MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 67352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018661	CCG	2	6	8	13	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471750
2	NC_018661	GCA	2	6	30	35	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471750
3	NC_018661	TAA	2	6	180	185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471750
4	NC_018661	TGC	2	6	336	341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471750
5	NC_018661	GGC	2	6	468	473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471750
6	NC_018661	GTT	2	6	513	518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471750
7	NC_018661	GGC	2	6	526	531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471750
8	NC_018661	CTG	2	6	553	558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471750
9	NC_018661	AAC	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471750
10	NC_018661	CTA	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471750
11	NC_018661	CTG	2	6	706	711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471750
12	NC_018661	CGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471750
13	NC_018661	TAA	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471750
14	NC_018661	CTG	2	6	781	786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471750
15	NC_018661	TGA	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471750
16	NC_018661	CGA	2	6	942	947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471750
17	NC_018661	AGA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471750
18	NC_018661	TAC	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471750
19	NC_018661	TGG	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471750
20	NC_018661	ACG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471750
21	NC_018661	AGA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471750
22	NC_018661	TTA	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471749
23	NC_018661	ACA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471749
24	NC_018661	GGT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471749
25	NC_018661	CTG	2	6	1517	1522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471749
26	NC_018661	TGG	2	6	1578	1583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471749
27	NC_018661	CGA	2	6	1620	1625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471749
28	NC_018661	GCG	2	6	1757	1762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471749
29	NC_018661	GAA	2	6	1913	1918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471749
30	NC_018661	CGG	2	6	2044	2049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471749
31	NC_018661	GCA	2	6	2076	2081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471749
32	NC_018661	TGG	2	6	2127	2132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471749
33	NC_018661	CCG	2	6	2152	2157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471749
34	NC_018661	GAA	2	6	2167	2172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471749
35	NC_018661	CAA	2	6	2302	2307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471749
36	NC_018661	GAA	2	6	2318	2323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471749
37	NC_018661	ATG	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471749
38	NC_018661	TGT	2	6	2497	2502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471749
39	NC_018661	TTG	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471748
40	NC_018661	AGG	2	6	2714	2719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471748
41	NC_018661	CGG	2	6	2898	2903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471748
42	NC_018661	AGA	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471748
43	NC_018661	AGC	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471748
44	NC_018661	GCG	2	6	3007	3012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471748
45	NC_018661	GAT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471748
46	NC_018661	TGA	3	9	3444	3452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471748
47	NC_018661	GCT	2	6	3462	3467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471748
48	NC_018661	CTC	2	6	3640	3645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471747
49	NC_018661	CAC	2	6	3731	3736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471747
50	NC_018661	GGT	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471747
51	NC_018661	CGA	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471747
52	NC_018661	CGG	3	9	3888	3896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
53	NC_018661	CGG	2	6	3958	3963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
54	NC_018661	GTA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471747
55	NC_018661	AGA	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471747
56	NC_018661	GGC	2	6	4280	4285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
57	NC_018661	TCT	2	6	4341	4346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471747
58	NC_018661	CAA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471747
59	NC_018661	CGG	2	6	4453	4458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
60	NC_018661	GCG	2	6	4481	4486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
61	NC_018661	AAG	2	6	4518	4523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471747
62	NC_018661	TCC	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471747
63	NC_018661	TCT	2	6	4646	4651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471747
64	NC_018661	CAG	2	6	4673	4678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471747
65	NC_018661	CTG	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
66	NC_018661	TGC	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
67	NC_018661	GCG	2	6	4772	4777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
68	NC_018661	CCG	2	6	4798	4803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471747
69	NC_018661	TGG	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471747
70	NC_018661	GGC	2	6	4907	4912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
71	NC_018661	CAT	4	12	5098	5109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471747
72	NC_018661	GCT	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
73	NC_018661	CTT	2	6	5158	5163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471747
74	NC_018661	GCC	2	6	5215	5220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471747
75	NC_018661	GAA	2	6	5233	5238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471747
76	NC_018661	GAC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471747
