MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	ATCA	2	8	1566	1573	50 %	25 %	0 %	25 %	407484677
2	NC_018659	ATGA	2	8	1589	1596	50 %	25 %	25 %	0 %	407484677
3	NC_018659	TGGA	2	8	1833	1840	25 %	25 %	50 %	0 %	407484677
4	NC_018659	CAGA	2	8	2031	2038	50 %	0 %	25 %	25 %	407484677
5	NC_018659	GATA	2	8	2690	2697	50 %	25 %	25 %	0 %	407484679
6	NC_018659	CCAG	2	8	2706	2713	25 %	0 %	25 %	50 %	407484679
7	NC_018659	TGAT	2	8	2797	2804	25 %	50 %	25 %	0 %	407484679
8	NC_018659	CGAT	2	8	3101	3108	25 %	25 %	25 %	25 %	407484680
9	NC_018659	TGGT	2	8	5110	5117	0 %	50 %	50 %	0 %	407484682
10	NC_018659	TTTC	2	8	5540	5547	0 %	75 %	0 %	25 %	407484682
11	NC_018659	GAAC	2	8	5720	5727	50 %	0 %	25 %	25 %	407484683
12	NC_018659	TGGT	2	8	5889	5896	0 %	50 %	50 %	0 %	407484683
13	NC_018659	GCAG	2	8	6380	6387	25 %	0 %	50 %	25 %	407484683
14	NC_018659	GTGC	2	8	6476	6483	0 %	25 %	50 %	25 %	407484683
15	NC_018659	GCTG	2	8	6999	7006	0 %	25 %	50 %	25 %	407484684
16	NC_018659	TTCA	2	8	7309	7316	25 %	50 %	0 %	25 %	407484685
17	NC_018659	GACA	2	8	7418	7425	50 %	0 %	25 %	25 %	407484685
18	NC_018659	CGCT	2	8	7486	7493	0 %	25 %	25 %	50 %	407484685
19	NC_018659	CCTG	2	8	7673	7680	0 %	25 %	25 %	50 %	407484686
20	NC_018659	TCTG	2	8	9069	9076	0 %	50 %	25 %	25 %	407484686
21	NC_018659	AGGA	2	8	9519	9526	50 %	0 %	50 %	0 %	407484686
22	NC_018659	TTTG	2	8	9608	9615	0 %	75 %	25 %	0 %	407484686
23	NC_018659	ATTC	2	8	9683	9690	25 %	50 %	0 %	25 %	407484686
24	NC_018659	TCTG	2	8	10954	10961	0 %	50 %	25 %	25 %	407484686
25	NC_018659	CAGC	2	8	11220	11227	25 %	0 %	25 %	50 %	407484686
26	NC_018659	CGGG	2	8	11253	11260	0 %	0 %	75 %	25 %	407484686
27	NC_018659	GATG	2	8	11665	11672	25 %	25 %	50 %	0 %	407484687
28	NC_018659	GCAT	2	8	11811	11818	25 %	25 %	25 %	25 %	407484687
29	NC_018659	CTTC	2	8	11904	11911	0 %	50 %	0 %	50 %	407484687
30	NC_018659	TGCC	2	8	12719	12726	0 %	25 %	25 %	50 %	407484688
31	NC_018659	TGCC	2	8	13235	13242	0 %	25 %	25 %	50 %	407484688
32	NC_018659	CCGA	2	8	13263	13270	25 %	0 %	25 %	50 %	407484688
33	NC_018659	TGGT	2	8	13301	13308	0 %	50 %	50 %	0 %	407484688
34	NC_018659	CTTC	2	8	13740	13747	0 %	50 %	0 %	50 %	407484689
35	NC_018659	AGCC	2	8	13989	13996	25 %	0 %	25 %	50 %	407484689
36	NC_018659	GTTC	2	8	14493	14500	0 %	50 %	25 %	25 %	407484690
37	NC_018659	CAGC	2	8	14702	14709	25 %	0 %	25 %	50 %	407484690
38	NC_018659	GATT	2	8	15323	15330	25 %	50 %	25 %	0 %	407484691
39	NC_018659	GAAT	2	8	15691	15698	50 %	25 %	25 %	0 %	407484691
40	NC_018659	ACCT	2	8	16603	16610	25 %	25 %	0 %	50 %	407484692
41	NC_018659	CAAA	2	8	16704	16711	75 %	0 %	0 %	25 %	407484692
42	NC_018659	ATTT	2	8	17285	17292	25 %	75 %	0 %	0 %	407484693
43	NC_018659	GTGA	2	8	18658	18665	25 %	25 %	50 %	0 %	407484694
44	NC_018659	AACG	2	8	19018	19025	50 %	0 %	25 %	25 %	407484694
45	NC_018659	TGTA	2	8	19030	19037	25 %	50 %	25 %	0 %	407484694
46	NC_018659	CTTG	2	8	20337	20344	0 %	50 %	25 %	25 %	407484695
47	NC_018659	CGCA	2	8	20405	20412	25 %	0 %	25 %	50 %	407484696
