MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	CGA	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484677
2	NC_018659	ACG	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484677
3	NC_018659	TGC	2	6	1873	1878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484677
4	NC_018659	CAC	2	6	2115	2120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484677
5	NC_018659	TTA	2	6	2153	2158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484677
6	NC_018659	GCA	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484677
7	NC_018659	GTT	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484677
8	NC_018659	CCT	2	6	2298	2303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484677
9	NC_018659	ATG	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484678
10	NC_018659	TCG	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484678
11	NC_018659	TCA	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484679
12	NC_018659	GCA	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484679
13	NC_018659	CAT	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484679
14	NC_018659	AGC	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484679
15	NC_018659	GCG	2	6	2967	2972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484679
16	NC_018659	GCC	2	6	2982	2987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484679
17	NC_018659	AGA	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484680
18	NC_018659	CAG	2	6	3082	3087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484680
19	NC_018659	CAG	2	6	3115	3120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484680
20	NC_018659	TGC	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484680
21	NC_018659	CAG	3	9	3279	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484680
22	NC_018659	CTG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484680
23	NC_018659	TCA	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484680
24	NC_018659	TGA	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484681
25	NC_018659	CAC	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484681
26	NC_018659	TAC	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484681
27	NC_018659	GAC	2	6	3754	3759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484681
28	NC_018659	ATT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484681
29	NC_018659	GGC	2	6	3830	3835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484681
30	NC_018659	ATC	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484681
31	NC_018659	TTC	2	6	3876	3881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484681
32	NC_018659	TCT	2	6	4003	4008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484681
33	NC_018659	TGA	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484681
34	NC_018659	CAT	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484681
35	NC_018659	GTT	2	6	4303	4308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
36	NC_018659	CAT	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484682
37	NC_018659	GTT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
38	NC_018659	CGT	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
39	NC_018659	CAA	2	6	4462	4467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484682
40	NC_018659	ACC	2	6	4565	4570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484682
41	NC_018659	CAC	2	6	4594	4599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484682
42	NC_018659	CCT	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484682
43	NC_018659	CCA	2	6	4852	4857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484682
44	NC_018659	TGC	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
45	NC_018659	TGT	2	6	5069	5074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
46	NC_018659	TAC	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484682
47	NC_018659	GCT	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
48	NC_018659	TCC	2	6	5199	5204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484682
49	NC_018659	TGC	2	6	5249	5254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
50	NC_018659	TGT	2	6	5259	5264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484682
51	NC_018659	ATT	2	6	5324	5329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484682
52	NC_018659	CCG	2	6	5412	5417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484682
53	NC_018659	TGC	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484682
54	NC_018659	GCC	3	9	5492	5500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484682
55	NC_018659	GAT	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484682
56	NC_018659	AGT	2	6	5633	5638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484683
57	NC_018659	GGA	2	6	5810	5815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484683
58	NC_018659	CAT	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484683
59	NC_018659	GAC	2	6	5922	5927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484683
60	NC_018659	AGG	2	6	6109	6114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484683
61	NC_018659	CAC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484683
62	NC_018659	GTT	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484683
63	NC_018659	ACA	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484683
64	NC_018659	CGG	2	6	6318	6323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484683
65	NC_018659	TCG	2	6	6462	6467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484683
66	NC_018659	GGC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484683
67	NC_018659	ATC	2	6	6603	6608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484684
68	NC_018659	TCT	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484684
69	NC_018659	GAG	2	6	6906	6911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484684
70	NC_018659	CAT	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484684
71	NC_018659	TTG	2	6	7009	7014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484684
72	NC_018659	GAC	2	6	7030	7035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484684
73	NC_018659	AAG	2	6	7112	7117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484684
74	NC_018659	ATT	2	6	7160	7165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484684
75	NC_018659	GTC	2	6	7366	7371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484685
76	NC_018659	TAC	2	6	7506	7511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484685
77	NC_018659	GCA	2	6	7544	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484685
78	NC_018659	TCC	2	6	7681	7686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484686
79	NC_018659	CTG	2	6	7707	7712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484686
80	NC_018659	GTT	2	6	7754	7759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
81	NC_018659	CAG	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484686
82	NC_018659	TTC	2	6	7791	7796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484686
83	NC_018659	TGT	2	6	7928	7933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
84	NC_018659	GGA	2	6	8366	8371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484686
85	NC_018659	GTT	2	6	8444	8449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
86	NC_018659	TGC	2	6	8465	8470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484686
87	NC_018659	CAA	2	6	8489	8494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484686
88	NC_018659	TGG	2	6	8583	8588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484686
89	NC_018659	TTC	2	6	8589	8594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484686
90	NC_018659	TGC	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484686
91	NC_018659	TGA	2	6	8634	8639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484686
92	NC_018659	TGA	2	6	8661	8666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484686
93	NC_018659	GCA	2	6	8674	8679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484686
94	NC_018659	CTT	2	6	8702	8707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484686
95	NC_018659	GTT	2	6	8735	8740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
96	NC_018659	ACA	2	6	8782	8787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484686
97	NC_018659	TGT	2	6	8867	8872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
98	NC_018659	TGG	2	6	8948	8953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484686
99	NC_018659	GTC	2	6	9181	9186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484686
100	NC_018659	TAT	2	6	9287	9292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484686
101	NC_018659	TGC	2	6	9319	9324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484686
102	NC_018659	TGT	2	6	9363	9368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
103	NC_018659	TCA	2	6	9464	9469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484686
104	NC_018659	TTC	2	6	9498	9503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484686
105	NC_018659	TCA	2	6	9616	9621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484686
106	NC_018659	TCA	2	6	9629	9634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484686
107	NC_018659	GCG	2	6	9721	9726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484686
108	NC_018659	GCA	2	6	9730	9735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484686
109	NC_018659	TGT	2	6	9769	9774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
110	NC_018659	CCG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484686
111	NC_018659	TCA	2	6	9880	9885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484686
112	NC_018659	TCA	2	6	10036	10041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484686
113	NC_018659	AGC	2	6	10059	10064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484686
114	NC_018659	CTG	2	6	10074	10079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484686
115	NC_018659	TGA	2	6	10277	10282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484686
116	NC_018659	TCC	2	6	10383	10388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484686
117	NC_018659	TTG	2	6	10406	10411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484686
118	NC_018659	AGA	2	6	10460	10465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484686
119	NC_018659	AAT	2	6	10509	10514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484686
120	NC_018659	TCA	2	6	10535	10540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484686
121	NC_018659	GGC	2	6	10572	10577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484686
122	NC_018659	GCG	2	6	10619	10624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484686
123	NC_018659	CCG	2	6	10684	10689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484686
124	NC_018659	GCG	2	6	10848	10853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484686
125	NC_018659	CCG	2	6	10966	10971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484686
126	NC_018659	ATC	2	6	10995	11000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484686
127	NC_018659	CGG	2	6	11087	11092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484686
128	NC_018659	GCA	3	9	11595	11603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484687
129	NC_018659	CAA	2	6	11644	11649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484687
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500	NC_018659	GTA	2	6	46636	46641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484721

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