MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 1000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018662	TA	3	6	40478	40483	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
502	NC_018662	TC	3	6	40566	40571	0 %	50 %	0 %	50 %	407471921
503	NC_018662	AACATC	2	12	40573	40584	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407471921
504	NC_018662	T	7	7	40593	40599	0 %	100 %	0 %	0 %	407471921
505	NC_018662	TAA	2	6	40610	40615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471921
506	NC_018662	ATTA	2	8	40629	40636	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
507	NC_018662	GTT	2	6	40641	40646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471921
508	NC_018662	AT	3	6	40666	40671	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
509	NC_018662	AAT	2	6	40676	40681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471921
510	NC_018662	TAT	2	6	40697	40702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471921
511	NC_018662	AGA	2	6	40729	40734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471921
512	NC_018662	ATAA	2	8	40748	40755	75 %	25 %	0 %	0 %	407471921
513	NC_018662	CTGT	2	8	40762	40769	0 %	50 %	25 %	25 %	407471921
514	NC_018662	ATTG	2	8	40784	40791	25 %	50 %	25 %	0 %	407471921
515	NC_018662	TA	3	6	40797	40802	50 %	50 %	0 %	0 %	407471921
516	NC_018662	TTA	2	6	40855	40860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471921
517	NC_018662	GAAA	2	8	40913	40920	75 %	0 %	25 %	0 %	407471921
518	NC_018662	TTG	2	6	41119	41124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471922
519	NC_018662	A	6	6	41148	41153	100 %	0 %	0 %	0 %	407471922
520	NC_018662	TAA	2	6	41158	41163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471922
521	NC_018662	ATT	2	6	41169	41174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471922
522	NC_018662	ATT	2	6	41217	41222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471922
523	NC_018662	TTTC	2	8	41251	41258	0 %	75 %	0 %	25 %	407471922
524	NC_018662	ATT	2	6	41274	41279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471922
525	NC_018662	ATAAA	2	10	41323	41332	80 %	20 %	0 %	0 %	407471922
526	NC_018662	CAGA	2	8	41347	41354	50 %	0 %	25 %	25 %	407471922
527	NC_018662	CT	3	6	41476	41481	0 %	50 %	0 %	50 %	407471922
528	NC_018662	GTT	2	6	41486	41491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471922
529	NC_018662	TC	3	6	41496	41501	0 %	50 %	0 %	50 %	407471922
530	NC_018662	AAGA	2	8	41519	41526	75 %	0 %	25 %	0 %	407471922
531	NC_018662	AAT	2	6	41663	41668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471922
532	NC_018662	TAA	2	6	41686	41691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471922
533	NC_018662	TTC	2	6	41862	41867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471922
534	NC_018662	GAAA	2	8	41870	41877	75 %	0 %	25 %	0 %	407471922
535	NC_018662	TA	3	6	41909	41914	50 %	50 %	0 %	0 %	407471922
536	NC_018662	TTC	3	9	41975	41983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471922
537	NC_018662	TAA	2	6	42019	42024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471922
538	NC_018662	A	7	7	42048	42054	100 %	0 %	0 %	0 %	407471922
539	NC_018662	TCT	2	6	42074	42079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471922
540	NC_018662	CCT	2	6	42103	42108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471922
541	NC_018662	ATA	2	6	42113	42118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471922
542	NC_018662	CTG	2	6	42815	42820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471923
543	NC_018662	AAT	2	6	42843	42848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471923
544	NC_018662	TCT	2	6	42975	42980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471924
545	NC_018662	TTC	2	6	43044	43049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471924
546	NC_018662	ATT	2	6	43065	43070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471924
547	NC_018662	CTG	2	6	43166	43171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471925
548	NC_018662	ATA	2	6	43208	43213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471925
549	NC_018662	C	6	6	43235	43240	0 %	0 %	0 %	100 %	407471925
550	NC_018662	T	6	6	43316	43321	0 %	100 %	0 %	0 %	407471925
551	NC_018662	TGA	2	6	43336	43341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471925
552	NC_018662	GCC	2	6	43356	43361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471925
553	NC_018662	TTA	2	6	43383	43388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471925
554	NC_018662	CCA	2	6	43407	43412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471925
555	NC_018662	CTG	2	6	43445	43450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471925
556	NC_018662	GAC	2	6	43474	43479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471925
557	NC_018662	CTG	2	6	43532	43537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471925
558	NC_018662	C	6	6	43695	43700	0 %	0 %	0 %	100 %	407471925
559	NC_018662	C	6	6	43761	43766	0 %	0 %	0 %	100 %	407471925
560	NC_018662	ATT	2	6	43799	43804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471925
561	NC_018662	AGG	2	6	43815	43820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471925
562	NC_018662	T	6	6	43821	43826	0 %	100 %	0 %	0 %	407471925
563	NC_018662	CTTT	2	8	43846	43853	0 %	75 %	0 %	25 %	407471925
564	NC_018662	CAT	2	6	43909	43914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471925
565	NC_018662	GTG	2	6	44001	44006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471925
566	NC_018662	TAGT	2	8	44025	44032	25 %	50 %	25 %	0 %	407471925