48	NC_018659	ATAA	2	8	21081	21088	75 %	25 %	0 %	0 %	407484697
49	NC_018659	AGCC	2	8	21424	21431	25 %	0 %	25 %	50 %	407484697
50	NC_018659	AACC	2	8	21451	21458	50 %	0 %	0 %	50 %	407484697
51	NC_018659	CAAT	2	8	22211	22218	50 %	25 %	0 %	25 %	407484697
52	NC_018659	CAGA	2	8	22517	22524	50 %	0 %	25 %	25 %	407484698
53	NC_018659	TAAT	2	8	22732	22739	50 %	50 %	0 %	0 %	407484698
54	NC_018659	TGTC	2	8	23012	23019	0 %	50 %	25 %	25 %	407484699
55	NC_018659	TTAT	2	8	23246	23253	25 %	75 %	0 %	0 %	407484699
56	NC_018659	TTTG	2	8	23373	23380	0 %	75 %	25 %	0 %	407484699
57	NC_018659	CGGG	2	8	23399	23406	0 %	0 %	75 %	25 %	407484699
58	NC_018659	ATAA	2	8	23407	23414	75 %	25 %	0 %	0 %	407484699
59	NC_018659	GTTT	2	8	23502	23509	0 %	75 %	25 %	0 %	407484700
60	NC_018659	GTTA	2	8	23605	23612	25 %	50 %	25 %	0 %	407484700
61	NC_018659	TTTC	2	8	24042	24049	0 %	75 %	0 %	25 %	407484700
62	NC_018659	TTTA	2	8	24105	24112	25 %	75 %	0 %	0 %	407484701
63	NC_018659	AGCC	2	8	24365	24372	25 %	0 %	25 %	50 %	407484701
64	NC_018659	ACAA	2	8	24657	24664	75 %	0 %	0 %	25 %	407484701
65	NC_018659	CATG	2	8	25327	25334	25 %	25 %	25 %	25 %	407484702
66	NC_018659	GCTG	2	8	25657	25664	0 %	25 %	50 %	25 %	407484702
67	NC_018659	TGTA	2	8	25754	25761	25 %	50 %	25 %	0 %	407484702
68	NC_018659	GGCA	2	8	26023	26030	25 %	0 %	50 %	25 %	407484702
69	NC_018659	CAGA	2	8	26068	26075	50 %	0 %	25 %	25 %	407484702
70	NC_018659	ATGG	2	8	27190	27197	25 %	25 %	50 %	0 %	407484703
71	NC_018659	TCGT	2	8	27646	27653	0 %	50 %	25 %	25 %	407484704
72	NC_018659	GGCA	2	8	27931	27938	25 %	0 %	50 %	25 %	407484704
73	NC_018659	CAGA	2	8	28777	28784	50 %	0 %	25 %	25 %	407484705
74	NC_018659	TCAG	2	8	29574	29581	25 %	25 %	25 %	25 %	407484705
75	NC_018659	TGTT	2	8	29930	29937	0 %	75 %	25 %	0 %	407484705
76	NC_018659	TGCC	2	8	30227	30234	0 %	25 %	25 %	50 %	407484706
77	NC_018659	TGCC	2	8	30889	30896	0 %	25 %	25 %	50 %	407484707
78	NC_018659	ACTG	2	8	31339	31346	25 %	25 %	25 %	25 %	407484707
79	NC_018659	TCTT	2	8	34507	34514	0 %	75 %	0 %	25 %	407484710
80	NC_018659	AACG	2	8	35126	35133	50 %	0 %	25 %	25 %	407484711
81	NC_018659	AGGT	2	8	35202	35209	25 %	25 %	50 %	0 %	407484711
82	NC_018659	TGCC	2	8	35484	35491	0 %	25 %	25 %	50 %	407484712
83	NC_018659	AACG	2	8	36850	36857	50 %	0 %	25 %	25 %	407484713
84	NC_018659	TCCG	2	8	36880	36887	0 %	25 %	25 %	50 %	407484713
85	NC_018659	CTGC	2	8	37398	37405	0 %	25 %	25 %	50 %	407484713
86	NC_018659	GCTG	2	8	37532	37539	0 %	25 %	50 %	25 %	407484713
87	NC_018659	GGGA	2	8	39562	39569	25 %	0 %	75 %	0 %	407484715
88	NC_018659	CTGG	2	8	39603	39610	0 %	25 %	50 %	25 %	407484715
89	NC_018659	AAAG	2	8	41179	41186	75 %	0 %	25 %	0 %	407484716
90	NC_018659	CTGC	2	8	42162	42169	0 %	25 %	25 %	50 %	407484717
91	NC_018659	AGTC	2	8	42418	42425	25 %	25 %	25 %	25 %	407484717
92	NC_018659	ATTG	2	8	42883	42890	25 %	50 %	25 %	0 %	407484717
93	NC_018659	GGAG	2	8	43244	43251	25 %	0 %	75 %	0 %	407484717
