	8688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484812
90	NC_018666	TCA	2	6	8795	8800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484812
91	NC_018666	GTTC	2	8	8907	8914	0 %	50 %	25 %	25 %	407484812
92	NC_018666	A	6	6	8984	8989	100 %	0 %	0 %	0 %	407484812
93	NC_018666	GCAT	2	8	8990	8997	25 %	25 %	25 %	25 %	407484812
94	NC_018666	CTG	2	6	9064	9069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484812
95	NC_018666	TTG	2	6	9152	9157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484812
96	NC_018666	CGAA	2	8	9173	9180	50 %	0 %	25 %	25 %	407484812
97	NC_018666	TC	3	6	9605	9610	0 %	50 %	0 %	50 %	407484813
98	NC_018666	CAG	2	6	9686	9691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484813
99	NC_018666	TGA	2	6	9730	9735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484813
100	NC_018666	TGC	2	6	9816	9821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484813
101	NC_018666	CTC	2	6	9884	9889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484813
102	NC_018666	CTC	2	6	9935	9940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484813
103	NC_018666	GGT	2	6	9989	9994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484813
104	NC_018666	TGC	2	6	10101	10106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484813
105	NC_018666	ATG	2	6	10137	10142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484813
106	NC_018666	CCA	2	6	10150	10155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484813
107	NC_018666	TCA	2	6	10168	10173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484813
108	NC_018666	GCCA	2	8	10188	10195	25 %	0 %	25 %	50 %	407484813
109	NC_018666	TGC	2	6	10233	10238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484813
110	NC_018666	ATG	2	6	10260	10265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484813
111	NC_018666	GTG	2	6	10266	10271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484813
112	NC_018666	TGC	2	6	10374	10379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484813
113	NC_018666	GCA	2	6	10393	10398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484813
114	NC_018666	ATG	2	6	10575	10580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484813
115	NC_018666	ATG	2	6	10608	10613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484814
116	NC_018666	CCTT	2	8	10639	10646	0 %	50 %	0 %	50 %	407484814
117	NC_018666	TAA	2	6	10670	10675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484814
118	NC_018666	T	6	6	10682	10687	0 %	100 %	0 %	0 %	407484814
119	NC_018666	AGG	2	6	10724	10729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484814
120	NC_018666	TGAT	2	8	10737	10744	25 %	50 %	25 %	0 %	407484815
121	NC_018666	AATG	2	8	10759	10766	50 %	25 %	25 %	0 %	407484815
122	NC_018666	ATA	2	6	10776	10781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484815
123	NC_018666	TAA	2	6	10815	10820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484815
124	NC_018666	GA	3	6	10833	10838	50 %	0 %	50 %	0 %	407484815
125	NC_018666	AGG	2	6	10842	10847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484815
126	NC_018666	AT	3	6	11440	11445	50 %	50 %	0 %	0 %	407484816
127	NC_018666	TCA	3	9	11563	11571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484816
128	NC_018666	CCG	2	6	11617	11622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484816
129	NC_018666	TAG	2	6	11635	11640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484816
130	NC_018666	TCT	2	6	11691	11696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484817
131	NC_018666	AAT	2	6	11800	11805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484817
132	NC_018666	AT	3	6	11822	11827	50 %	50 %	0 %	0 %	407484817
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260	NC_018666	GCA	2	6	20239	20244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484829
261	NC_018666	TGT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484829
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292	NC_018666	T	7	7	22145	22151	0 %	100 %	0 %	0 %	407484830
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371	NC_018666	T	8	8	26593	26600	0 %	100 %	0 %	0 %	407484836
372	NC_018666	CTTT	2	8	26601	26608	0 %	75 %	0 %	25 %	407484836
373	NC_018666	TTG	2	6	26632	26637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484836
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380	NC_018666	AT	3	6	27432	27437	50 %	50 %	0 %	0 %	407484837
381	NC_018666	GAC	2	6	27547	27552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484837
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385	NC_018666	GAT	2	6	27798	27803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484838
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387	NC_018666	CCT	2	6	27836	27841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484838
388	NC_018666	TCCCA	2	10	27874	27883	20 %	20 %	0 %	60 %	407484838
389	NC_018666	TCA	2	6	27930	27935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484838
390	NC_018666	TCT	2	6	27984	27989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484838
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