MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 2922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018658	GCGGA	2	10	232	241	20 %	0 %	60 %	20 %	407479588
2	NC_018658	TTTAC	2	10	2904	2913	20 %	60 %	0 %	20 %	407479590
3	NC_018658	TGGCG	2	10	7583	7592	0 %	20 %	60 %	20 %	407479594
4	NC_018658	TGAAA	2	10	8775	8784	60 %	20 %	20 %	0 %	407479596
5	NC_018658	TTATG	2	10	9689	9698	20 %	60 %	20 %	0 %	407479597
6	NC_018658	AAACT	2	10	10160	10169	60 %	20 %	0 %	20 %	407479597
7	NC_018658	GGTAC	2	10	10342	10351	20 %	20 %	40 %	20 %	407479598
8	NC_018658	AGTGA	2	10	10420	10429	40 %	20 %	40 %	0 %	407479598
9	NC_018658	TTATT	2	10	12280	12289	20 %	80 %	0 %	0 %	407479600
10	NC_018658	TCTCT	2	10	13113	13122	0 %	60 %	0 %	40 %	407479600
11	NC_018658	CGCAG	2	10	17245	17254	20 %	0 %	40 %	40 %	407479605
12	NC_018658	TGGTG	2	10	21227	21236	0 %	40 %	60 %	0 %	407479608
13	NC_018658	TGAAA	2	10	22679	22688	60 %	20 %	20 %	0 %	407479611
14	NC_018658	AAATG	2	10	26582	26591	60 %	20 %	20 %	0 %	407479613
15	NC_018658	ATTTT	2	10	27323	27332	20 %	80 %	0 %	0 %	407479614
16	NC_018658	CCGCA	2	10	28571	28580	20 %	0 %	20 %	60 %	407479617
17	NC_018658	TGGGC	2	10	32360	32369	0 %	20 %	60 %	20 %	407479621
18	NC_018658	GGCGC	2	10	32400	32409	0 %	0 %	60 %	40 %	407479621
19	NC_018658	GTGTT	2	10	32430	32439	0 %	60 %	40 %	0 %	407479621
20	NC_018658	TCCGA	2	10	33057	33066	20 %	20 %	20 %	40 %	407479622
21	NC_018658	TCTGG	2	10	34320	34329	0 %	40 %	40 %	20 %	407479624
22	NC_018658	CTGGC	2	10	34429	34438	0 %	20 %	40 %	40 %	407479624
23	NC_018658	GCACG	2	10	35223	35232	20 %	0 %	40 %	40 %	407479624
24	NC_018658	GCTGC	2	10	35806	35815	0 %	20 %	40 %	40 %	407479625
25	NC_018658	GCGGA	2	10	38791	38800	20 %	0 %	60 %	20 %	407479627
26	NC_018658	TGCCT	2	10	39510	39519	0 %	40 %	20 %	40 %	407479627
27	NC_018658	ATTCC	2	10	40803	40812	20 %	40 %	0 %	40 %	407479628
28	NC_018658	CTCGC	2	10	41800	41809	0 %	20 %	20 %	60 %	407479629
29	NC_018658	TCAGG	2	10	41828	41837	20 %	20 %	40 %	20 %	407479629
30	NC_018658	CGCGG	2	10	42186	42195	0 %	0 %	60 %	40 %	407479630
31	NC_018658	CGACC	2	10	44315	44324	20 %	0 %	20 %	60 %	407479633
32	NC_018658	CATCT	2	10	47855	47864	20 %	40 %	0 %	40 %	407479637
33	NC_018658	TCTGG	2	10	48673	48682	0 %	40 %	40 %	20 %	407479638
34	NC_018658	GAAAG	2	10	51073	51082	60 %	0 %	40 %	0 %	407479644
35	NC_018658	CACCG	2	10	56463	56472	20 %	0 %	20 %	60 %	407479650
36	NC_018658	CACTT	2	10	61510	61519	20 %	40 %	0 %	40 %	407479655
37	NC_018658	AAAGG	2	10	67703	67712	60 %	0 %	40 %	0 %	407479663
38	NC_018658	GCTTC	2	10	68444	68453	0 %	40 %	20 %	40 %	407479664
39	NC_018658	TCCCC	2	10	68804	68813	0 %	20 %	0 %	80 %	407479665
40	NC_018658	TGCCC	2	10	68862	68871	0 %	20 %	20 %	60 %	407479665
41	NC_018658	CGGCG	2	10	69420	69429	0 %	0 %	60 %	40 %	407479667
42	NC_018658	CGGCG	2	10	72043	72052	0 %	0 %	60 %	40 %	407479670
43	NC_018658	GGGCT	2	10	72665	72674	0 %	20 %	60 %	20 %	407479672
44	NC_018658	CGGCC	2	10	72802	72811	0 %	0 %	40 %	60 %	407479672
45	NC_018658	GGCCT	2	10	72875	72884	0 %	20 %	40 %	40 %	407479672
46	NC_018658	CGGAC	2	10	72937	72946	20 %	0 %	40 %	40 %	407479672
47	NC_018658	CGCAG	2	10	74982	74991	20 %	0 %	40 %	40 %	407479674
48	NC_018658	TGCTC	2	10	77869	77878	0 %	40 %	20 %	40 %	407479678
