MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018662	GC	3	6	1390	1395	0 %	0 %	50 %	50 %	407471878
2	NC_018662	CT	4	8	1907	1914	0 %	50 %	0 %	50 %	407471879
3	NC_018662	AG	3	6	3361	3366	50 %	0 %	50 %	0 %	407471882
4	NC_018662	CA	3	6	3643	3648	50 %	0 %	0 %	50 %	407471883
5	NC_018662	TG	3	6	5066	5071	0 %	50 %	50 %	0 %	407471884
6	NC_018662	AT	3	6	5187	5192	50 %	50 %	0 %	0 %	407471884
7	NC_018662	AG	3	6	5364	5369	50 %	0 %	50 %	0 %	407471884
8	NC_018662	GT	3	6	6199	6204	0 %	50 %	50 %	0 %	407471885
9	NC_018662	TC	3	6	7519	7524	0 %	50 %	0 %	50 %	407471887
10	NC_018662	GA	3	6	7586	7591	50 %	0 %	50 %	0 %	407471887
11	NC_018662	CA	4	8	7704	7711	50 %	0 %	0 %	50 %	407471887
12	NC_018662	GT	3	6	7728	7733	0 %	50 %	50 %	0 %	407471888
13	NC_018662	GA	3	6	11815	11820	50 %	0 %	50 %	0 %	407471894
14	NC_018662	TG	3	6	12926	12931	0 %	50 %	50 %	0 %	407471896
15	NC_018662	TC	3	6	13240	13245	0 %	50 %	0 %	50 %	407471897
16	NC_018662	AT	3	6	15521	15526	50 %	50 %	0 %	0 %	407471900
17	NC_018662	CA	3	6	16596	16601	50 %	0 %	0 %	50 %	407471902
18	NC_018662	GT	3	6	16725	16730	0 %	50 %	50 %	0 %	407471902
19	NC_018662	CT	3	6	18348	18353	0 %	50 %	0 %	50 %	407471905
20	NC_018662	GT	3	6	19093	19098	0 %	50 %	50 %	0 %	407471905
21	NC_018662	AC	3	6	19213	19218	50 %	0 %	0 %	50 %	407471905
22	NC_018662	GA	3	6	19260	19265	50 %	0 %	50 %	0 %	407471905
23	NC_018662	TG	3	6	20091	20096	0 %	50 %	50 %	0 %	407471905
24	NC_018662	CT	3	6	20212	20217	0 %	50 %	0 %	50 %	407471905
25	NC_018662	TG	3	6	20712	20717	0 %	50 %	50 %	0 %	407471905
26	NC_018662	CT	3	6	21303	21308	0 %	50 %	0 %	50 %	407471905
27	NC_018662	CA	3	6	25953	25958	50 %	0 %	0 %	50 %	407471911
28	NC_018662	AT	3	6	26201	26206	50 %	50 %	0 %	0 %	407471911
29	NC_018662	CT	3	6	33460	33465	0 %	50 %	0 %	50 %	407471916
30	NC_018662	AT	3	6	34269	34274	50 %	50 %	0 %	0 %	407471916
31	NC_018662	TA	3	6	34511	34516	50 %	50 %	0 %	0 %	407471916
32	NC_018662	AC	3	6	34683	34688	50 %	0 %	0 %	50 %	407471916
33	NC_018662	GA	3	6	34710	34715	50 %	0 %	50 %	0 %	407471916
34	NC_018662	AT	3	6	35296	35301	50 %	50 %	0 %	0 %	407471917
35	NC_018662	GA	3	6	35899	35904	50 %	0 %	50 %	0 %	407471917
36	NC_018662	AT	3	6	37469	37474	50 %	50 %	0 %	0 %	407471918
37	NC_018662	TA	3	6	37761	37766	50 %	50 %	0 %	0 %	407471918
38	NC_018662	AT	3	6	38202	38207	50 %	50 %	0 %	0 %	407471918
39	NC_018662	GA	3	6	38651	38656	50 %	0 %	50 %	0 %	407471919
40	NC_018662	AT	3	6	38831	38836	50 %	50 %	0 %	0 %	407471919
41	NC_018662	TA	3	6	39293	39298	50 %	50 %	0 %	0 %	407471920
42	NC_018662	TA	3	6	39936	39941	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
43	NC_018662	TC	3	6	40399	40404	0 %	50 %	0 %	50 %	407471921
