MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018666	TGG	2	6	39039	39044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484855
502	NC_018666	CCA	2	6	39048	39053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484855
503	NC_018666	AGC	2	6	39087	39092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484855
504	NC_018666	CAC	2	6	39199	39204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484855
505	NC_018666	GAG	2	6	39254	39259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484855
506	NC_018666	GAG	2	6	39305	39310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484855
507	NC_018666	AGC	2	6	39372	39377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484855
508	NC_018666	CAT	2	6	39457	39462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484855
509	NC_018666	GCT	2	6	39502	39507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484855
510	NC_018666	GA	3	6	39584	39589	50 %	0 %	50 %	0 %	407484855
511	NC_018666	ATT	2	6	40001	40006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484856
512	NC_018666	GCT	2	6	40036	40041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484856
513	NC_018666	T	6	6	40041	40046	0 %	100 %	0 %	0 %	407484856
514	NC_018666	CTG	2	6	40103	40108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484856
515	NC_018666	TCCA	2	8	40161	40168	25 %	25 %	0 %	50 %	407484856
516	NC_018666	AAT	2	6	40322	40327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484857
517	NC_018666	CAT	2	6	40331	40336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484857
518	NC_018666	GAA	2	6	40401	40406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484857
519	NC_018666	GTA	2	6	40462	40467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484857
520	NC_018666	TGCC	2	8	40538	40545	0 %	25 %	25 %	50 %	407484857
521	NC_018666	A	7	7	40616	40622	100 %	0 %	0 %	0 %	407484857
522	NC_018666	CGG	2	6	40629	40634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484857
523	NC_018666	TG	3	6	40695	40700	0 %	50 %	50 %	0 %	407484857
524	NC_018666	CTG	2	6	40776	40781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484857
525	NC_018666	A	6	6	40790	40795	100 %	0 %	0 %	0 %	407484857
526	NC_018666	GCCGGA	2	12	40826	40837	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407484857
527	NC_018666	TAA	2	6	40838	40843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484857
528	NC_018666	TGT	2	6	40899	40904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484857
529	NC_018666	GCCG	2	8	40916	40923	0 %	0 %	50 %	50 %	407484857
530	NC_018666	TTA	2	6	40959	40964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484857
531	NC_018666	AGC	2	6	40992	40997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484857
532	NC_018666	TGA	2	6	41001	41006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484857
533	NC_018666	TC	3	6	41009	41014	0 %	50 %	0 %	50 %	407484858
534	NC_018666	CTGG	2	8	41032	41039	0 %	25 %	50 %	25 %	407484858
535	NC_018666	CTT	2	6	41288	41293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484858
536	NC_018666	GAACG	2	10	41322	41331	40 %	0 %	40 %	20 %	407484858
537	NC_018666	CGCC	2	8	41396	41403	0 %	0 %	25 %	75 %	407484859
538	NC_018666	GGC	2	6	41480	41485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484859
539	NC_018666	GAA	2	6	41625	41630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484859
540	NC_018666	CCGG	2	8	41741	41748	0 %	0 %	50 %	50 %	407484859
541	NC_018666	CCTG	2	8	41763	41770	0 %	25 %	25 %	50 %	407484859
542	NC_018666	TGG	2	6	41771	41776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484859
543	NC_018666	GATGT	2	10	41794	41803	20 %	40 %	40 %	0 %	407484859
544	NC_018666	CAG	2	6	41825	41830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484859
545	NC_018666	TGT	2	6	41957	41962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484859
546	NC_018666	CGT	2	6	42015	42020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484859
547	NC_018666	CTG	2	6	42078	42083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484859
548	NC_018666	TGA	2	6	42140	42145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484859
549	NC_018666	TGA	2	6	42215	42220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484859
550	NC_018666	CGG	2	6	42247	42252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484859
551	NC_018666	CCGGA	2	10	42270	42279	20 %	0 %	40 %	40 %	407484859
552	NC_018666	ATCC	2	8	42285	42292	25 %	25 %	0 %	50 %	407484859
553	NC_018666	GGT	2	6	42342	42347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484859
554	NC_018666	TGCA	2	8	42424	42431	25 %	25 %	25 %	25 %	407484859
555	NC_018666	CAC	2	6	42449	42454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484859
556	NC_018666	CAG	2	6	42514	42519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484859
557	NC_018666	GGC	2	6	42530	42535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484859
558	NC_018666	CTG	2	6	42642	42647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484859
559	NC_018666	ACA	3	9	42700	42708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484859
560	NC_018666	GGT	2	6	42777	42782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484859
561	NC_018666	GCG	2	6	42789	42794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484859
562	NC_018666	TTAT	2	8	42995	43002	25 %	75 %	0 %	0 %	407484860
563	NC_018666	TAC	2	6	43010	43015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484860
564	NC_018666	ACA	2	6	43135	43140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484860