567	NC_018662	T	8	8	44063	44070	0 %	100 %	0 %	0 %	407471925
568	NC_018662	G	6	6	44092	44097	0 %	0 %	100 %	0 %	407471925
569	NC_018662	ATC	2	6	44175	44180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471925
570	NC_018662	GTT	2	6	44186	44191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471925
571	NC_018662	GC	3	6	44203	44208	0 %	0 %	50 %	50 %	407471925
572	NC_018662	CAA	2	6	44221	44226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471925
573	NC_018662	C	9	9	44288	44296	0 %	0 %	0 %	100 %	407471925
574	NC_018662	CCG	2	6	44322	44327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471925
575	NC_018662	GGC	2	6	44401	44406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471925
576	NC_018662	TAT	3	9	44428	44436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471925
577	NC_018662	GTA	2	6	44448	44453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471925
578	NC_018662	AGGC	2	8	44552	44559	25 %	0 %	50 %	25 %	407471925
579	NC_018662	GTA	2	6	44565	44570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471925
580	NC_018662	ATA	2	6	44571	44576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471925
581	NC_018662	ACT	2	6	44582	44587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471925
582	NC_018662	GAA	2	6	44757	44762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471925
583	NC_018662	ACT	2	6	46423	46428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471926
584	NC_018662	TA	3	6	46457	46462	50 %	50 %	0 %	0 %	407471926
585	NC_018662	CAC	2	6	46491	46496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471926
586	NC_018662	AGCAAG	2	12	46550	46561	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407471926
587	NC_018662	TTC	2	6	46569	46574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471926
588	NC_018662	GCT	2	6	46584	46589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471926
589	NC_018662	TCA	2	6	46624	46629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471926
590	NC_018662	TC	3	6	47229	47234	0 %	50 %	0 %	50 %	407471927
591	NC_018662	CAG	2	6	47310	47315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471927
592	NC_018662	TGA	2	6	47354	47359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471927
593	NC_018662	TGC	2	6	47440	47445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471927
594	NC_018662	CTC	2	6	47508	47513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471927
595	NC_018662	CTC	2	6	47559	47564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471927
596	NC_018662	GGT	2	6	47613	47618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471927
597	NC_018662	TGC	2	6	47725	47730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471927
598	NC_018662	ATG	2	6	47761	47766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471927
599	NC_018662	CCA	2	6	47774	47779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471927
600	NC_018662	TCA	2	6	47792	47797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471927
601	NC_018662	GCCA	2	8	47812	47819	25 %	0 %	25 %	50 %	407471927
602	NC_018662	TGC	2	6	47857	47862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471927
603	NC_018662	ATG	2	6	47884	47889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471927
604	NC_018662	GTG	2	6	47890	47895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471927
605	NC_018662	TGC	2	6	47998	48003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471927
606	NC_018662	GCA	2	6	48017	48022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471927
607	NC_018662	ATG	2	6	48199	48204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471927
608	NC_018662	ATG	2	6	48232	48237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471928
609	NC_018662	CCTT	2	8	48263	48270	0 %	50 %	0 %	50 %	407471928
610	NC_018662	ATT	3	9	48282	48290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471928
611	NC_018662	GCC	2	6	49766	49771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471929
612	NC_018662	CTT	2	6	49782	49787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471929
613	NC_018662	CCA	2	6	49796	49801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471929
614	NC_018662	CGC	2	6	49817	49822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471929
615	NC_018662	ACC	3	9	49892	49900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471929
616	NC_018662	TCA	2	6	49901	49906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471929
617	NC_018662	GCCA	2	8	49936	49943	25 %	0 %	25 %	50 %	407471929
618	NC_018662	ACACG	2	10	49961	49970	40 %	0 %	20 %	40 %	407471929
619	NC_018662	GTT	2	6	50048	50053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471929
620	NC_018662	GCG	2	6	50110	50115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471929
621	NC_018662	CTC	2	6	50289	50294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471929
622	NC_018662	ATC	2	6	50343	50348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471929
623	NC_018662	CCG	2	6	50399	50404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471929
624	NC_018662	ACC	2	6	50438	50443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471929
625	NC_018662	ATG	2	6	50506	50511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471929
626	NC_018662	ATA	2	6	50516	50521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471929
627	NC_018662	GCG	2	6	50522	50527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471929
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629	NC_018662	CAG	2	6	50610	50615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471929
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