94	NC_018659	CTGT	2	8	43390	43397	0 %	50 %	25 %	25 %	407484717
95	NC_018659	TGCC	2	8	43486	43493	0 %	25 %	25 %	50 %	407484717
96	NC_018659	CAGC	2	8	43893	43900	25 %	0 %	25 %	50 %	407484717
97	NC_018659	AGCG	2	8	44018	44025	25 %	0 %	50 %	25 %	407484717
98	NC_018659	AAGT	2	8	45247	45254	50 %	25 %	25 %	0 %	407484719
99	NC_018659	GCAG	2	8	45355	45362	25 %	0 %	50 %	25 %	407484719
100	NC_018659	ATAC	2	8	46397	46404	50 %	25 %	0 %	25 %	407484721
101	NC_018659	CTGT	2	8	46428	46435	0 %	50 %	25 %	25 %	407484721
102	NC_018659	CTTT	2	8	46699	46706	0 %	75 %	0 %	25 %	407484721
103	NC_018659	TTAA	2	8	46864	46871	50 %	50 %	0 %	0 %	407484721
104	NC_018659	ACTT	2	8	49265	49272	25 %	50 %	0 %	25 %	407484724
105	NC_018659	TGAA	2	8	49364	49371	50 %	25 %	25 %	0 %	407484724
106	NC_018659	TGGA	2	8	49486	49493	25 %	25 %	50 %	0 %	407484724
107	NC_018659	GGCT	2	8	49536	49543	0 %	25 %	50 %	25 %	407484724
108	NC_018659	AACA	2	8	50476	50483	75 %	0 %	0 %	25 %	407484726
109	NC_018659	CAGC	2	8	51347	51354	25 %	0 %	25 %	50 %	407484727
110	NC_018659	GTGA	2	8	52424	52431	25 %	25 %	50 %	0 %	407484728
111	NC_018659	AGAA	2	8	52659	52666	75 %	0 %	25 %	0 %	407484728
112	NC_018659	CAGC	2	8	52840	52847	25 %	0 %	25 %	50 %	407484729
113	NC_018659	GTAT	2	8	53493	53500	25 %	50 %	25 %	0 %	407484730
114	NC_018659	GCTG	2	8	53718	53725	0 %	25 %	50 %	25 %	407484730
115	NC_018659	TTCA	2	8	54131	54138	25 %	50 %	0 %	25 %	407484730
116	NC_018659	TGGC	2	8	54253	54260	0 %	25 %	50 %	25 %	407484730
117	NC_018659	ACTG	2	8	54853	54860	25 %	25 %	25 %	25 %	407484731
118	NC_018659	GCAG	2	8	55295	55302	25 %	0 %	50 %	25 %	407484731
119	NC_018659	ATGA	2	8	55544	55551	50 %	25 %	25 %	0 %	407484732
120	NC_018659	CAGT	2	8	56438	56445	25 %	25 %	25 %	25 %	407484734
121	NC_018659	GGCA	2	8	58133	58140	25 %	0 %	50 %	25 %	407484736
122	NC_018659	TAAG	2	8	60034	60041	50 %	25 %	25 %	0 %	407484739
123	NC_018659	AAGC	2	8	60136	60143	50 %	0 %	25 %	25 %	407484740
124	NC_018659	CCTG	2	8	60338	60345	0 %	25 %	25 %	50 %	407484740
125	NC_018659	GAAC	2	8	61109	61116	50 %	0 %	25 %	25 %	407484740
126	NC_018659	ACGC	2	8	61406	61413	25 %	0 %	25 %	50 %	407484740
127	NC_018659	GAAG	2	8	61574	61581	50 %	0 %	50 %	0 %	407484740
128	NC_018659	TCAG	2	8	61675	61682	25 %	25 %	25 %	25 %	407484740
129	NC_018659	CTGG	2	8	61984	61991	0 %	25 %	50 %	25 %	407484740
130	NC_018659	TCAC	2	8	62206	62213	25 %	25 %	0 %	50 %	407484741
131	NC_018659	CTTT	2	8	62670	62677	0 %	75 %	0 %	25 %	407484742
132	NC_018659	TGGC	2	8	62774	62781	0 %	25 %	50 %	25 %	407484742
133	NC_018659	CCGT	2	8	62861	62868	0 %	25 %	25 %	50 %	407484742
134	NC_018659	GCGA	2	8	63557	63564	25 %	0 %	50 %	25 %	407484743
135	NC_018659	CTGG	2	8	67316	67323	0 %	25 %	50 %	25 %	407484748
136	NC_018659	GCTG	2	8	67595	67602	0 %	25 %	50 %	25 %	407484748
137	NC_018659	CCAG	2	8	68356	68363	25 %	0 %	25 %	50 %	407484750
138	NC_018659	CAGC	2	8	69294	69301	25 %	0 %	25 %	50 %	407484751
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.