565	NC_018666	CAC	2	6	43144	43149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484860
566	NC_018666	CGC	2	6	43153	43158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484860
567	NC_018666	GAA	2	6	43172	43177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484860
568	NC_018666	TCA	2	6	43251	43256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484861
569	NC_018666	AT	3	6	43290	43295	50 %	50 %	0 %	0 %	407484861
570	NC_018666	CATCAG	2	12	43364	43375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407484861
571	NC_018666	ATC	2	6	43443	43448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484861
572	NC_018666	ATC	2	6	43546	43551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484861
573	NC_018666	AGC	2	6	43587	43592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484862
574	NC_018666	CAT	2	6	43613	43618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484862
575	NC_018666	GGAGCA	2	12	43677	43688	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407484862
576	NC_018666	GTT	2	6	43844	43849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484862
577	NC_018666	CGG	2	6	43944	43949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484862
578	NC_018666	T	8	8	44204	44211	0 %	100 %	0 %	0 %	407484863
579	NC_018666	GGC	2	6	44257	44262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484863
580	NC_018666	TCC	3	9	44295	44303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484863
581	NC_018666	GGCA	2	8	44344	44351	25 %	0 %	50 %	25 %	407484863
582	NC_018666	CA	3	6	44365	44370	50 %	0 %	0 %	50 %	407484863
583	NC_018666	T	6	6	44414	44419	0 %	100 %	0 %	0 %	407484863
584	NC_018666	GT	3	6	44494	44499	0 %	50 %	50 %	0 %	407484863
585	NC_018666	AAT	2	6	44508	44513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484863
586	NC_018666	CCA	2	6	44519	44524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484863
587	NC_018666	T	7	7	44600	44606	0 %	100 %	0 %	0 %	407484863
588	NC_018666	GCC	2	6	44607	44612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484863
589	NC_018666	GCT	2	6	44628	44633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484863
590	NC_018666	TGG	2	6	44669	44674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484863
591	NC_018666	GTG	2	6	44676	44681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484863
592	NC_018666	TGA	2	6	44686	44691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484863
593	NC_018666	A	6	6	44877	44882	100 %	0 %	0 %	0 %	407484864
594	NC_018666	TCA	2	6	44947	44952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484864
595	NC_018666	CCG	2	6	44965	44970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484864
596	NC_018666	TGG	2	6	44980	44985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484864
597	NC_018666	CAGC	2	8	45007	45014	25 %	0 %	25 %	50 %	407484864
598	NC_018666	AGGC	2	8	45015	45022	25 %	0 %	50 %	25 %	407484864
599	NC_018666	CAG	2	6	45086	45091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484864
600	NC_018666	AGA	2	6	45141	45146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484864
601	NC_018666	GCT	2	6	45153	45158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484864
602	NC_018666	CCAC	2	8	45164	45171	25 %	0 %	0 %	75 %	407484864
603	NC_018666	CAC	2	6	45183	45188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484864
604	NC_018666	GCC	2	6	45201	45206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484864
605	NC_018666	ATA	2	6	45257	45262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484864
606	NC_018666	AAT	2	6	45275	45280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484864
607	NC_018666	CTC	2	6	45373	45378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484864
608	NC_018666	TGA	2	6	45463	45468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484864
609	NC_018666	GACCA	2	10	45486	45495	40 %	0 %	20 %	40 %	407484864
610	NC_018666	CGTGT	2	10	45543	45552	0 %	40 %	40 %	20 %	407484864
611	NC_018666	TCA	2	6	45568	45573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484864
612	NC_018666	CTG	2	6	45648	45653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484865
613	NC_018666	GCA	2	6	45665	45670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484865
614	NC_018666	GCA	2	6	45722	45727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484865
615	NC_018666	CAGGT	2	10	45825	45834	20 %	20 %	40 %	20 %	407484866
616	NC_018666	GCG	2	6	45870	45875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484866
617	NC_018666	CGG	2	6	45886	45891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484866
618	NC_018666	GCT	2	6	45966	45971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484866
619	NC_018666	C	6	6	45983	45988	0 %	0 %	0 %	100 %	407484866
620	NC_018666	ACC	2	6	45996	46001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484866
621	NC_018666	GAC	2	6	46025	46030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484866
622	NC_018666	ACC	2	6	46048	46053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484866
623	NC_018666	CAGC	2	8	46106	46113	25 %	0 %	25 %	50 %	407484866
624	NC_018666	CT	3	6	46117	46122	0 %	50 %	0 %	50 %	407484866
625	NC_018666	CGG	2	6	46244	46249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484866
626	NC_018666	TCC	2	6	46335	46340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484866
627	NC_018666	GAA	2	6	46358	46363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484866
628	NC_018666	GCC	2	6	46375	46380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484866
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