MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 93905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_018658	TGA	2	6	225642	225647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479813
4003	NC_018658	CAG	2	6	225660	225665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479813
4004	NC_018658	GAA	2	6	225676	225681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479813
4005	NC_018658	AGA	2	6	225708	225713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479813
4006	NC_018658	TTG	2	6	225860	225865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479814
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4008	NC_018658	AAT	2	6	226166	226171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479814
4009	NC_018658	AT	3	6	226193	226198	50 %	50 %	0 %	0 %	407479814
4010	NC_018658	AC	3	6	226203	226208	50 %	0 %	0 %	50 %	407479814
4011	NC_018658	GGCAC	2	10	226247	226256	20 %	0 %	40 %	40 %	407479814
4012	NC_018658	AGAA	2	8	226257	226264	75 %	0 %	25 %	0 %	407479814
4013	NC_018658	GGT	2	6	226298	226303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479814
4014	NC_018658	TTG	2	6	226338	226343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479814
4015	NC_018658	ATT	2	6	226352	226357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479814
4016	NC_018658	A	6	6	226390	226395	100 %	0 %	0 %	0 %	407479814
4017	NC_018658	ACC	2	6	226549	226554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479814
4018	NC_018658	AAT	2	6	226598	226603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479814
4019	NC_018658	TTA	2	6	226751	226756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479814
4020	NC_018658	CTG	2	6	226933	226938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479815
4021	NC_018658	CGGAA	2	10	227094	227103	40 %	0 %	40 %	20 %	407479815
4022	NC_018658	GAC	2	6	227191	227196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479815
4023	NC_018658	GCT	2	6	227257	227262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479815
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4025	NC_018658	AAT	2	6	227426	227431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479815
4026	NC_018658	CAG	2	6	227707	227712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479816
4027	NC_018658	TTGC	2	8	227725	227732	0 %	50 %	25 %	25 %	407479816
4028	NC_018658	T	6	6	227765	227770	0 %	100 %	0 %	0 %	407479816
4029	NC_018658	CGC	2	6	227773	227778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479816
4030	NC_018658	CTG	2	6	227822	227827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479816
4031	NC_018658	TTG	2	6	227828	227833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479816
4032	NC_018658	GCC	2	6	227839	227844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479816
4033	NC_018658	CTT	2	6	227859	227864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479816
4034	NC_018658	TAC	2	6	227867	227872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479816
4035	NC_018658	TCT	2	6	227874	227879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479816
4036	NC_018658	GCC	2	6	227891	227896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479816
4037	NC_018658	TGG	2	6	227921	227926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479816
4038	NC_018658	CCTT	2	8	227960	227967	0 %	50 %	0 %	50 %	407479816
4039	NC_018658	CAT	2	6	227988	227993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479816
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4041	NC_018658	GTT	2	6	228034	228039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479816
4042	NC_018658	CTTATC	2	12	228085	228096	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407479816
4043	NC_018658	GTC	2	6	228169	228174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479816
4044	NC_018658	TAT	2	6	228186	228191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479816
4045	NC_018658	CAG	2	6	228223	228228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479816
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4047	NC_018658	GAA	2	6	228384	228389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479816
4048	NC_018658	TGA	2	6	228417	228422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479816
4049	NC_018658	ATC	2	6	228439	228444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479816
4050	NC_018658	GGC	2	6	228528	228533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479816
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4052	NC_018658	AGAAC	2	10	228633	228642	60 %	0 %	20 %	20 %	407479816
4053	NC_018658	GAT	2	6	228790	228795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479816
4054	NC_018658	GCA	2	6	228816	228821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479816
4055	NC_018658	GAT	2	6	228969	228974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479816
4056	NC_018658	TGAT	2	8	229025	229032	25 %	50 %	25 %	0 %	407479816
4057	NC_018658	GCACG	2	10	229107	229116	20 %	0 %	40 %	40 %	407479816
4058	NC_018658	CCG	2	6	229132	229137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479816
4059	NC_018658	GAT	2	6	229155	229160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479816
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4061	NC_018658	CAT	2	6	229275	229280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479816
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4063	NC_018658	A	6	6	229353	229358	100 %	0 %	0 %	0 %	407479816
4064	NC_018658	CTAA	2	8	229367	229374	50 %	25 %	0 %	25 %	407479816
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4081	NC_018658	A	6	6	231186	231191	100 %	0 %	0 %	0 %	407479817
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4093	NC_018658	CAAG	2	8	231746	231753	50 %	0 %	25 %	25 %	407479817
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4103	NC_018658	GCTG	2	8	232400	232407	0 %	25 %	50 %	25 %	407479818
4104	NC_018658	CA	3	6	232434	232439	50 %	0 %	0 %	50 %	407479818
4105	NC_018658	TCT	2	6	232477	232482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479818
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4109	NC_018658	CG	4	8	232760	232767	0 %	0 %	50 %	50 %	407479818
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4111	NC_018658	TTGA	2	8	232923	232930	25 %	50 %	25 %	0 %	407479818
4112	NC_018658	CGC	2	6	232941	232946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479818
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4121	NC_018658	CAT	2	6	233069	233074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479819
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4242	NC_018658	CGT	2	6	240064	240069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479825
4243	NC_018658	GTC	2	6	240080	240085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479825
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4263	NC_018658	TTG	2	6	242941	242946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479828
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4349	NC_018658	GTG	2	6	247211	247216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479830
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4357	NC_018658	GCC	2	6	247452	247457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479830
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4359	NC_018658	AGC	2	6	247522	247527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479830
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4481	NC_018658	ACG	2	6	252935	252940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479832
4482	NC_018658	TTG	2	6	252958	252963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479832
4483	NC_018658	CAG	2	6	252981	252986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479832
4484	NC_018658	TACG	2	8	253020	253027	25 %	25 %	25 %	25 %	407479832
4485	NC_018658	CCG	3	9	253033	253041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479832
4486	NC_018658	CCG	2	6	253065	253070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479832
4487	NC_018658	TGG	2	6	253222	253227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479833
4488	NC_018658	T	6	6	253255	253260	0 %	100 %	0 %	0 %	407479833
4489	NC_018658	GCTC	2	8	253329	253336	0 %	25 %	25 %	50 %	407479833
4490	NC_018658	TGC	2	6	253444	253449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479833
4491	NC_018658	CTCG	2	8	253556	253563	0 %	25 %	25 %	50 %	407479833
4492	NC_018658	TAC	2	6	253600	253605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479833
4493	NC_018658	TTCC	2	8	253613	253620	0 %	50 %	0 %	50 %	407479833
4494	NC_018658	GTAT	2	8	253621	253628	25 %	50 %	25 %	0 %	407479833
4495	NC_018658	TGA	2	6	253636	253641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479833
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4497	NC_018658	CCCAG	2	10	253769	253778	20 %	0 %	20 %	60 %	407479833
4498	NC_018658	TTG	2	6	253783	253788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479833
4499	NC_018658	TGC	2	6	253870	253875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479833
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