49	NC_018658	AGGCC	2	10	78058	78067	20 %	0 %	40 %	40 %	407479678
50	NC_018658	CTCCC	2	10	78832	78841	0 %	20 %	0 %	80 %	407479679
51	NC_018658	AAGGC	2	10	79064	79073	40 %	0 %	40 %	20 %	407479680
52	NC_018658	CCAGC	2	10	81077	81086	20 %	0 %	20 %	60 %	407479682
53	NC_018658	ACGTC	2	10	81742	81751	20 %	20 %	20 %	40 %	407479682
54	NC_018658	GGCCT	2	10	82690	82699	0 %	20 %	40 %	40 %	407479684
55	NC_018658	GAGCA	2	10	82879	82888	40 %	0 %	40 %	20 %	407479684
56	NC_018658	TGCTC	2	10	83893	83902	0 %	40 %	20 %	40 %	407479685
57	NC_018658	AGGCC	2	10	84082	84091	20 %	0 %	40 %	40 %	407479685
58	NC_018658	ATCCC	2	10	84439	84448	20 %	20 %	0 %	60 %	407479686
59	NC_018658	CGCTG	2	10	84582	84591	0 %	20 %	40 %	40 %	407479686
60	NC_018658	TTCCT	2	10	85816	85825	0 %	60 %	0 %	40 %	407479688
61	NC_018658	TTCAA	2	10	86010	86019	40 %	40 %	0 %	20 %	407479688
62	NC_018658	CGAAC	2	10	86265	86274	40 %	0 %	20 %	40 %	407479689
63	NC_018658	GCCAA	2	10	89072	89081	40 %	0 %	20 %	40 %	407479693
64	NC_018658	GCATC	2	10	89563	89572	20 %	20 %	20 %	40 %	407479693
65	NC_018658	CGCGC	2	10	90742	90751	0 %	0 %	40 %	60 %	407479693
66	NC_018658	TCTTT	2	10	93436	93445	0 %	80 %	0 %	20 %	407479697
67	NC_018658	CTTAC	2	10	94624	94633	20 %	40 %	0 %	40 %	407479698
68	NC_018658	TTAAT	2	10	94778	94787	40 %	60 %	0 %	0 %	407479698
69	NC_018658	GTTTG	2	10	97248	97257	0 %	60 %	40 %	0 %	407479699
70	NC_018658	CTTTA	2	10	97794	97803	20 %	60 %	0 %	20 %	407479699
71	NC_018658	CGGAC	2	10	100346	100355	20 %	0 %	40 %	40 %	407479701
72	NC_018658	GTGTG	2	10	108645	108654	0 %	40 %	60 %	0 %	407479707
73	NC_018658	CGGGA	2	10	109428	109437	20 %	0 %	60 %	20 %	407479708
74	NC_018658	CCAGG	2	10	109905	109914	20 %	0 %	40 %	40 %	407479708
75	NC_018658	GAATC	2	10	114319	114328	40 %	20 %	20 %	20 %	407479712
76	NC_018658	CAGAT	2	10	116417	116426	40 %	20 %	20 %	20 %	407479716
77	NC_018658	TGGCG	2	10	117855	117864	0 %	20 %	60 %	20 %	407479717
78	NC_018658	ACGCT	2	10	119892	119901	20 %	20 %	20 %	40 %	407479721
79	NC_018658	GAATG	2	10	124472	124481	40 %	20 %	40 %	0 %	407479725
80	NC_018658	TCTAT	2	10	125222	125231	20 %	60 %	0 %	20 %	407479726
81	NC_018658	ATTTA	2	10	126367	126376	40 %	60 %	0 %	0 %	407479727
82	NC_018658	TATAA	2	10	126711	126720	60 %	40 %	0 %	0 %	407479727
83	NC_018658	AACAA	2	10	127009	127018	80 %	0 %	0 %	20 %	407479728
84	NC_018658	AATTA	2	10	127103	127112	60 %	40 %	0 %	0 %	407479728
85	NC_018658	CAATG	2	10	129529	129538	40 %	20 %	20 %	20 %	407479730
86	NC_018658	TGTGC	2	10	131851	131860	0 %	40 %	40 %	20 %	407479732
87	NC_018658	ACGGA	2	10	138339	138348	40 %	0 %	40 %	20 %	407479738
88	NC_018658	GCGCG	2	10	138632	138641	0 %	0 %	60 %	40 %	407479738
89	NC_018658	TCATC	2	10	140090	140099	20 %	40 %	0 %	40 %	407479739
90	NC_018658	GCACA	2	10	142960	142969	40 %	0 %	20 %	40 %	407479742
91	NC_018658	AACAA	2	10	143104	143113	80 %	0 %	0 %	20 %	407479743
92	NC_018658	GCGGT	2	10	144135	144144	0 %	20 %	60 %	20 %	407479744
93	NC_018658	CCACG	2	10	145133	145142	20 %	0 %	20 %	60 %	407479745
94	NC_018658	GGGAT	2	10	145471	145480	20 %	20 %	60 %	0 %	407479745
95	NC_018658	GGGCA	2	10	145666	145675	20 %	0 %	60 %	20 %	407479746
96	NC_018658	CAAAG	2	10	147763	147772	60 %	0 %	20 %	20 %	407479748