44	NC_018662	TA	3	6	40478	40483	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
45	NC_018662	TC	3	6	40566	40571	0 %	50 %	0 %	50 %	407471921
46	NC_018662	AT	3	6	40666	40671	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
47	NC_018662	TA	3	6	40797	40802	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
48	NC_018662	CT	3	6	41476	41481	0 %	50 %	0 %	50 %	407471922
49	NC_018662	TC	3	6	41496	41501	0 %	50 %	0 %	50 %	407471922
50	NC_018662	TA	3	6	41909	41914	50 %	50 %	0 %	0 %	407471922
51	NC_018662	GC	3	6	44203	44208	0 %	0 %	50 %	50 %	407471925
52	NC_018662	TA	3	6	46457	46462	50 %	50 %	0 %	0 %	407471926
53	NC_018662	TC	3	6	47229	47234	0 %	50 %	0 %	50 %	407471927
54	NC_018662	TA	3	6	54750	54755	50 %	50 %	0 %	0 %	407471931
55	NC_018662	GA	3	6	54830	54835	50 %	0 %	50 %	0 %	407471931
56	NC_018662	AT	3	6	55088	55093	50 %	50 %	0 %	0 %	407471931
57	NC_018662	TA	3	6	55139	55144	50 %	50 %	0 %	0 %	407471931
58	NC_018662	TC	3	6	57417	57422	0 %	50 %	0 %	50 %	407471934
59	NC_018662	GA	3	6	58645	58650	50 %	0 %	50 %	0 %	407471936
60	NC_018662	AT	3	6	59252	59257	50 %	50 %	0 %	0 %	407471937
61	NC_018662	AT	3	6	59634	59639	50 %	50 %	0 %	0 %	407471938
62	NC_018662	TA	3	6	59679	59684	50 %	50 %	0 %	0 %	407471938
63	NC_018662	CT	3	6	64035	64040	0 %	50 %	0 %	50 %	407471944
64	NC_018662	CT	3	6	64836	64841	0 %	50 %	0 %	50 %	407471946
65	NC_018662	AT	3	6	65539	65544	50 %	50 %	0 %	0 %	407471948
66	NC_018662	AT	4	8	66475	66482	50 %	50 %	0 %	0 %	407471950
67	NC_018662	TC	3	6	66573	66578	0 %	50 %	0 %	50 %	407471950
68	NC_018662	AT	3	6	66691	66696	50 %	50 %	0 %	0 %	407471950
69	NC_018662	CT	3	6	66765	66770	0 %	50 %	0 %	50 %	407471950
70	NC_018662	GT	3	6	67466	67471	0 %	50 %	50 %	0 %	407471951
71	NC_018662	TA	3	6	67848	67853	50 %	50 %	0 %	0 %	407471951
72	NC_018662	AT	3	6	68734	68739	50 %	50 %	0 %	0 %	407471951
73	NC_018662	AT	3	6	69209	69214	50 %	50 %	0 %	0 %	407471951
74	NC_018662	TA	3	6	69550	69555	50 %	50 %	0 %	0 %	407471952
75	NC_018662	GA	3	6	71099	71104	50 %	0 %	50 %	0 %	407471955
76	NC_018662	AG	4	8	71567	71574	50 %	0 %	50 %	0 %	407471955
77	NC_018662	AG	3	6	71619	71624	50 %	0 %	50 %	0 %	407471955
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80	NC_018662	CG	3	6	72219	72224	0 %	0 %	50 %	50 %	407471957
81	NC_018662	TC	3	6	72446	72451	0 %	50 %	0 %	50 %	407471957
82	NC_018662	CG	3	6	73669	73674	0 %	0 %	50 %	50 %	407471959
83	NC_018662	AC	3	6	73932	73937	50 %	0 %	0 %	50 %	407471960
84	NC_018662	TC	3	6	75216	75221	0 %	50 %	0 %	50 %	407471961
85	NC_018662	AT	3	6	75236	75241	50 %	50 %	0 %	0 %	407471961

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.