77	NC_018661	CGT	2	6	5417	5422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
78	NC_018661	TGG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471747
79	NC_018661	TCG	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
80	NC_018661	GAA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471747
81	NC_018661	CGT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
82	NC_018661	TCG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
83	NC_018661	ACC	2	6	5879	5884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471747
84	NC_018661	GTC	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
85	NC_018661	TGC	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
86	NC_018661	GTT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471747
87	NC_018661	CAC	2	6	5953	5958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471747
88	NC_018661	CGT	2	6	5984	5989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
89	NC_018661	GCG	2	6	6017	6022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
90	NC_018661	TTA	2	6	6075	6080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471746
91	NC_018661	CGC	2	6	6144	6149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471746
92	NC_018661	AAG	2	6	6157	6162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471746
93	NC_018661	ATC	2	6	6182	6187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471746
94	NC_018661	ATC	2	6	6219	6224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471746
95	NC_018661	TGA	2	6	6288	6293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471745
96	NC_018661	GAG	2	6	6355	6360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471745
97	NC_018661	GGC	2	6	6364	6369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471745
98	NC_018661	TGC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471745
99	NC_018661	GGC	2	6	6400	6405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471745
100	NC_018661	ATT	2	6	6574	6579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471745
101	NC_018661	CAC	2	6	6608	6613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471745
102	NC_018661	CTG	2	6	6649	6654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471745
103	NC_018661	CTG	2	6	6832	6837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471744
104	NC_018661	CCG	2	6	6857	6862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471744
105	NC_018661	ACG	2	6	6913	6918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471744
106	NC_018661	ACT	2	6	6980	6985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471744
107	NC_018661	GCC	2	6	7018	7023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471744
108	NC_018661	GAC	2	6	7060	7065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471744
109	NC_018661	CAC	2	6	7125	7130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471744
110	NC_018661	CTA	2	6	7158	7163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471744
111	NC_018661	CCA	2	6	7187	7192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471744
112	NC_018661	TGA	3	9	7250	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471744
113	NC_018661	TGA	2	6	7260	7265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471744
114	NC_018661	GAA	2	6	7426	7431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471744
115	NC_018661	AAG	2	6	7523	7528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471744
116	NC_018661	ATT	2	6	7647	7652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471743
117	NC_018661	ATG	2	6	7694	7699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471743
118	NC_018661	TGC	2	6	7726	7731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471743
119	NC_018661	TCT	2	6	7925	7930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471743
120	NC_018661	AGT	3	9	7941	7949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471743
121	NC_018661	CAT	2	6	8710	8715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471742
122	NC_018661	TGG	2	6	8892	8897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471742
123	NC_018661	GCA	2	6	8918	8923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471742
124	NC_018661	GAT	2	6	8974	8979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471742
125	NC_018661	CAA	2	6	8983	8988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471742
126	NC_018661	TGC	2	6	9039	9044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471742
127	NC_018661	GGC	2	6	9217	9222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471742
128	NC_018661	GCA	2	6	9470	9475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471741
129	NC_018661	ATT	2	6	9568	9573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471741
130	NC_018661	GCG	2	6	9617	9622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471741
131	NC_018661	TGA	2	6	9740	9745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471741
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163	NC_018661	GGC	2	6	12642	12647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471738
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255	NC_018661	GGC	2	6	20164	20169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471730
256	NC_018661	TGC	2	6	20186	20191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471730
257	NC_018661	TGG	2	6	20213	20218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471730
258	NC_018661	TGC	2	6	20231	20236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471730
259	NC_018661	ATT	2	6	20302	20307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471730
260	NC_018661	TCA	2	6	20441	20446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471730
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262	NC_018661	TGA	2	6	20684	20689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471730
263	NC_018661	CGG	2	6	20768	20773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471730
264	NC_018661	GGC	2	6	20881	20886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471730
265	NC_018661	GCA	2	6	20904	20909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471730
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267	NC_018661	TGG	2	6	21098	21103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471730
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277	NC_018661	TGG	2	6	22141	22146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471729
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279	NC_018661	CGT	2	6	22224	22229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471729
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