MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	T	6	6	1582	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	407484677
2	NC_018659	T	6	6	1629	1634	0 %	100 %	0 %	0 %	407484677
3	NC_018659	G	6	6	1658	1663	0 %	0 %	100 %	0 %	407484677
4	NC_018659	C	6	6	2720	2725	0 %	0 %	0 %	100 %	407484679
5	NC_018659	T	6	6	2738	2743	0 %	100 %	0 %	0 %	407484679
6	NC_018659	T	7	7	3761	3767	0 %	100 %	0 %	0 %	407484681
7	NC_018659	T	6	6	3886	3891	0 %	100 %	0 %	0 %	407484681
8	NC_018659	T	6	6	3947	3952	0 %	100 %	0 %	0 %	407484681
9	NC_018659	T	7	7	7404	7410	0 %	100 %	0 %	0 %	407484685
10	NC_018659	T	6	6	7667	7672	0 %	100 %	0 %	0 %	407484686
11	NC_018659	C	6	6	8450	8455	0 %	0 %	0 %	100 %	407484686
12	NC_018659	T	7	7	9239	9245	0 %	100 %	0 %	0 %	407484686
13	NC_018659	T	7	7	9781	9787	0 %	100 %	0 %	0 %	407484686
14	NC_018659	T	6	6	10163	10168	0 %	100 %	0 %	0 %	407484686
15	NC_018659	T	6	6	11066	11071	0 %	100 %	0 %	0 %	407484686
16	NC_018659	T	6	6	11076	11081	0 %	100 %	0 %	0 %	407484686
17	NC_018659	T	6	6	11325	11330	0 %	100 %	0 %	0 %	407484686
18	NC_018659	T	6	6	11792	11797	0 %	100 %	0 %	0 %	407484687
19	NC_018659	T	7	7	12019	12025	0 %	100 %	0 %	0 %	407484687
20	NC_018659	T	6	6	13586	13591	0 %	100 %	0 %	0 %	407484689
21	NC_018659	T	6	6	14299	14304	0 %	100 %	0 %	0 %	407484689
22	NC_018659	T	6	6	17227	17232	0 %	100 %	0 %	0 %	407484693
23	NC_018659	T	6	6	17849	17854	0 %	100 %	0 %	0 %	407484693
24	NC_018659	T	7	7	18795	18801	0 %	100 %	0 %	0 %	407484694
25	NC_018659	T	6	6	22260	22265	0 %	100 %	0 %	0 %	407484697
26	NC_018659	A	6	6	22608	22613	100 %	0 %	0 %	0 %	407484698
27	NC_018659	A	6	6	22818	22823	100 %	0 %	0 %	0 %	407484698
28	NC_018659	T	7	7	24227	24233	0 %	100 %	0 %	0 %	407484701
29	NC_018659	A	6	6	26442	26447	100 %	0 %	0 %	0 %	407484702
30	NC_018659	T	6	6	27451	27456	0 %	100 %	0 %	0 %	407484704
31	NC_018659	G	6	6	28063	28068	0 %	0 %	100 %	0 %	407484704
32	NC_018659	T	7	7	28405	28411	0 %	100 %	0 %	0 %	407484704
33	NC_018659	T	6	6	29936	29941	0 %	100 %	0 %	0 %	407484705
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35	NC_018659	T	6	6	30173	30178	0 %	100 %	0 %	0 %	407484705
36	NC_018659	T	8	8	31689	31696	0 %	100 %	0 %	0 %	407484707
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38	NC_018659	T	6	6	35089	35094	0 %	100 %	0 %	0 %	407484711
39	NC_018659	A	6	6	35275	35280	100 %	0 %	0 %	0 %	407484711
40	NC_018659	A	6	6	35551	35556	100 %	0 %	0 %	0 %	407484712
41	NC_018659	T	6	6	38638	38643	0 %	100 %	0 %	0 %	407484714
42	NC_018659	T	6	6	38742	38747	0 %	100 %	0 %	0 %	407484714
43	NC_018659	T	6	6	38756	38761	0 %	100 %	0 %	0 %	407484714
44	NC_018659	A	6	6	38814	38819	100 %	0 %	0 %	0 %	407484714
45	NC_018659	A	6	6	39047	39052	100 %	0 %	0 %	0 %	407484714
46	NC_018659	T	6	6	39111	39116	0 %	100 %	0 %	0 %	407484714
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49	NC_018659	T	6	6	39743	39748	0 %	100 %	0 %	0 %	407484715
50	NC_018659	T	6	6	39783	39788	0 %	100 %	0 %	0 %	407484715
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54	NC_018659	T	6	6	46032	46037	0 %	100 %	0 %	0 %	407484719
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63	NC_018659	A	6	6	54968	54973	100 %	0 %	0 %	0 %	407484731
64	NC_018659	A	6	6	57489	57494	100 %	0 %	0 %	0 %	407484735
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72	NC_018659	T	6	6	70203	70208	0 %	100 %	0 %	0 %	407484752
73	NC_018659	A	6	6	70547	70552	100 %	0 %	0 %	0 %	407484753
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97	NC_018659	T	6	6	86912	86917	0 %	100 %	0 %	0 %	407484769

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.