97	NC_018658	TCTTT	2	10	147778	147787	0 %	80 %	0 %	20 %	407479748
98	NC_018658	CATGC	2	10	147814	147823	20 %	20 %	20 %	40 %	407479748
99	NC_018658	CGGTG	2	10	152094	152103	0 %	20 %	60 %	20 %	407479750
100	NC_018658	CAGAG	2	10	152305	152314	40 %	0 %	40 %	20 %	407479750
101	NC_018658	TTTGG	2	10	153648	153657	0 %	60 %	40 %	0 %	407479750
102	NC_018658	CGCTG	2	10	154299	154308	0 %	20 %	40 %	40 %	407479750
103	NC_018658	TGCAT	2	10	157269	157278	20 %	40 %	20 %	20 %	407479754
104	NC_018658	GCAGT	2	10	157331	157340	20 %	20 %	40 %	20 %	407479754
105	NC_018658	ATTGC	2	10	157761	157770	20 %	40 %	20 %	20 %	407479755
106	NC_018658	ACCGT	2	10	159381	159390	20 %	20 %	20 %	40 %	407479756
107	NC_018658	GGTCA	2	10	159749	159758	20 %	20 %	40 %	20 %	407479756
108	NC_018658	CGGTG	2	10	169556	169565	0 %	20 %	60 %	20 %	407479763
109	NC_018658	CGGGC	2	10	171477	171486	0 %	0 %	60 %	40 %	407479763
110	NC_018658	CGCAG	2	10	173692	173701	20 %	0 %	40 %	40 %	407479765
111	NC_018658	CGCGG	2	10	175128	175137	0 %	0 %	60 %	40 %	407479766
112	NC_018658	TGATG	2	10	178192	178201	20 %	40 %	40 %	0 %	407479768
113	NC_018658	AGATG	2	10	180139	180148	40 %	20 %	40 %	0 %	407479771
114	NC_018658	AGGTA	2	10	180625	180634	40 %	20 %	40 %	0 %	407479771
115	NC_018658	GGCGA	2	10	184109	184118	20 %	0 %	60 %	20 %	407479775
116	NC_018658	GCCAG	2	10	187727	187736	20 %	0 %	40 %	40 %	407479778
117	NC_018658	AGCCC	2	10	188781	188790	20 %	0 %	20 %	60 %	407479779
118	NC_018658	TTGGG	2	10	190932	190941	0 %	40 %	60 %	0 %	407479782
119	NC_018658	AGCGG	2	10	191953	191962	20 %	0 %	60 %	20 %	407479783
120	NC_018658	CCCAA	2	10	193884	193893	40 %	0 %	0 %	60 %	407479786
121	NC_018658	CATGG	2	10	197890	197899	20 %	20 %	40 %	20 %	407479788
122	NC_018658	AAAGC	2	10	198518	198527	60 %	0 %	20 %	20 %	407479788
123	NC_018658	ATGCC	2	10	200863	200872	20 %	20 %	20 %	40 %	407479790
124	NC_018658	AGCGT	2	10	201300	201309	20 %	20 %	40 %	20 %	407479790
125	NC_018658	CTGGG	2	10	204011	204020	0 %	20 %	60 %	20 %	407479792
126	NC_018658	GCGCA	2	10	207114	207123	20 %	0 %	40 %	40 %	407479796
127	NC_018658	CTGGG	2	10	208939	208948	0 %	20 %	60 %	20 %	407479798
128	NC_018658	ATCGA	2	10	210388	210397	40 %	20 %	20 %	20 %	407479799
129	NC_018658	GTTAC	2	10	212215	212224	20 %	40 %	20 %	20 %	407479801
130	NC_018658	TTACG	2	10	213730	213739	20 %	40 %	20 %	20 %	407479803
131	NC_018658	GCTTC	2	10	215658	215667	0 %	40 %	20 %	40 %	407479805
132	NC_018658	TTCGC	2	10	217807	217816	0 %	40 %	20 %	40 %	407479806
133	NC_018658	CATTA	2	10	219860	219869	40 %	40 %	0 %	20 %	407479809
134	NC_018658	TGGTG	2	10	221052	221061	0 %	40 %	60 %	0 %	407479810
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383	NC_018658	GTTGG	2	10	655317	655326	0 %	40 %	60 %	0 %	407480224
384	NC_018658	TTGAA	2	10	655592	655601	40 %	40 %	20 %	0 %	407480224
385	NC_018658	CGTTA	2	10	657919	657928	20 %	40 %	20 %	20 %	407480226
386	NC_018658	ATCGC	2	10	660110	660119	20 %	20 %	20 %	40 %	407480228
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389	NC_018658	AATCA	2	10	668965	668974	60 %	20 %	0 %	20 %	407480238
390	NC_018658	GTTTG	2	10	669179	669188	0 %	60 %	40 %	0 %	407480238
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