MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	TGGGA	2	10	786	795	20 %	20 %	60 %	0 %	410480054
2	NC_018654	CAGAG	2	10	3016	3025	40 %	0 %	40 %	20 %	410480057
3	NC_018654	AGACC	2	10	3047	3056	40 %	0 %	20 %	40 %	410480057
4	NC_018654	GTTCA	2	10	3223	3232	20 %	40 %	20 %	20 %	410480058
5	NC_018654	CGTAC	2	10	3685	3694	20 %	20 %	20 %	40 %	410480059
6	NC_018654	AGTTT	2	10	6026	6035	20 %	60 %	20 %	0 %	410480062
7	NC_018654	TAAAG	2	10	8598	8607	60 %	20 %	20 %	0 %	410480064
8	NC_018654	CAAAA	2	10	10439	10448	80 %	0 %	0 %	20 %	410480066
9	NC_018654	GGCTG	2	10	13485	13494	0 %	20 %	60 %	20 %	410480072
10	NC_018654	ATTAT	2	10	17871	17880	40 %	60 %	0 %	0 %	410480080
11	NC_018654	TGTTT	2	10	21773	21782	0 %	80 %	20 %	0 %	410480085
12	NC_018654	AACAA	2	10	24097	24106	80 %	0 %	0 %	20 %	410480089
13	NC_018654	CGTGT	2	10	25156	25165	0 %	40 %	40 %	20 %	410480089
14	NC_018654	GGCAA	2	10	25331	25340	40 %	0 %	40 %	20 %	410480089
15	NC_018654	TTTTA	2	10	33794	33803	20 %	80 %	0 %	0 %	410480094
16	NC_018654	AGAAA	2	10	33863	33872	80 %	0 %	20 %	0 %	410480094
17	NC_018654	ACATA	2	10	36694	36703	60 %	20 %	0 %	20 %	410480097
18	NC_018654	CTGAC	2	10	39272	39281	20 %	20 %	20 %	40 %	410480099
19	NC_018654	ACCGG	2	10	56439	56448	20 %	0 %	40 %	40 %	410480112
20	NC_018654	ACCTG	2	10	57048	57057	20 %	20 %	20 %	40 %	410480112
21	NC_018654	TCTGG	2	10	57385	57394	0 %	40 %	40 %	20 %	410480114
22	NC_018654	TCCGG	2	10	60603	60612	0 %	20 %	40 %	40 %	410480119
23	NC_018654	ACATC	2	10	61079	61088	40 %	20 %	0 %	40 %	410480119
24	NC_018654	CGTTC	2	10	61551	61560	0 %	40 %	20 %	40 %	410480120
25	NC_018654	CGACA	2	10	71999	72008	40 %	0 %	20 %	40 %	410480135

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.